New and Emerging Proteomic Techniques

New and Emerging Proteomic Techniques pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Humana Pr Inc
作者:Nedelkov, Dobrin (EDT)/ Nelson, Randall W. (EDT)
出品人:
页数:248
译者:
出版时间:2006-3
价格:$ 157.07
装帧:HRD
isbn号码:9781588295194
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质组学
  • 蛋白质分析
  • 生物技术
  • 分子生物学
  • 生物化学
  • 新兴技术
  • 实验技术
  • 蛋白质鉴定
  • 质谱分析
  • 生物医学
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具体描述

Leading researchers and innovators describe in step-by-step detail the latest techniques that promise to significantly impact the practice of proteomics, as well as its success in developing novel clinical agents. The methods span the entire spectrum of top-down and bottom-up approaches, including microarrays, gels, chromatography, and affinity separations, and address every aspect of the human proteome, both quantitatively and qualitatively. The techniques of protein detection utilized are diverse and range from fluorescence and resonance light scattering to surface plasmon resonance and mass spectrometry. The protocols follow the successful Methods in Molecular Biology(t) series format, each offering step-by-step laboratory instructions, an introduction outlining the principles behind the technique, lists of the necessary equipment and reagents, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

现代分子生物学前沿技术:从基因组到蛋白质组的解析之路 作者: 史密斯·J. K., 约翰逊·A. R., 陈·L. M. 出版社: 科学前沿出版社 出版年份: 2023年 页数: 890页 定价: 499元 --- 内容简介 《现代分子生物学前沿技术:从基因组到蛋白质组的解析之路》是一部全面深入介绍当前生命科学研究中核心技术和新兴方法的综合性专著。本书旨在为分子生物学家、生物化学家、生物信息学专家以及相关领域的研究生和高年级本科生提供一个结构清晰、内容详实的参考指南,涵盖了从基因组学、转录组学到代谢组学等多个层面的先进技术体系。本书的独特之处在于,它不仅详细阐述了经典技术的原理和操作流程,更聚焦于近五年内涌现出的突破性技术平台,特别是那些极大地提升了研究效率和分辨率的创新工具。 本书共分为六大部分,三十个章节,逻辑严谨,层层递进。 第一部分:基因组学与宏基因组学的深度解析 本部分着重探讨了新一代测序技术(NGS)的最新进展及其在复杂基因组分析中的应用。 第一章:高通量测序的平台革新: 详细对比了Illumina、PacBio HiFi以及Oxford Nanopore Technologies(ONT)的长读长测序在覆盖度、错误率和读长方面的性能差异。重点分析了ONT技术在解析重复序列和结构变异(SV)中的独特优势及其在实际项目中的数据处理流程。 第二章:单细胞基因组与外显子组分析: 深入阐述了从细胞捕获到文库构建的全流程技术,包括微流控技术(如Droplet-based和Well-based系统)如何实现对数百万个单细胞的基因组DNA进行高通量测序。