第一辑收经十一种，律三种，论十一种，共二十八册，分装甲乙丙丁四函。卷首为《藏要》总叙，概述经典的要义及收录原则，认为本辑所收，为经律论三藏中「要中之要」。下按原书编号标出所选佛典的译本、卷数和在本辑中的册数：
一、《大般若经·第二分·舍利子般若》，唐·玄奘译，选卷四百一至四百五(第一册)。欧阳渐有《大般若经十六分总叙》及《大般若经第二分品目舍利子般若四品叙》；吕澂有校勘说明。《大般若经·第二分·方便般若》，选卷四百五十九至四百七十八(第二至四册)。欧阳渐有《方便般若二十品目叙》；吕澂有校勘说明。
二、《大般若经·第五分》，选卷五百五十六至五百六十五(第五、六册)。欧阳渐有《大般若经第五分品目叙》；吕澂有校勘说明。
三、《华严经·十地品》，唐·实叉难陀译，选卷三十四至三十九(第七册)。吕澂有校勘说明。
四、《楞伽阿跋多罗宝经》，刘宋·求那跋陀罗译，全四卷(第八册)。吕澂有校勘说明。
五、《大般涅槃经·迦叶品》，北凉·昙无谶译，选卷三十三至三十八(第九册)。吕澂有校勘说明。
六、《解深密经》，唐·玄奘译，全五卷。第十册。欧阳渐有《解深密经品目叙》；吕澂有校勘说明。
七、《大菩萨藏经·般若品》，唐·玄奘译，选卷十六至十九(十一册)。吕澂有校勘说明。
八、《胜鬘师子吼经》，刘宋·求那跋陀罗译，全一卷(十一册)。吕澂有校勘说明。
九、《大宝积经·无量寿会》，唐·菩提流志译，选卷十七、十八(十一册)。吕澂有校勘说明。
十、《妙法莲华经》，后秦·鸠摩罗什译，全七卷。十二、十三册。吕澂有校勘说明。
十一、《杂阿含经·缘起诵》，刘宋·求那跋陀罗译，选卷十一、十二；附《瑜伽师地论》卷九十三、四〈摄事分中契经事缘起食谛界择摄第三之一、二〉(十四册)。吕澂有校勘说明。
以上大乘经十种，小乘经一种。欧阳渐叙选编理由如次：「菩萨乘有正轨，有便道。乘乎正轨又有不易之则曰境行果，依此抉择而得四经：一曰《大般若经》，二曰《华严经》，行菩萨乘有不易之则，一曰因果、二曰差别：因果者，运用之妙，《般若》尽之；差别者，境界不同，《华严》尽之；故《般若》、《华严》者，菩萨正轨之行也。三曰《楞伽经》，古学一百八句，一切自心所现，今学五法、三自性、八识、二无我，知法、知义于此广博，故《楞伽经》者，菩萨正轨之境也。四曰《大涅槃经》，我皆令入涅槃而灭度之，此佛出世大事因缘，对机则四邬柁南，毕竟则常乐我净，见性而已，又多乎哉？是故《大涅槃经》者，菩萨正轨之果也。《解深密经》，境行果三都约其要。《菩萨藏经》，但约行中因果差别。《胜鬘》明识，属隶《楞伽》。《无量寿经》，是方便道；《法华》则经中之楬橥者也。声闻举一，曰《杂阿含》，佛言诸佛世尊具大智力，总摄诸法，安处四种邬柁南中，辗转传来，是名《阿含》，传此四句是名《阿含》，《瑜伽》五分释《杂含》多，大小沟通，《阿含》亦大故也。」
十二、《菩萨戒本》及《菩萨戒羯磨文》，弥勒说，玄奘译(十五册)。吕澂有校勘说明。
十三、《十诵比丘戒本》，鸠摩罗什译；附录「十诵比丘众学法三本类勘表」。《十诵羯磨比丘要用》，刘宋·僧璩依律撰出(十五册)。吕澂有校勘说明。
十四、《善见律毗婆沙·序品》，萧齐僧伽跋陀罗译，选三卷(十五册)。吕澂有校勘说明。
以上大乘律一种，小乘律二种。欧阳渐叙选编理由如次：「律三者，《地持善戒》，译非全文，是故戒本羯磨，应抉《瑜伽》为大乘律。北方小戒，论其圆通，《僧祇》为最；究其严密，《十诵》为尤，《四分》、《五分》及迦叶维，严不及《十诵》，通不及《僧祇》，是故戒本羯磨，唯独取于《十诵》。南方小戒，此土传来，但见《善见律》，录序而已。」
十五、《中论》，青目释，鸠摩罗什译，全四卷(十六册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
