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出版者:Blackwell Pub Professional

作者:Finnie, Christine 编

出品人:

页数:272

译者:

出版时间:2006-8

价格:$ 249.95

装帧:HRD

isbn号码:9781405144292

丛书系列:

图书标签:

• Proteomics
• Plant Biology
• Plant Physiology
• Molecular Biology
• Biotechnology
• Plant Science
• Protein Analysis
• Mass Spectrometry
• Genomics
• Post-translational Modification

好的，以下是一本名为《Plant Proteomics》的图书的详细内容简介，着重于其涵盖的各个方面，但不包含任何关于“Plant Proteomics”这本书本身不存在的内容： --- 图书名称：植物蛋白质组学：理论、技术与应用 导言：探索植物生命活动的分子引擎 植物蛋白质组学，作为一门快速发展的交叉学科，正以前所未有的深度揭示生命体中最核心的功能执行者——蛋白质。与研究基因组和转录组不同，蛋白质组学直接聚焦于细胞在特定环境和生理状态下实际表达的蛋白质集合。对于植物科学而言，理解蛋白质的功能、丰度、修饰和相互作用，是解析生命过程、应对环境挑战和提升农业生产力的关键。 本书旨在为植物生物学家、生物化学家、分子遗传学家以及对蛋白质组学技术感兴趣的研究人员，提供一个全面而深入的指南，涵盖从基础理论构建到尖端技术应用的完整知识体系。全书结构严谨，逻辑清晰，力求在理论深度与实验操作可行性之间达成完美的平衡。 --- 第一部分：植物蛋白质组学的理论基础与前沿视角 本部分奠定了理解植物蛋白质组学的理论框架，探讨了蛋白质在植物生命活动中的独特角色及其研究的复杂性。 第一章：蛋白质组学的基本概念与演进 本章首先界定蛋白质组学的核心概念，区分了“表达性蛋白质组学”、“差异性蛋白质组学”和“功能性蛋白质组学”。重点阐述了植物蛋白质组学研究的特殊挑战，例如植物细胞壁的复杂性、细胞内区室化（线粒体、叶绿体、细胞核）的精细分离需求，以及植物对复杂多样的环境因子（光照、温度、干旱、病原体）响应产生的快速动态变化。 第二章：蛋白质的结构、功能与翻译后修饰（PTMs） 深入探讨蛋白质的一级、二级、三级和四级结构如何决定其生物学功能。特别关注植物特有的翻译后修饰（PTMs），如磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化和硝化。这些修饰是植物进行信号传导和快速适应环境变化的主要调控手段，理解PTMs的动态变化对于解析生命活动至关重要。 第三章：植物发育与环境响应的蛋白质组学视角 本章将理论与实际应用相结合，探讨如何运用蛋白质组学技术来剖析关键的植物学过程：种子萌发、营养生长、开花诱导、衰老凋亡，以及植物如何通过蛋白质水平的快速重塑来应对非生物胁迫（如盐碱、极端温度）和生物胁迫（如真菌、细菌和病毒感染）。 --- 第二部分：核心技术：从样本制备到质谱分析 这是本书的实践核心部分，详细介绍了现代植物蛋白质组学研究所需的一系列精密技术流程，确保研究者能够系统性地设计和执行实验。 第四章：植物蛋白质组学样本的提取与纯化 高质量的样本是成功分析的前提。本章详述了针对不同植物组织（叶片、根、花、种子）的裂解方法，包括机械法、化学裂解法和酶解法。重点讨论了如何克服植物细胞壁的干扰，以及如何针对特定细胞器（如叶绿体和线粒体）进行高效、无交叉污染的差异化提取。此外，还介绍了利用亲和层析、离子交换层析等技术进行初步蛋白质组分的分离纯化。 第五章：二维电泳（2-DE）技术的精细分离 尽管质谱技术占据主导地位，但2-DE仍是蛋白质组学分析的经典分离工具。本章详细介绍了等电聚焦（IEF）的优化参数、凝胶的制备与染色技术，以及如何通过2-DE进行蛋白质点的差异表达分析，特别是针对低丰度蛋白质的优化策略。 第六章：液相色谱分离技术在蛋白质组学中的应用 本章聚焦于高分辨率液相色谱（LC）技术，这是与质谱联用的关键前体分离步骤。涵盖了反相色谱（RP-LC）、亲水作用色谱（HILIC）和尺寸排阻色谱（SEC）在蛋白质和肽段分离中的应用，并讨论了高效液相色谱（HPLC）和超高效液相色谱（UPLC）的参数设置与优化。 第七章：质谱技术：从“鸟枪法”到靶向分析 这是现代蛋白质组学的核心技术。详细介绍串联质谱（MS/MS）的工作原理，包括离子源（ESI, MALDI）的选择。重点阐述了数据依赖采集（DDA）和数据非依赖采集（DIA）的策略，以及它们在植物蛋白质组学中的优劣势。对于特定蛋白质的精确量化，本章也介绍了靶向蛋白质组学方法，如基于同位素标记的SILAC、TMT和iTRAQ技术。 --- 第三部分：数据解析与功能注释 蛋白质组学实验产生海量数据，本部分着重于如何将原始的质谱数据转化为具有生物学意义的结论。 第八章：蛋白质组学数据处理与鉴定 介绍从原始质谱数据（.raw文件）到鉴定蛋白质列表的完整流程。详述了数据库搜索算法（如MASCOT, Sequest, MaxQuant）的应用，并讨论了如何设定和评估统计学显著性（如FDR控制）。重点讲解了“从头测序”（De Novo Sequencing）在处理非模式植物或新物种时的重要性。 第九章：生物信息学工具与功能注释 数据鉴定后，必须进行功能注释。本章介绍GO（Gene Ontology）分类、KEGG通路富集分析、以及蛋白质相互作用网络（PPI）构建工具。讨论如何利用比较蛋白质组学数据来推断植物在特定环境胁迫下的信号转导路径和代谢重编程。 第十章：交叉学科整合：蛋白质组学与组学数据的整合分析 成功的植物生物学研究往往需要多组学数据的协同验证。本章探讨了如何将蛋白质组学数据与转录组学（mRNA丰度）、磷酸化蛋白质组学以及代谢组学数据进行整合分析（Multi-omics Integration），以构建更完整、更可靠的植物分子调控图谱。 --- 第四部分：应用前沿：解决农业与生态学难题 本部分展示了蛋白质组学在解决现实世界植物科学问题中的实际案例和巨大潜力。 第十一章：作物改良中的蛋白质组学工具 探讨如何利用蛋白质组学手段识别提高作物产量、品质（如营养成分、抗氧化剂含量）和抗逆性（抗病虫害、耐逆境）的关键蛋白质标记物。例如，在分子育种中，快速筛选具有理想蛋白质表达模式的种质资源。 第十二章：植物-微生物相互作用的蛋白质组学研究 深入解析根际微生物、有益菌和致病菌与宿主植物之间的分子对话。通过分析植物分泌组和菌根界面蛋白质组，揭示植物如何感知病原体并启动免疫反应，以及如何调控共生关系中的物质交换机制。 结论与展望 总结当前植物蛋白质组学研究的主要成就，并展望未来的发展方向，包括单细胞蛋白质组学在植物组织中的应用、蛋白质组学在代谢工程中的指导作用，以及人工智能（AI）在复杂蛋白质组数据解析中的潜力。 --- 附录：常用植物蛋白质组学数据库与实验SOP 提供权威的蛋白质数据库列表、常用软件操作指南，以及标准化的实验操作流程（SOP），方便研究人员快速上手和复现关键实验步骤。

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