醫藥數理統計

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頁數:249
译者:
出版時間:2009-4
價格:29.00元
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isbn號碼:9787030243898
叢書系列:
圖書標籤:
  • 醫藥統計
  • 數理統計
  • 生物統計
  • 醫學統計
  • 統計學
  • 藥物研發
  • 臨床試驗
  • 數據分析
  • 統計方法
  • 醫學研究
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具體描述

《醫藥數理統計(第3版)》為中國科學院教材建設專傢委員會規劃教材及全國高等醫藥院校規劃教材,是根據教育部對高等醫藥院校精品課程教材的要求,由全國20所醫藥院校長期從事數學教學工作的教師聯閤對第2版教材再次修改完善、編寫而成的第3版教材。全書分10章,內容包括概率論基本知識、統計學重要概念與方法、正交試驗設計及新增的EXcel 2003統計分析功能介紹等內容。《醫藥數理統計(第3版)》的編寫既體現瞭數學學科本身的科學性與係統牲,同時又注重其在醫藥學科裏的應用。全書文字簡潔、內容精練、由淺入深。每章後配有習題,同時還有《醫藥數理統計學習輔導》(第2版)配套使用。

《醫藥數理統計(第3版)》可供醫藥院校各專業各層次的學生使用,也可作為醫藥工作者學習數理統計的參考書。

好的,這是一份為您構思的圖書簡介,重點圍繞“醫藥數理統計”以外的、專注於現代生命科學與生物信息學交叉領域的專業書籍內容: 基因組學數據挖掘與高通量測序分析實戰指南 書籍定位: 本書旨在為生命科學研究人員、生物信息學從業者以及高階統計學學生提供一套全麵、實用的技術棧,專注於如何利用先進的計算和統計方法處理和解讀海量的現代生命科學實驗數據,特彆是基因組學、轉錄組學和蛋白質組學領域的數據。 核心關注點: 本書完全避開瞭傳統的臨床試驗設計、藥物流行病學或基礎生物統計學的核心論述,而是聚焦於“數據生成”到“生物學意義闡釋”之間的計算鴻溝。 --- 第一部分:高通量測序數據預處理與質量控製(QC) 本部分深入探討現代測序技術(如Illumina、PacBio、Oxford Nanopore)産生的數據集的特性、挑戰與標準化的處理流程。 1. 數據結構與基礎工具鏈: 詳細介紹FASTQ、SAM/BAM/CRAM等核心文件格式的內在結構及其相互轉換。重點講解如何搭建高效的Linux/Unix計算環境,並熟練使用BWA、Bowtie2等對齊工具進行初步比對。 2. 質量評估與過濾: 不再是簡單的Q值討論,而是深入到係統偏差(Systematic Bias)的識彆。講解使用FastQC、MultiQC等工具對測序深度、GC含量分布、序列冗餘度進行全麵評估。關鍵在於區分生物學信號與技術噪音,並實施針對性的序列過濾、適配器去除和低質量堿基截斷策略。 3. 變異識彆的復雜性: 針對從頭組裝(De Novo Assembly)到比對組裝(Alignment-based Assembly)的不同策略,詳細闡述變異調用(Variant Calling)的流程,包括GATK的最佳實踐流程(Base Quality Score Recalibration, BQSR),以及如何處理插入/缺失(Indels)和結構變異(Structural Variants, SVs)的特有挑戰。 --- 第二部分:轉錄組學數據的高級解析與單細胞革命 本章是本書的重點,覆蓋瞭從宏觀的組織水平轉錄組到微觀的細胞異質性分析。 1. 差異錶達分析(DEA)的範式轉變: 本書采用DESeq2和edgeR作為核心分析框架,但重點在於討論其背後的負二項分布模型假設、離散度估計和批次效應(Batch Effect)的移除。特彆設置章節探討定性(Qualitative)和定量(Quantitative)RNA-Seq數據的差異處理,以及如何使用LIMMA進行微陣列數據的遺留分析。 2. 功能富集分析的深度優化: 超越傳統的GO和KEGG富集。我們深入探討GSEA(基因集富集分析)的原理,強調其在檢測微弱但一緻的信號中的優勢。同時,引入通路激活分析(Pathway Activity Analysis)工具,如ssGSEA,以評估特定生物過程的整體活性而非單個基因的豐度變化。 3. 單細胞RNA測序(scRNA-seq)數據的高維建模: 這是當代生物信息學的核心。內容涵蓋從原始計數矩陣到降維可視化的全流程: 數據歸一化與去噪: 討論Splat模型、scran包中的方法,以及如何處理Dropout事件。 降維與聚類: 詳細比較PCA、t-SNE、UMAP的應用場景,並係統地介紹Louvain、Leiden等圖論基礎上的聚類算法。 細胞類型鑒定與軌跡推斷: 引入Monocle和Slingshot等工具,用於解析細胞分化、重編程等動態過程,並利用僞時間(Pseudotime)分析來量化時間軸上的基因錶達變化。 --- 第三部分:生物學網絡的構建與係統生物學建模 本部分將分析結果轉化為可解釋的生物學模型,側重於網絡科學和因果推斷。 1. 基因調控網絡(GRN)的重建: 重點介紹基於互補性(Co-expression)和互信息(Mutual Information)的無監督網絡構建方法,如ARACNe和GENIE3。隨後,轉嚮監督學習方法,利用轉錄因子ChIP-seq數據或ATAC-seq數據,結閤SCENIC等工具,識彆齣關鍵的轉錄調控單元。 2. 蛋白質組學和代謝組學數據的整閤分析: 探討如何將結構生物學數據(如質譜數據)與基因錶達數據進行多組學整閤。使用PLSR(偏最小二乘迴歸)和PCA進行降維,尋找跨平颱數據中的協同變化模式。 3. 知識圖譜與網絡拓撲分析: 如何利用已知的生物醫學知識庫(如STRING、KEGG)構建初始網絡,並應用中心性(Centrality)指標(如介數中心性、接近中心性)來識彆網絡中的“樞紐基因”(Hub Genes),預測潛在的調控靶點或疾病標誌物。 --- 第四部分:計算方法學的統計學基礎迴顧與前沿展望 本章將提供必要的統計學工具箱,但側重於其在生物信息學中的應用,而非純理論推導。 1. 假設檢驗的局限性與多重檢驗校正: 深入分析為什麼在基因篩選中,傳統的P值需要進行嚴格的校正(FDR/BH)。討論Power Analysis在NGS實驗設計中的實際應用。 2. 機器學習在生物學中的應用: 重點介紹監督學習(如支持嚮量機SVM、隨機森林RF)在疾病風險預測和分子亞型分類中的應用。此外,討論深度學習(CNN/RNN)在處理序列數據(如DNA/RNA序列)和圖像數據(如組織病理學切片)時的前沿進展。 3. 可重復性與數據共享標準: 強調“可重復性”是現代生物計算的基石。介紹R Markdown/Jupyter Notebook作為“可計算文檔”的實踐,以及如何使用Docker/Singularity容器化您的分析流程,確保結果在不同計算環境中高度一緻。 --- 總結: 本書是麵嚮下一代生命科學研究者的“數據處理與模型構建手冊”。它假設讀者具備基礎的分子生物學知識,並緻力於將讀者迅速提升到能夠獨立處理復雜基因組數據集、構建可信賴生物學模型的研究水平。全書的案例和代碼均基於最新的開源工具和真實生物數據集進行演示,強調實戰操作而非抽象的數學公式。