十六、《辨中边论》，世亲造，玄奘译，全三卷(十七册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
十七、《大智度论·初品》，龙树造，鸠摩罗什译，选卷一至三十四(十八至二十二册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
十八、《瑜伽师地论·菩萨地》，弥勒说，玄奘译，选卷三十五至五十(二十三、二十四册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
十九、《集论》，无著造，玄奘译，全七卷(二十五册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
二十、《摄大乘论》，无著造，玄奘译，全三卷(十七册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
二十一、《二十唯识论》，世亲造，玄奘译，全一卷(二十五册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
二十二、《成唯识论》，玄奘译，全十卷(二十六、二十七册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
二十三、《因明正理门论》，大域龙造，玄奘译，全一卷(二十五册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
二十四、《品类足论·辩千问品》，世友造，玄奘译，选卷十至十七；附录三种毗昙法门对照表(二十八册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
二十五、《异部宗轮论》，世友造，玄奘译，全一卷(二十八册)。欧阳渐有《叙》；吕澂有校勘说明。
以上大小乘十一种论典，欧阳渐叙选编理由如次：「摩诃衍义，创始于龙树，充量于无著。合之则相圆，分之则义窒，岂空有之或异，实偏依之各详。《中论》谈遍计空，《辩中边论》谈依他有，中之义备也。《大智度论》，释经论中详一切法，而详于对小；《瑜伽师地论》，宗经论中详一切法，而详于自大。龙树毗昙为《智论》，无著毗昙为《集论》，是则乘之事备也。唯识为入道之体，《摄论》创始于其先，《二十唯识》、《成唯识论》昌于其后。因明为拣外之用，而《理门论》者，则又基本之作也。毗昙多种，六《足》为精，《集论》为大乘毗昙之终，《品类足论》为小乘毗昙之始，龙树、无著皆所宗矣。其余部执，则《异部宗轮论》亦足知概。」
第二辑收经八种，律六种，论十三种。卷前有欧阳渐所作本辑总叙，将本辑与第一辑所收经典一一对照比较；并新增吕澂所作《藏要第二辑校例》。
一、《佛说佛母宝德藏般若波罗蜜经》，宋·法贤译，全三卷(一册)。
二、《能断金刚般若波罗蜜多经》，玄奘译，全一卷(一册)。
欧阳渐总叙曰：「般若道场，闻者记录或广或略，或以长行，或以偈颂。一辑于长行略广，五分中撮其大凡；二辑则举《宝德藏经》三十二品偈颂。读者若先颂后长行，此经犹前温陀南；若先长行后颂，此经则后温陀南也。《心经》谈空三昧，是舍利子般若类；《金刚》谈无相三昧，是须菩提般若类也。」
三、《大方广佛华严经·十回向品》，唐·实叉难陀译，选卷二十三至三十三(二、三册)。欧阳渐有《华严经品目叙》，并作本品叙。其卷首总叙曰：「一辑举《华严》根本为〈十地〉，二辑举《华严》临入为〈十向〉，小大、自他、理事，无不资力回向以为转移也。」
