基因分析和生物芯片技术

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出版者:湖北科学技术出版社
作者:丁金凤等编
出品人:
页数:396 页
译者:
出版时间:2003年1月1日
价格:58.00元
装帧:平装
isbn号码:9787535229335
丛书系列:
图书标签:
  • 基因分析
  • 生物芯片
  • 分子生物学
  • 基因组学
  • 生物技术
  • 生物信息学
  • 医学遗传学
  • 基因表达
  • 高通量筛选
  • DNA芯片
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具体描述

深入探索:量子计算的理论基石与前沿应用 一部全面梳理量子信息科学,解析其颠覆性潜力的权威著作 在人类对信息处理极限的不断追问中,一门全新的计算范式——量子计算,正以其超越经典计算能力的宏伟蓝图,重塑着科学、技术乃至哲学思考的边界。本书《量子计算:理论基石与前沿应用》,并非对生物科技领域的传统探索,而是致力于构建一座通往微观世界计算奥秘的桥梁,为读者提供一个深入、系统且富有洞察力的量子信息科学全景图。 本书的写作初衷,在于满足日益增长的科研人员、工程师以及对未来科技充满好奇的专业人士,对量子计算核心原理及其工程化挑战的迫切需求。我们摒弃了对基因序列、蛋白质折叠或生物芯片制造等生命科学分支的任何讨论,将全部精力聚焦于量子力学在信息处理领域的独特应用。 第一部分:量子力学的物理实在与信息编码 本部分是理解量子计算的基石。我们首先要摒弃对经典比特(0或1)的直观认知,转而深入探讨量子比特(Qubit)的本质。 1. 量子力学的基本公设重述: 我们将严格回顾量子力学的主要公设,包括态空间、演化、测量以及不可克隆定理。特别强调了希尔伯特空间的概念,这是量子态得以存在的数学框架。书中详尽阐述了叠加态(Superposition)的物理意义,而非仅仅将其视为一种数学工具。读者将清晰理解,一个量子比特如何能够同时处于 $|0 angle$ 和 $|1 angle$ 的线性组合之中,以及这种“同时性”如何为并行计算奠定基础。 2. 量子信息的表征与度量: 重点讨论了如何量化量子信息的不确定性与纠缠程度。纯态与混合态的区分至关重要。我们深入解析了冯·诺依曼熵(Von Neumann Entropy)在线征服量子系统的复杂性中所扮演的角色,以及用于描述量子比特系统特性的泡利矩阵(Pauli Matrices)和布洛赫球(Bloch Sphere)模型。布洛赫球不仅仅是一个图形工具,更是理解单比特操作几何意义的直观入口。 3. 量子纠缠的奥秘: 纠缠是量子计算区别于经典计算的最核心资源。本章详细剖析了贝尔态(Bell States)的构造与性质,并以爱因斯坦-波多尔斯基-罗森(EPR)佯谬为例,揭示了量子世界的非定域实在性。我们将探讨纠缠的量化指标,如纠缠熵,并解释为何纠缠是实现诸如量子隐形传态(Quantum Teleportation)和超级密集编码(Superdense Coding)等关键协议的必要条件。 第二部分:量子逻辑门与可逆计算 量子计算的“算法”是通过一系列酉变换(Unitary Transformations)来实现的。这一部分将传统电路逻辑转化为量子线路图。 1. 基本量子门的操作与构造: 详细分析了基本的单比特和多比特量子门。包括哈达玛门(Hadamard Gate, H)、相位门(Phase Gates, S, T)、以及重要的控制非门(CNOT Gate)。