讨论了如何通过单细胞全基因组测序(scWGS)来解析肿瘤异质性及胚胎发育中的基因组重排事件。 第三章:空间基因组学: 介绍了将基因组信息与细胞空间位置相结合的突破性技术,如in situ测序(ISS)和MERFISH。通过详细的案例分析,展示了如何绘制组织切片中数千个基因的表达图谱,并将其与组织微环境进行关联分析。 第四章:宏基因组学的新范式: 侧重于环境和临床样本中微生物群落的无培养组学分析。涵盖了从样本制备、DNA提取优化到宏基因组组装和功能注释的最新算法和数据库,特别是针对低丰度物种的捕获策略。 第二部分:转录组学的精细调控研究 本部分聚焦于RNA分子多样性和功能调控的研究工具,超越了传统的总RNA测序。 第五章:全景式转录本分析: 详细介绍了不同形式的RNA测序(mRNA-Seq, small RNA-Seq, lncRNA-Seq)在流程、数据分析和结果解读上的侧重点。着重讨论了如何利用比对算法处理复杂的剪接异构体数据。 第六章:单细胞转录组(scRNA-seq)的进阶应用: 深入探讨了scRNA-seq在细胞分群、拟时间序列分析和细胞间通讯建模中的应用。重点讲解了如Seurat和Scanpy等主流分析包的最新版本功能,以及如何有效校正批次效应。 第七章:RNA表观遗传学与修饰检测: 介绍了对RNA分子进行化学修饰(如m6A, m5C)检测的技术,包括MeRIP-seq、Bismark的改进应用,以及如何结合CRISPR系统进行靶向性修饰研究。 第八章:空间转录组学的定量方法: 探讨了Visium、Slide-seq等空间组学技术,着重于如何将二维空间信息与基因表达数据进行整合,以及利用计算方法重建三维组织结构中的基因表达梯度。 第三部分:蛋白质组学的革命性进展(非本书核心主题,仅作背景铺垫) 本部分简要概述了蛋白质组学的基础,强调其与本指南其他部分技术的互补性,但不对具体技术细节做深入展开。 第九章:质谱技术的演进概览: 对高分辨率质谱仪(如Orbitrap Fusion Lumos)在肽段鉴定和定量中的基础应用进行简要回顾。 第四部分:代谢组学与生物信息学交叉前沿 本部分探讨了小分子代谢物分析的技术和计算整合策略。 第十章:代谢物分离与检测技术: 比较了气相色谱-质谱(GC-MS)和液相色谱-质谱(LC-MS)在分析极性、挥发性代谢物方面的优劣,并讨论了核磁共振波谱(NMR)在结构确证中的不可替代性。 第十一章:靶向与非靶向代谢组学数据处理: 详细介绍了代谢物图谱的校正、归一化、差异分析以及代谢通路富集分析的方法。强调了代谢组学数据中“缺失值”的处理策略。 第十二章:多组学数据整合的计算框架: 这一章节是本书的亮点之一。系统介绍了如何利用网络分析、多维尺度缩放(MDS)和深度学习方法,将基因组、转录组和代谢组的数据集进行系统性融合,以发现跨层次的生物标志物。讨论了多组学数据整合中信息权重分配的难题。 第五部分:高通量功能验证与系统生物学工具 本部分关注如何利用基因工程和高通量筛选技术来验证前述组学研究发现的生物学功能。 第十三章:新一代基因编辑系统: 聚焦于CRISPR/Cas9及其衍生工具(如Base Editing, Prime Editing)在哺乳动物细胞、模式生物中的应用优化。讨论了提高脱靶效应控制率的最新策略和体内递送系统的改进。 第十四章:高内涵筛选(HCS)与自动化成像: 介绍了自动化显微成像平台(High-Content Screening)如何实现对细胞形态、蛋白质定位和核酸分布的数百万次并行定量分析。 第十五章:合成生物学与通路重构: 探讨了利用基因线路设计和细胞工厂构建技术,将生物学知识转化为可预测和可编程的系统。 第六部分:数据管理、质量控制与标准化 第十六章:组学数据标准与可重复性挑战: 讨论了 FAIR 原则在组学数据共享中的实践,以及如何通过严格的质量控制(QC)流程来保证实验结果的可靠性。重点分析了数据偏差的来源(技术和生物学)及其量化方法。 第十七章:生物信息学工作流的构建与优化: 提供了构建可复现、可扩展的组学分析管道(Pipeline)的最佳实践,涵盖了云计算资源的管理和容器化技术(如Docker/Singularity)在生命科学计算中的应用。 --- 目标读者与本书价值 本书的深度和广度使其成为生命科学研究人员不可或缺的工具书。它超越了对单一技术的简单描述,而是着眼于技术间的协同作用和数据整合的能力。对于希望从“数据生成”阶段迈向“系统理解”阶段的研究人员,本书提供了必要的理论基础和实战指导。它强调了实验设计与计算分析的紧密结合,是指导下一代精准医学和基础生命科学研究的权威参考。 关键词: 基因组学, 单细胞技术, 空间组学, 转录组分析, 多组学整合, 生物信息学, 高通量筛选, 基因编辑, 代谢组学。

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