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出版者:

作者:Parish, Tanya (EDT)/ Brown, Amanda Claire (EDT)

出品人:

頁數:475

译者:

出版時間:2008-10

價格:768.00 元

裝幀:

isbn號碼:9781588298898

叢書系列:

圖書標籤:

11
Mycobacteria
Microbiology
Molecular Biology
Bacteriology
Laboratory Protocols
Research Methods
Infection
Diagnosis
Culturing
Identification

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具體描述

Due to the rising threat of tuberculosis and other mycobacterial infections, methods to study the biology of the mycobacteria and to improve diagnostic, therapeutic and preventative reagents are still very much in need. Mycobacteria Protocols, Second Edition updates and refines the methods of the well-received first edition while adding newly developed methods culled from the most cutting-edge research in the field. Ranging from the basics of sub-cellular fractionation to advanced methods using specialized growth conditions and whole genome, transcriptome and proteome analysis, the chapters conform to the Methods in Molecular Biology(t) series format, providing step-by-step laboratory protocols, lists of necessary materials and reagents, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Comprehensive and up-to-date, Mycobacteria Protocols, Second Edition is the perfect resource to promote and stimulate further research into these intriguing, important and most fractious of bacteria.

好的，以下是一本不包含《Mycobacteria Protocols》內容的圖書簡介，內容詳實，旨在介紹另一本虛構的、專注於特定領域的前沿研究的圖書。 --- 圖書名稱：《細胞信號轉導的拓撲學與功能整閤：從分子網絡到組織動態》圖書簡介第一部分：引言與理論基礎本書《細胞信號轉導的拓撲學與功能整閤：從分子網絡到組織動態》旨在係統性地梳理和深入探討細胞信號轉導網絡在現代生命科學研究中的核心地位及其復雜的拓撲結構。我們不再將信號通路視為孤立的綫性或簡單分支結構，而是將其視為一個動態的、高維度的信息處理網絡。本書開篇（第一章）聚焦於信號轉導研究範式的演變，從早期的受體-配體模型過渡到基於網絡科學的宏觀視角。我們將詳細闡述構建高質量信號網絡模型的必要性，強調數據的捕獲效率與生物學背景的融閤是理解係統行為的前提。第二章深入介紹瞭圖論在生物網絡分析中的應用。我們將講解如何將激酶-底物關係、轉錄因子調控、以及磷酸化事件等離散的分子相互作用轉化為可量化的數學圖結構。重點討論諸如中心性（Centrality）、模塊性（Modularity）和社群發現（Community Detection）等拓撲指標在識彆關鍵調控節點的生物學意義。我們將特彆關注“受限自由度”原則，即在復雜的生物係統中，信息流動的實際約束條件如何影響網絡的拓撲魯棒性。第二部分：核心網絡拓撲與功能解析第三章緻力於分析信號網絡中的“拓撲模式”及其在特定細胞命運決定中的作用。我們將分析反饋迴路（正反饋與負反饋）、前饋迴路（特定模式I型和II型）的結構特徵及其如何實現信號的“開關”（Switching）或“振蕩”（Oscillation）。通過對經典MAPK通路與Wnt通路的案例研究，我們展示瞭拓撲結構如何精確地編碼時間與強度的依賴性。第四章聚焦於“多層網絡”（Multiplex Networks）的概念。細胞信號轉導很少在單一分子層麵上發生，而是涉及蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）、代謝網絡、基因調控網絡（GRN）以及錶觀遺傳修飾網絡之間的復雜耦閤。本章詳述瞭如何通過整閤不同組學數據層，構建跨尺度的多層網絡模型，並利用圖嵌入技術（Graph Embedding）揭示跨網絡間的協同或競爭機製。例如，探討代謝物波動如何通過變構調節影響激酶復閤物的拓撲連接穩定性。第五章探討瞭“動態拓撲變化”在細胞狀態轉換中的作用。信號網絡並非靜止不變，其連接性會隨環境刺激、細胞周期階段甚至病理狀態而快速重構。本章引入瞭時變圖理論（Time-Varying Graph Theory），分析網絡結構的動態演變速率與細胞適應性之間的關係。關鍵分析點在於識彆“結構性轉變點”，即網絡拓撲發生突變、導緻細胞從一種穩態躍遷至另一種穩態的瞬間。第三部分：從網絡到組織：空間與形態的整閤第六章將研究視角從單一細胞內部提升到組織層麵。細胞間的通訊，如旁分泌和自分泌，構成瞭“空間拓撲網絡”。本章討論如何結閤空間轉錄組學（Spatial Transcriptomics）和活細胞成像數據，重建細胞間信號擴散的物理網絡。我們將深入分析“鄰域效應”（Neighborhood Effects）如何通過網絡連接的局部密度和形狀，影響宏觀組織形態發生（Morphogenesis）和疾病進展（如腫瘤微環境中的信號梯度）。第七章專注於“拓撲缺陷與功能失調”。許多疾病，如神經退行性疾病和癌癥，被認為與信號網絡失去瞭其原有的拓撲穩健性（Robustness）有關。本章通過計算模型來模擬網絡中關鍵節點（Hubs）的隨機或定嚮失效，分析網絡如何失去其抵抗擾動的能力。同時，探討網絡中齣現“過度連接”或“不閤理路徑分支”如何導緻信號的持續激活或錯誤傳遞，並提齣基於拓撲學特徵的靶點識彆策略。第四部分：前沿方法與未來展望第八章介紹瞭用於分析和預測復雜信號網絡行為的計算工具箱。涵蓋瞭從傳統的基於微分方程的動力學模擬到現代的深度學習方法，特彆是圖神經網絡（GNN）在預測新型通路組分和調控關係中的最新進展。本章提供瞭實際操作的指南，說明如何利用這些工具來處理高通量組學數據，並構建具有生物學可解釋性的模型。第九章對信號轉導網絡的拓撲學研究進行瞭總結與展望。討論瞭當前麵臨的挑戰，例如如何精確測量低豐度分子間的瞬時相互作用，以及如何將細胞間的信號網絡與細胞外基質的物理信號輸入進行有效耦閤。本書最終強調，隻有深入理解這些網絡的內在結構原理，我們纔能真正掌握生命係統的控製邏輯，並設計齣更精確的乾預手段。目標讀者：細胞生物學傢、係統生物學傢、生物物理學傢、生物醫學工程師、計算生物學研究生及研究人員。本書特色：跨學科整閤：深度融閤瞭網絡科學、圖論、動力學係統理論與分子生物學數據。理論與實踐並重：提供瞭大量的概念性解釋和前沿計算方法的實例分析。前瞻視角：將信號研究的焦點從單個分子轉移到網絡的結構與功能湧現特性上。 ---