四、《大般涅槃经·师子吼菩萨品》，北凉·昙无谶译，选卷二十七至三十二(四册)。欧阳渐有《大涅槃经·师子吼品叙》及《大般涅槃经师子吼科判》。其卷首总叙曰：「一辑《涅槃》，举〈迦叶〉法用；二辑《涅槃》，举〈师吼〉法义，用以示善巧义以示切要也。」
五、《无尽意菩萨经》，刘宋·智严共宝云译，全四卷(五册)。欧阳渐有《叙》。其卷首总叙曰：「《般若》以殊特义，说行中因果义；《无尽意经》则以平等义，说行中因果义也。」
六、《维摩诘所说经》，后秦·鸠摩罗什译，全三卷(五册)。欧阳渐有《叙》及《维摩诘经科文》。其卷首总叙曰：「又《般若》、《华严》诸经，以殊特义说境行果义；而《维摩诘经》，亦以平等义说境行果义也。方便利他，真俗神通，行菩萨行，见十方佛。世俗以之为神奇，大道以之为通途也。」
七、《佛说长阿含经·第一分》，后秦·佛陀耶舍共竺佛念译，选卷一至卷五(六册)。欧阳渐于卷首总叙曰：「《杂含》五诵，深于谈禅；《长含》四分，详于破执。一辑、二辑，都举其初而已。」
八、《法句经》，法救撰，吴·维只难等译，全二卷(六册)。本经与《长阿含经》二部，为小乘经典，欧阳渐于卷首总叙曰：「《法句经》者，要偈多存，古经犹聚。诚根据之有由，而小藏之精要欤！」
九、《四分戒本》(昙无德出)，后秦·佛陀耶舍译，全一卷；附录四分巴利二本众学法对照表(七册)。
十、《弥沙塞五分戒本》，刘宋·佛陀什等译，全一卷(七册)。
十一、《解脱戒经》(出迦叶毗部)，元魏·瞿昙般若流支译，全一卷(七册)。
十二、《根本说一切有部戒经》，唐·义净译，全一卷，附录净译藏译二本众学法对勘表(七册)。
十三、《摩诃僧祇律大比丘戒本》，东晋·佛陀跋陀罗译，全一卷(七册)。
十四、《根本萨婆多部律摄》，胜友集，唐·义净译，全十四卷(八、九册)。
本辑收律部六种，欧阳渐于卷首总叙曰：「一辑所举，《十诵》、《善见》而已。二辑则法藏之《四分》、化地之《五分》、饮光之《解脱》、有部之《戒经》、大众之《僧祇》，无不次第举其戒本，而使八家部执，详略异同，比例研求，堪资取舍，则戒学之大营也。复举有部《律摄》，以四句颂摄戒多事，复叙戒文随事分释。文则视广律为简，义则较广律为繁。研戒之初，莫此为便。又戒学之切要也。」
十五、《十二门论》，龙树造，后秦·鸠摩罗什译，全一卷(十册)。
十六、《百论》，婆薮造，后秦·鸠摩罗什译，全二卷(十册)。
十七、《广百论本》附〈教诫弟子品释〉，圣天造本，护法造释，玄奘译，全二卷(十册)。
十八、《大乘中观释论》，安慧造，宋·惟净等译，全十卷(十一册)。
十九、《究竟一乘宝性论》，元魏·勒那摩提译，全五卷(十二册)。
以上与龙树中观学有关之五部论典，欧阳渐于卷首总叙曰：「龙树《中论》，大小染净，三科十二支，二取二空，赅摄于四百四十六偈，阐扬空义，汪噦大哉。而无以示入德之门，于是抉择《中论》，约为十二以示之门。初三因缘观空，次三相观空，次二生灭变异观空，后四因果作者时生以观空是也。提婆推演《中论》，作瑜伽行四百颂，未能全来，所来者《百论》十品，罪福、神我、一、异、情、尘、因、果、常、空而已。又《广百论》八品，常、我、时、见、根、边、相、诫，为四百颂之后二百颂而已。然外内之论义，既已详尽，《中论》之法门，亦复增多。谈空之义，至矣极矣！虽然，教诫弟子毋恶取空，当留意也。诠释《中论》，此土唯三。青目既举于前，安慧当续于后，故继于《中观释论》也。《宝性论》者，依《陀罗尼自在王经》，以七金刚句摄一切佛法。《自在王经》与《大涅槃经》，均说一切众生皆有佛性。菩提功德，利众生业，皆所以见性。三宝一归，但指不同，初无歧异。然所谓一切空者，见性涅槃是也。上来五论，皆龙树学也。」
二十、《瑜伽师地论·抉择分·五识身相应地·意地》，弥勒说，玄奘译，选卷五十一至五十七(十三册)。