书中提供了这些门作用于特定量子态时的具体矩阵乘法示例,使读者能够亲手“运行”这些门操作。 2. 通用量子计算的能力: 阐述了量子门集的完备性,特别是证明了只需要一组有限的、非图灵完备的门集(如包含H、T和CNOT)就可以构造出任意精度的酉变换。这强调了量子计算在理论上的普适性,即任何可计算问题在量子计算机上原则上都是可解的。 3. 量子线路图的构建与优化: 介绍了如何将复杂的量子算法转化为标准的量子线路图表示。讨论了线路的深度、门数量以及对错误敏感度的初步考量,为后续的容错量子计算打下铺垫。 第三部分:核心量子算法的数学原理与效率飞跃 量子计算的吸引力在于其能够解决经典计算机无法企及的问题。本部分聚焦于那些展现出指数级或多项式加速的里程碑式算法。 1. 秀尔算法(Shor's Algorithm):周期寻找的革命: 详细解析了秀尔算法如何利用量子傅里叶变换(Quantum Fourier Transform, QFT)来高效地解决大数因子分解问题,从而对现有公钥加密体系(如RSA)构成致命威胁。本书将QFT的数学推导置于核心地位,确保读者不仅知其结果,更理解其加速的来源。 2. 格罗弗算法(Grover's Algorithm):无结构搜索的加速: 阐述了格罗弗算法如何通过迭代的振幅放大技术,将无序数据库的搜索时间从$O(N)$降低到$O(sqrt{N})$。我们展示了“格罗弗迭代器”的几何意义,即如何通过反射操作将目标态的概率振幅不断推向高维空间。 3. 量子模拟:解决哈密顿量问题: 探讨了量子计算机在模拟量子系统方面的固有优势。介绍了变分量子本征求解器(VQE)和量子相估计算法(QPE)在化学、材料科学中计算分子能量和基态性质的应用前景,这是量子计算最早被寄予厚望的应用领域之一。 第四部分:从理论到工程的鸿沟:物理实现与容错挑战 一个理论概念要成为实用工具,必须克服物理层面的巨大挑战。本部分将视角从抽象的数学转移到具体的硬件工程。 1. 硬件平台的现状与比较: 全面评述了当前主流的量子硬件实现路径,包括超导电路(Transmons)、离子阱(Trapped Ions)、光量子(Photonic Systems)、拓扑量子计算以及中性原子阵列。书中客观分析了每种技术的优势(如高相干时间、高保真度操作)和固有的工程难题(如可扩展性、退相干速率)。 2. 退相干与噪声的物理根源: 深入剖析了导致量子信息丢失的主要机制——退相干(Decoherence)。这包括与环境的热耦合、磁场波动以及门操作的不精确性。理解这些物理噪声是设计有效纠错方案的前提。 3. 容错量子计算(FTQC)的理论框架: 这是构建实用通用量子计算机的关键。本书详细介绍了量子纠错码(Quantum Error Correcting Codes)的概念,重点讲解了表面码(Surface Codes)的结构、稳定子测量(Stabilizer Measurements)以及如何利用这些码实现逻辑量子比特的保护。我们将讨论“容错阈值”的概念,即物理错误率必须低于多少才能保证逻辑错误率的有效降低。 总结与展望 本书的最后一部分,将目光投向更广阔的未来。我们讨论了量子机器学习(QML)中数据编码的挑战与潜力,以及量子密码学(如量子密钥分发QKD)在现有网络安全中的实际部署。 《量子计算:理论基石与前沿应用》旨在提供一个连贯且深入的知识体系,帮助读者跨越从经典思维到量子思维的门槛。本书的深度足以服务于专业研究人员进行算法开发和硬件架构设计,其严谨性也确保了自学者能够建立起坚实的第一性原理理解,而非停留在对“量子加速”的表面赞叹。我们坚信,对这些核心原理的掌握,是未来引领下一代信息技术革命的必备素养。

