Introduction to Conservation Genetics

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出版者:
作者:Frankham, Richard/ Ballou, Jonathan/ Briscoe, David
出品人:
页数:644
译者:
出版时间:2010-4
价格:$ 88.14
装帧:
isbn号码:9780521702713
丛书系列:
图书标签:
  • Conservation Genetics
  • Population Genetics
  • Molecular Ecology
  • Biodiversity
  • Evolutionary Biology
  • Genomics
  • Wildlife Management
  • Endangered Species
  • Genetic Diversity
  • Conservation Biology
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具体描述

This impressive author team brings the wealth of advances in conservation genetics into the new edition of this introductory text, including new chapters on population genomics and genetic issues in introduced and invasive species. They continue the strong learning features for students - main points in the margin, chapter summaries, vital support with the mathematics, and further reading - and now guide the reader to software and databases. Many new references reflect the expansion of this field. With examples from mammals, birds, reptiles, fish, amphibians, plants and invertebrates, this is an ideal introduction to conservation genetics for a broad audience. The text tackles the quantitative aspects of conservation genetics, and has a host of pedagogy to support students learning the numerical side of the subject. Combined with being up-to-date, its user-friendly writing style and first-class illustration programme forms a robust teaching package.

好的,这是一份图书简介,内容聚焦于分子生物学、生态学、进化生物学等相关领域,但不涉及《Introduction to Conservation Genetics》一书的具体内容。 --- 书名:分子生态学前沿:种群动态与适应性进化 导言:连接微观机制与宏观生态 本书旨在深入探讨分子生物学工具在理解现代生态学与进化生物学核心问题中的应用与潜力。我们正处于一个由基因组学、转录组学和蛋白质组学驱动的时代,这些“组学”数据为我们提供了前所未有的视角,去揭示物种如何应对环境变化,种群内部的遗传结构如何塑造其生态功能,以及进化过程中的关键适应性机制。本书将超越传统的形态学和生态学观察,聚焦于分子水平的证据,以构建一个更全面、更精确的生物学图景。 第一部分:分子工具箱与数据解析 本部分将详细介绍当前生态学和进化研究中最常用的分子生物学技术,并着重讲解如何从海量数据中提取有意义的生物学信息。 第一章:高通量测序技术与生态基因组学 我们将从短读长测序(Illumina)到长读长测序(PacBio, Oxford Nanopore)的演变入手,探讨这些技术如何重塑我们对生物多样性的认知。重点讨论从头组装(De Novo Assembly)的挑战与策略,以及利用参考基因组进行比对和变异检测的方法。在生态学背景下,如何设计有效的取样方案以捕捉真实的种群遗传变异,是本章的讨论核心。我们将深入解析SNP(单核苷酸多态性)和Indel(插入缺失)在种群遗传学中的应用,并讨论如何利用这些数据进行群体结构分析(如PCA, ADMIXTURE)。 第二章:转录组学与环境响应 环境压力(如气候变化、污染暴露)如何通过基因表达水平影响生物体?本章聚焦于RNA测序(RNA-Seq)。我们将详细阐述差异表达基因(DEG)的鉴定流程,以及如何将这些基因与特定的生物学通路(Pathway Analysis)联系起来。特别关注环境转录组学(Environmental Transcriptomics),即利用组织或个体层面的转录组数据来推断物种在复杂自然环境中的生理状态和适应性潜力。我们将探讨同源基因分析(Homology Search)和功能注释(Functional Annotation)在环境适应性研究中的关键作用。 第三部分:进化驱动力与适应性机制 分子证据为我们理解自然选择如何塑造生命提供了直接的线索。本部分将探讨利用分子数据来推断选择压力和进化历史的方法。 第三章:选择的信号与适应性进化 如何区分中性进化和适应性进化?本章的核心在于选择压力检测。我们将详细介绍基于核苷酸序列的选择系数估计(如$ ext{dN/dS}$比值分析),并讨论更精细的方法,例如扫描选择(Selective Sweeps)的识别。我们会剖析适应性基因的发现过程,从基因组扫描到候选基因验证。此外,还将讨论基因流在适应性扩散中所扮演的角色,以及如何利用分子标记来区分迁移(Gene Flow)与汇合(Convergence)。 第四章:表观遗传学在生态适应中的角色 近年来,表观遗传学(Epigenetics)作为一种超越DNA序列的遗传变异形式,在生态学中引起了广泛关注。本章将介绍DNA甲基化和组蛋白修饰的基本原理,以及它们如何介导快速的环境响应。我们将探讨表观遗传标记的遗传性(Transgenerational Epigenetic Inheritance)及其对种群适应的潜在影响。如何利用WGBS(全基因组亚硫酸氢盐测序)或RAD-Seq衍生的表观遗传标记,来评估短期环境变化对生物学特征的塑造,是本章的重点案例分析。 第三部分:种群动态与遗传连通性 理解种群的遗传结构和连通性是评估物种生存潜力的基础。 第五章:遗传景观与地理模式 地理隔离和环境梯度如何塑造种群的遗传结构?本章将综合运用空间遗传学(Spatial Genetics)和景观遗传学(Landscape Genetics)的理论框架。我们将讨论如何利用距离矩阵和环境因子来构建广义线性模型(GLM)或广义可加模型(GAM),以识别影响基因流的地理或生态阻力。案例分析将集中于如何评估人类活动(如栖息地破碎化)对不同尺度的种群连接性的影响,以及如何使用有效种群大小($N_e$)的分子估计值来指导保护决策。 第六章:物种分化与系统发育重建 分子数据是重建生命之树的基石。本章将探讨如何利用多基因组数据进行系统发育分析。从经典的最大似然法到基于全基因组数据的新兴方法(如分子方差分析,AMOVA),我们将梳理不同方法在处理复杂进化历史时的优缺点。特别关注种群分化程度($F_{ST}$)的解释,以及如何利用它来区分近期分化事件与深远的历史隔离。我们还将探讨混合分析(Admixture Analysis)在识别过去杂交事件或种群合并过程中的应用。 结论:整合分子见解,应对生物学挑战 本书的最终目标是提供一个整合性的视角,展示如何将分子数据转化为具有实际指导意义的生态学和进化生物学知识。通过深入理解基因组、转录组和表观基因组在塑造生物学现实中的作用,读者将能够更有效地分析和预测生物系统在快速变化世界中的反应。 ---

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