Plant Proteomics

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出版者:Humana Pr Inc
作者:Thiellement, Herve (EDT)/ Zivy, Michel (EDT)/ Damerval, Catherine (EDT)/ Mechin, Valerie (EDT)
出品人:
页数:399
译者:
出版时间:
价格:125
装帧:HRD
isbn号码:9781588296351
丛书系列:
图书标签:
  • Proteomics
  • Plant Biology
  • Plant Physiology
  • Molecular Biology
  • Biotechnology
  • Plant Science
  • Protein Analysis
  • Mass Spectrometry
  • Genomics
  • Post-translational Modification
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具体描述

好的,以下是一本名为《Plant Proteomics》的书籍的详细简介,严格按照您的要求,不包含该书的内容,不使用AI痕迹的语言,字数约1500字。 --- 《植物蛋白质组学导论:从基础到前沿应用》 本书概述 《植物蛋白质组学导论:从基础到前沿应用》是一部全面、深入探讨植物蛋白质组学领域前沿进展的专著。本书旨在为生命科学、植物科学、生物技术以及相关交叉学科的研究人员、研究生和高级本科生提供一个系统性的知识框架,帮助他们理解蛋白质组学在现代植物生物学研究中的核心作用及其应用潜力。 本书的编写基于对该领域数十年积累的理论知识和最新实验技术的梳理与整合。它不仅涵盖了蛋白质组学研究的基本原理和技术路线,更着重于介绍如何将这些技术应用于复杂的植物生命系统,以揭示其分子机制、生理功能以及对环境胁迫的响应。 第一部分:蛋白质组学基础与理论框架 本部分奠定了理解植物蛋白质组学研究的理论基石。 第一章:蛋白质组学的核心概念与历史沿革 本章首先界定了蛋白质组学的概念,将其置于基因组学、转录组学等“组学”学科的背景之下。我们追溯了蛋白质组学从早期二维电泳(2-DE)到高分辨率质谱分析的演进历程。重点讨论了蛋白质组学与传统生物化学研究范式的本质区别,强调了其对生物体在特定时间点、特定条件下蛋白质表达全貌的描绘能力。本章深入探讨了“蛋白质组”的动态性、多样性以及复杂性,为后续章节的技术介绍提供了理论支撑。 第二章:植物基因组与蛋白质组的映射关系 理解蛋白质的产生源于基因的表达是至关重要的。本章详细阐述了从植物基因组序列信息到实际蛋白质分子产出的过程,特别是针对植物特有的翻译后修饰(PTMs)和可变剪接现象,这些复杂过程极大地丰富了蛋白质组的多样性。本章还讨论了基因表达调控网络在蛋白质丰度、亚细胞定位和功能激活中的关键作用,强调了蛋白质组学在验证和扩展基因功能预测方面的独特价值。 第三部分:核心技术与方法学 本部分聚焦于支撑现代植物蛋白质组学研究的关键技术,从样本制备到数据分析的完整流程。 第三章:植物样品采集、提取与纯化 高效、无偏差地提取植物组织中的蛋白质是准确进行蛋白质组学分析的前提。本章详细介绍了针对不同植物组织(如叶片、根系、花朵、休眠种子)的优化样品处理方案。内容包括细胞壁的有效去除、蛋白酶活性的抑制、去污染技术(如酚/氯仿沉淀、盐析法)的应用,以及利用亲和层析技术对特定蛋白家族进行富集和初步纯化的策略。本章强调了在处理植物细胞复杂基质时的技术考量。 第四章:定性与定量分析的核心技术:质谱法 质谱技术是现代蛋白质组学的“心脏”。本章系统介绍了液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)在植物蛋白质组学中的应用。深入解析了数据依赖采集(DDA)和数据非依赖采集(DIA)两种主要采集模式的原理、优缺点及其在植物功能基因组研究中的适用场景。此外,本章还详细描述了蛋白质的酶解(通常使用胰蛋白酶或赖氨酸-C)、肽段分离(如使用纳米LC)以及质谱仪器的基本操作和校准方法。 第五章:蛋白质组学的数据处理与生物信息学分析 海量的质谱原始数据需要经过严谨的生物信息学处理才能转化为具有生物学意义的结果。本章详述了数据处理流程,包括谱图匹配算法(如SEQUEST, MASCOT, MaxQuant)的应用,数据库选择(如TAIR, Phytozome等植物特异性数据库)的策略,以及错误率的控制(如FDR阈值设定)。随后,本章重点介绍了如何进行差异表达蛋白质的鉴定、功能注释(GO、KEGG通路分析)以及蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIs)的构建和可视化。 第三部分:前沿应用领域 本部分将理论和技术应用于具体的植物科学研究前沿。 第六章:环境胁迫下的植物蛋白质组响应 植物在面对非生物胁迫(如干旱、盐碱、高温、低温)和生物胁迫(如病原菌、虫害)时,必须快速调控其蛋白质表达水平以适应环境变化。本章探讨了如何利用时间序列蛋白质组学方法追踪关键胁迫信号转导通路中的蛋白质动态变化。详细分析了胁迫响应中涉及的氧化还原调节蛋白、热休克蛋白以及激素信号网络蛋白的功能重塑。 第七章:植物发育与代谢调控的蛋白质组学视角 从种子萌发到开花结果,植物的生命周期是一个高度程序化的过程。本章聚焦于蛋白质组学在解析关键发育节点的应用,例如花器官的形成、果实的成熟以及衰老过程。特别强调了代谢相关酶的蛋白质组学分析,用以揭示植物次级代谢产物(如生物碱、萜类化合物)合成途径中关键限速酶的表达调控机制。 第八章:亚细胞定位与翻译后修饰(PTMs)的深度剖析 蛋白质的准确功能依赖于其在细胞内的精确位置和修饰状态。本章详细介绍了亚细胞分离技术,如线粒体、叶绿体和细胞核的纯化,以及利用靶向蛋白质组学方法确定蛋白质在这些结构中的归属。此外,本章深入探讨了磷酸化、糖基化、泛素化等关键PTMs如何作为分子开关,实时调控蛋白质的活性、稳定性及相互作用。 第九章:蛋白质组学在作物改良中的展望 本章探讨了蛋白质组学如何服务于现代农业和育种实践。通过比较优良品种与普通品种的蛋白质组差异,可以精确定位提高作物产量、营养品质(如维生素、必需氨基酸含量)或增强抗逆性的关键蛋白质靶点。本章还讨论了代谢工程和合成生物学如何利用蛋白质组学数据指导基因编辑和通路重构策略的实施,以期构建具有特定功能的工程化植物系统。 总结与展望 全书的最后一部分对当前植物蛋白质组学面临的挑战进行了总结,例如如何有效处理低丰度蛋白、如何提高数据可重复性和整合多组学数据的能力。同时,本书对未来发展趋势进行了预测,包括单细胞蛋白质组学在植物组织中的潜力、空间蛋白质组学的兴起,以及人工智能在加速蛋白质功能预测方面的应用前景,旨在激励下一代研究人员在该领域持续探索和创新。

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