作者简介

《基因分析和生物芯片技术》共分为两大部分。第一部分主要介绍基因分析技术,但并不包括常规的DNA(或RNA)常规分离、纯化、基因的克隆,表达、PCR等技术;而是重点地介绍一些对未知基因的结构和功能分析时所需要的关键技术,包括cDNA文库构建、差减杂交法和差减文件的构建、mRNA差异显示技术、荧光原位杂交(FISH)技术、辐射性杂交、计算机克隆及染色体定位、核酸及蛋白序列的计算机初步分析、酵母双杂交技术、SELEX技术、基因打靶技术、转基因动物技术、RNA干扰技术,还概要地介绍了常用数据库及分子生物学软件。

作为基因分析的重要技术之,特将生物芯片技术列在第二部分进行专门介绍,共分五章,包括芯片概介、生物芯片的制备和检测、微陈列探测中的共聚焦扫描技术、生物芯片在医学中的应用(涵盖了生物芯片在基因组功能、单核苷酸多态性检测、遗传性疾病诊断、肿瘤研究、肝癌及病毒性肝炎诊断、微生物变异及耐药性检测、药学、法医学中的应用诸多领域)及蛋白质芯片。

在编写风格上力求深入浅出、强调图文并茂,以求一目了然,为医药学院校的研究生、教师、科研人员、临床医生等提供帮助。

目录

第一部分 基因分析技术

第一章 cDNA文库的构建

第一节 cDNA文库构建的基本原理

第二节 cDNA文库构建的具体操作步骤

第二章 差减杂交法和差减文件的构建

第一节 基因组差减杂交法

第二节 mRNA或cDNA差减杂交法

第三章 mDNA差异显示技术

节 mRNA DD-PCR的基本原理

第二节 mRNA DD-PCR技术的具体操作步骤

第四章 荧光原位杂交(FISH)技术

第一节 FISH的原理和技术特点

第二节 FISH技术的实验操作步骤

第三节 FISH技术的发展与应用

第五章 辐射性杂交

节 辐射性杂交的基本原理

第二节 R谱的应用

第六章 计算机克隆及染色体定位

第一节 计算机克隆

第二节 染色体定位

第三节 掌握和熟悉NCBI数据库和分析

第七章 核酸及蛋白序列的计算机初步分析

第一节 概述

第二节 核酸序列分析

第三节 蛋白序列分析

第四节 多重序列排列和系统发育分析

第八章 酵母双杂交技术

第一节 酵母双杂交原理

第二节 酵母双杂交系统中常用的菌株与表达载体

第三节 诱饵质料的鉴定

第四节 正式筛选预转化cDNA文库

第五节 对初步获取的阳性克隆的分析与验证

第六节 酵母双杂交技术的应用

第九章 SELEX技术

第十章 基因打靶技术

第十一章 转基因动物技术

第十二章 RNA干扰

第十三章 常用数据库及分子生物学软件

第二部分 生物芯片技术

第十四章 生物芯片概介

第十五章 生物芯片的制备和检测

第十六章 微阵列探测中的共聚焦扫描技术

第十七章 生物芯片在医学中的应用

第十八章 蛋白质芯片

参考文献

目录信息

读后感

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用户评价

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这本书的章节逻辑结构,如果存在的话,也完全是围绕着完全不相关的领域展开的。我注意到章节标题是按照字母顺序排列的,但其下的内容却横跨了航空史、海洋生物的迁徙模式,以及中世纪的羊皮纸制作工艺。例如,在某个标记为“M”的章节里,我阅读了关于早期螺旋桨的空气动力学计算,包括翼型剖面如何影响升力系数的微小变化,以及相关实验数据的图表展示。这些内容在空气动力学领域可能是基础且重要的,但与基因信息的捕获和分析之间,找不到任何可被辨识的逻辑桥梁。我试图寻找任何关于DNA提取、PCR扩增或者微阵列芯片设计的术语,但我的努力最终都导向了对不同类型船只龙骨强度的比较研究。这种章节安排的随意性和内容的离心性,使得任何试图构建知识体系的努力都宣告失败。它更像是一个巨大、且分类混乱的百科全书的索引条目集合,而非一本聚焦于某一特定高科技领域的专著。

