Mycobacteria Protocols

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出版者:
作者:Parish, Tanya (EDT)/ Brown, Amanda Claire (EDT)
出品人:
页数:475
译者:
出版时间:2008-10
价格:768.00 元
装帧:
isbn号码:9781588298898
丛书系列:
图书标签:
  • 11
  • Mycobacteria
  • Microbiology
  • Molecular Biology
  • Bacteriology
  • Laboratory Protocols
  • Research Methods
  • Infection
  • Diagnosis
  • Culturing
  • Identification
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具体描述

Due to the rising threat of tuberculosis and other mycobacterial infections, methods to study the biology of the mycobacteria and to improve diagnostic, therapeutic and preventative reagents are still very much in need. Mycobacteria Protocols, Second Edition updates and refines the methods of the well-received first edition while adding newly developed methods culled from the most cutting-edge research in the field. Ranging from the basics of sub-cellular fractionation to advanced methods using specialized growth conditions and whole genome, transcriptome and proteome analysis, the chapters conform to the Methods in Molecular Biology(t) series format, providing step-by-step laboratory protocols, lists of necessary materials and reagents, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Comprehensive and up-to-date, Mycobacteria Protocols, Second Edition is the perfect resource to promote and stimulate further research into these intriguing, important and most fractious of bacteria.

好的,以下是一本不包含《Mycobacteria Protocols》内容的图书简介,内容详实,旨在介绍另一本虚构的、专注于特定领域的前沿研究的图书。 --- 图书名称:《细胞信号转导的拓扑学与功能整合:从分子网络到组织动态》 图书简介 第一部分:引言与理论基础 本书《细胞信号转导的拓扑学与功能整合:从分子网络到组织动态》旨在系统性地梳理和深入探讨细胞信号转导网络在现代生命科学研究中的核心地位及其复杂的拓扑结构。我们不再将信号通路视为孤立的线性或简单分支结构,而是将其视为一个动态的、高维度的信息处理网络。 本书开篇(第一章)聚焦于信号转导研究范式的演变,从早期的受体-配体模型过渡到基于网络科学的宏观视角。我们将详细阐述构建高质量信号网络模型的必要性,强调数据的捕获效率与生物学背景的融合是理解系统行为的前提。 第二章深入介绍了图论在生物网络分析中的应用。我们将讲解如何将激酶-底物关系、转录因子调控、以及磷酸化事件等离散的分子相互作用转化为可量化的数学图结构。重点讨论诸如中心性(Centrality)、模块性(Modularity)和社群发现(Community Detection)等拓扑指标在识别关键调控节点的生物学意义。我们将特别关注“受限自由度”原则,即在复杂的生物系统中,信息流动的实际约束条件如何影响网络的拓扑鲁棒性。 第二部分:核心网络拓扑与功能解析 第三章致力于分析信号网络中的“拓扑模式”及其在特定细胞命运决定中的作用。我们将分析反馈回路(正反馈与负反馈)、前馈回路(特定模式I型和II型)的结构特征及其如何实现信号的“开关”(Switching)或“振荡”(Oscillation)。通过对经典MAPK通路与Wnt通路的案例研究,我们展示了拓扑结构如何精确地编码时间与强度的依赖性。 第四章聚焦于“多层网络”(Multiplex Networks)的概念。细胞信号转导很少在单一分子层面上发生,而是涉及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、代谢网络、基因调控网络(GRN)以及表观遗传修饰网络之间的复杂耦合。本章详述了如何通过整合不同组学数据层,构建跨尺度的多层网络模型,并利用图嵌入技术(Graph Embedding)揭示跨网络间的协同或竞争机制。例如,探讨代谢物波动如何通过变构调节影响激酶复合物的拓扑连接稳定性。 第五章探讨了“动态拓扑变化”在细胞状态转换中的作用。信号网络并非静止不变,其连接性会随环境刺激、细胞周期阶段甚至病理状态而快速重构。本章引入了时变图理论(Time-Varying Graph Theory),分析网络结构的动态演变速率与细胞适应性之间的关系。关键分析点在于识别“结构性转变点”,即网络拓扑发生突变、导致细胞从一种稳态跃迁至另一种稳态的瞬间。 第三部分:从网络到组织:空间与形态的整合 第六章将研究视角从单一细胞内部提升到组织层面。细胞间的通讯,如旁分泌和自分泌,构成了“空间拓扑网络”。本章讨论如何结合空间转录组学(Spatial Transcriptomics)和活细胞成像数据,重建细胞间信号扩散的物理网络。我们将深入分析“邻域效应”(Neighborhood Effects)如何通过网络连接的局部密度和形状,影响宏观组织形态发生(Morphogenesis)和疾病进展(如肿瘤微环境中的信号梯度)。 第七章专注于“拓扑缺陷与功能失调”。许多疾病,如神经退行性疾病和癌症,被认为与信号网络失去了其原有的拓扑稳健性(Robustness)有关。本章通过计算模型来模拟网络中关键节点(Hubs)的随机或定向失效,分析网络如何失去其抵抗扰动的能力。同时,探讨网络中出现“过度连接”或“不合理路径分支”如何导致信号的持续激活或错误传递,并提出基于拓扑学特征的靶点识别策略。 第四部分:前沿方法与未来展望 第八章介绍了用于分析和预测复杂信号网络行为的计算工具箱。涵盖了从传统的基于微分方程的动力学模拟到现代的深度学习方法,特别是图神经网络(GNN)在预测新型通路组分和调控关系中的最新进展。本章提供了实际操作的指南,说明如何利用这些工具来处理高通量组学数据,并构建具有生物学可解释性的模型。 第九章对信号转导网络的拓扑学研究进行了总结与展望。讨论了当前面临的挑战,例如如何精确测量低丰度分子间的瞬时相互作用,以及如何将细胞间的信号网络与细胞外基质的物理信号输入进行有效耦合。本书最终强调,只有深入理解这些网络的内在结构原理,我们才能真正掌握生命系统的控制逻辑,并设计出更精确的干预手段。 目标读者: 细胞生物学家、系统生物学家、生物物理学家、生物医学工程师、计算生物学研究生及研究人员。 本书特色: 跨学科整合: 深度融合了网络科学、图论、动力学系统理论与分子生物学数据。 理论与实践并重: 提供了大量的概念性解释和前沿计算方法的实例分析。 前瞻视角: 将信号研究的焦点从单个分子转移到网络的结构与功能涌现特性上。 ---

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