二十一、《大乘庄严经论》，无著造，唐·波罗颇迦罗蜜多罗译，全十三卷(十四、五册)。
二十二、《观所缘论释》，护法造，唐·义净译，全一卷(十六册)。
二十三、《佛地经论》，亲光等造，玄奘译，七卷(十六册)。
二十四、《因明入正理论》，商羯罗主造，玄奘译，一卷(十六册)。
以上与无著、世亲系瑜伽行派有关之五部论典，欧阳渐于卷首总叙曰：「一辑举菩萨行，二辑举菩萨境。五识意地抉择，则唯识了义境也。《庄严》与〈菩萨地〉诸品，名同而义别，西域不娴不能弘法，盖菩萨行之推广谈，与菩萨地功用无或殊也。《观所缘》，则唯识相分自内而已。此宗谈果，莫详于《佛地论》。四智心品为用，清净法界为体，菩提、涅槃二转依义，体用须明也。一辑《门论》，谈因明原理。二辑《入论》，谈因明作法而已。上来五论，皆无著学也。」
二十五、《菩提行经》，龙树集，宋·天息灾译，全四卷(十二册)。卷首总叙曰：「抉集群经，赞发菩提心，修行六度，回向众生，非龙树所作，而谈空义大破瑜伽，倘亦龙树学欤？」
二十六、《成实论》，诃梨跋摩造，鸠摩罗什译，全二十卷(十七至十九册)。
二十七、《阿毗达磨俱舍论》附本颂，世亲造，玄奘译，全三十一卷(二十至二十四册)。
以上二部小乘论典，卷首总叙曰：「小趣大者，《成实》入《般若》之半途，《俱舍》造《瑜伽》之中路。欲探大乘由来，二论诚不可不读也。」
第三辑尚未编峻，故卷首无总叙及目录，所收经典的编号目次亦有错漏。计收经十一种，律二种，论十种：
一、《大般若经第十六分》，玄奘译，选卷五百九十二至六百卷(一册)。欧阳渐有《叙》，并附《大般若经第十六分大科》。
二、《华严行位七品读》，选录《华严经》〈净行品第十一〉、〈十住品第十五〉、〈梵行品第十六〉、〈十行品第二十一〉、〈十无尽藏品第二十二〉、〈十忍品第二十九〉、〈普贤行品第三十六〉等七品(二册)。前有吕澂简短说明。
《首楞严三昧经》，鸠摩罗什译，全三卷(二册)。
三、《大般涅槃经·正法分》，北凉·昙无谶译，选卷三至卷十(三册)。欧阳渐有《叙》。
四、《大宝积经·普明会》(失译)，附录一：晋译《摩诃衍宝严经》「胜解胜利」段；附录二：《瑜伽师地论》卷第七十九及八七〈菩萨地抉择释〉(四册)。
五、《虚空藏问经·抉择分》，唐·不空译，选四卷，卷首序分不录(四册)。
六、《合部金光明经·正宗分》，据尼泊尔梵本、失译藏文本等合本，选四卷(五册)。欧阳渐有《叙》。
八、《大乘密严经》，不空译，全三卷(六册)。欧阳渐有《叙》，并附《大乘密严经科文》。
九、《中阿含经·双品》，东晋·瞿昙僧伽提婆译，选卷四十八、四十九(七册)。
《佛说义足经》，吴·支谦译，全二卷(七册)。
十二、《清净毗尼方广经》，鸠摩罗什译，全一卷(七册)。
十四、《根本说一切有部百一羯磨》，唐·义净译，全十卷(八册)。
十五、《十住毗婆娑论》，龙树造，鸠摩罗什译，全十五卷(九、十册)。
十七、《菩提资粮论》，龙树造，自在释，隋·达摩桫多译，全六卷；附：《菩提资粮论大科》(十一册)。
十八、《六门教授习定论》，无著本，世亲释，义净译，全一卷(十一册)。
十六、《显扬圣教论》，无著造，玄奘译，全二十卷；附：《显扬圣教论大科》(十二至十四册)。
《大乘掌珍论》，清辩造，玄奘译，全二卷；附：《大乘掌珍论科文》(十五册)。
《成唯识宝生论》(一名《二十唯识顺释论》)，护法造，义净译，全五卷；附：《成唯识宝生论科目》(十五册)。
二十一、《舍利弗阿毗昙论·非问分道品》，后秦·昙摩耶舍共昙摩崛多译，选卷十三至十四(十六册)。
《三法度论》，世贤本，众军释，东晋·瞿昙僧伽提婆译，全三卷(十六册)。
《解脱道论》，优波底沙造，僧伽婆罗译，全九卷(十七册)。
· · · · · · (收起)