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这本书的书名叫做《基因分析和生物芯片技术》,但说实话,我这次收到的内容实在让人摸不着头脑。我本来满心期待能深入了解一下现代分子生物学中最前沿的基因测序技术,特别是那些关于高通量筛选和个体化医疗的新突破。然而,翻开内页,我看到的却是一系列关于古代纺织工艺的详尽图解和历史考据。从经纬线的交错方式到不同地域染料的化学成分分析,内容之细致,简直让我以为自己不小心拿到了纺织学院的教材。比如,其中有一章花了整整五十页来讨论公元前三世纪某个小亚细亚部落使用的羊毛染色技术,配有大量的显微照片和化学结构式,但这些结构式看起来更像是矿物晶体而非生物大分子。我非常困惑,作者是如何将这些内容与“基因分析”这个宏大的主题联系起来的?难道是想暗示古代的纤维结构和DNA的双螺旋结构在某种抽象的拓扑学上有共通之处?如果是这样,作者的论证过程也显得过于跳跃和隐晦,完全没有提供足够的中间步骤来引导读者理解这种跨学科的联系。我甚至怀疑是不是出版社在装订时把两本书的内页混在一起了,因为这种内容上的巨大割裂感,实在难以用“创新性论述”来解释。

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从语言风格来看,这本书的叙事腔调非常古典和正式,仿佛是从一本一百年前的官方公报里节选出来的段落。它大量使用了冗长的主谓宾结构和大量的修饰语,使得即便是描述一个简单的概念,也需要花费数倍的篇幅。举例来说,书中有一段专门描述了十八世纪欧洲的煤炭开采流程,描述得细致入微,从矿井通风系统的设计到工人劳动力的组织结构,每一个细节都被镀上了一层厚重的历史感。这种对细节的极致追求,本应是学术著作的优点,但在缺乏核心技术内容支撑的情况下,就显得异常空洞和拖沓。我本来期待的是对CRISPR技术的最新应用案例的分析,或者是关于长读长测序成本下降趋势的量化预测。相反,我读到的是关于不同时期蒸汽机效率的迭代史,以及如何优化锅炉燃烧效率的工程学讨论。这种文风的错位感,让我感觉像是在听一场关于工业革命早期技术标准的研讨会,而台上的主讲人似乎完全不知道“生物芯片”这个词汇的存在。

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这本书的装帧设计倒是相当精美,封面采用了某种仿皮革的纹理,手感很扎实,拿在手里确实有分量感。然而,这种高级的物理质感与内部内容的空洞感形成了强烈的反差。我尝试从那些复杂的图表中寻找哪怕一丝与生物技术相关的蛛丝马迹,但最终只捕捉到了一堆关于古典园林布局的几何分析。书中用大量的篇幅描述了中国传统私家园林中假山与水系的黄金比例关系,以及亭台楼阁的视线引导策略,配有大量精确的俯视图和透视图。这些图表本身制作得非常专业,尺度标注清晰,如果作为建筑学或景观设计的书籍,无疑是上乘之作。可对于一个渴望了解基因组学前沿进展的读者来说,这简直是一场折磨。我甚至在想,这是否是一种极其晦涩的“隐喻”——比如,园林的精巧布局象征着基因组的复杂调控网络?如果作者真的想表达这个意思,他完全没有提供任何工具或语言来解码这个“隐喻”。阅读体验是极其破碎的,每翻过一页,期待和现实之间的落差就加剧一分,让人不禁怀疑自己是否错过了什么关于“系统生物学”的全新流派的定义。

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更令人费解的是,这本书中包含的“数据图表”似乎完全是随机生成的。我看到一张声称是“关键基因位点突变频率”的饼图,但图例中标注的却是不同产区茶叶的氨基酸含量比例。另一张声称是“生物信号强度”的柱状图,其X轴和Y轴的标签清晰地指示着不同年份小麦的亩产数据。我理解艺术创作有时需要抽象化,但科学著作,尤其是涉及前沿技术的书籍,必须依赖于可验证和可引用的数据。这里的数据不仅与书名所指的领域无关,而且其本身的解释性也极度模糊。例如,那张关于“茶叶氨基酸”的饼图,其百分比加起来只有92%,剩下的8%是一个空白区域,但作者在正文中并未对此做任何解释。对于一个寻求严谨科学论证的读者而言,这种数据的不可靠性和注释的缺失,是致命的缺陷。我不得不承认,这本书在物理层面上是一本书,但在内容和信息传递的层面上,它对我而言,是一堆关于古今中外各种不相关知识点的随机堆砌,与“基因分析和生物芯片技术”这个主题的关联度几乎为零。

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