作者簡介

目錄資訊

讀後感

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用戶評價

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對於我這樣一名對數據敏感但缺乏係統統計學訓練的讀者來說,《醫藥數理統計》提供瞭一個非常友好的入口。書中並沒有迴避統計學中的數學原理,但卻用一種非常易懂的方式去呈現。例如,在解釋方差分析時,作者首先通過一個多組藥物療效比較的例子,說明瞭如何評估不同處理組之間的差異是否顯著大於組內的隨機波動,然後纔介紹瞭F檢驗的原理以及ANOVA錶各項指標的含義。即使是一些復雜的概念,如最大似然估計,作者也通過圖形化的解釋和直觀的比喻,讓我能夠理解其核心思想,而不需要沉溺於復雜的數學推導。這種“化繁為簡”的能力,使得這本書既保持瞭學術的嚴謹性,又不失其可讀性,對於想要提升自身數據分析能力的醫藥工作者來說,無疑是難得的學習資源。

评分☆☆☆☆☆

我特彆欣賞書中對於生存分析的講解。在醫藥領域,特彆是新藥研發和慢性病管理中,生存分析是評估治療效果和預後預測的關鍵技術。作者從 Kaplan-Meier 生存麯綫的繪製和解釋入手,循序漸進地介紹瞭 Log-rank 檢驗、Cox 比例風險模型等核心內容。通過生動的病例分析,我理解瞭如何評估不同治療組的生存率差異,以及如何構建多因素模型來識彆影響患者生存期的重要因素。更讓我受益匪淺的是,書中還強調瞭在實際應用中可能遇到的各種挑戰,比如截尾數據的處理、混雜因素的調整等,並提供瞭相應的解決方案。這讓我意識到,生存分析絕不僅僅是繪製幾條麯綫,而是一個復雜而精密的統計學工具。

评分☆☆☆☆☆

《醫藥數理統計》在數據可視化方麵也提供瞭很多有價值的指導。作者強調瞭清晰、準確的數據可視化對於溝通研究結果的重要性。書中提供瞭多種圖錶的應用案例,例如,散點圖用於展示變量間的關係,箱綫圖用於比較多組數據的分布,條形圖用於展示頻率或比例等。更重要的是,作者不僅僅是展示圖錶,還指導讀者如何選擇最適閤的圖錶類型,以及如何通過圖錶的設計來突齣關鍵信息,避免誤導。這讓我明白,一個好的統計分析,不僅要有嚴謹的計算,還需要有能夠直觀地傳達信息的可視化呈現,讓非專業人士也能快速理解研究的核心發現。

评分☆☆☆☆☆

讀完《醫藥數理統計》,我最大的感受是統計學不再是冰冷抽象的數學公式,而是賦能醫藥研究、提升決策質量的強大武器。書中對於統計推斷的各個環節,從估計到檢驗,都進行瞭詳盡的闡述。例如,在參數估計部分,作者詳細介紹瞭點估計和區間估計的原理,並解釋瞭置信區間的實際意義。而在假設檢驗部分,除瞭基本的P值解讀,還深入探討瞭統計效力、I類錯誤和II類錯誤等概念,並強調瞭在實際研究中如何平衡這些因素。這種對統計推斷的深入剖析,讓我明白瞭如何從樣本數據中獲得可靠的結論,並對結果的確定性和不確定性有更清醒的認識。

评分☆☆☆☆☆

初拿到《醫藥數理統計》這本書,我帶著一種既期待又略帶忐忑的心情。期待是因為在醫藥研究日益精進,數據分析能力成為核心競爭力的今天,一本能夠係統梳理統計學在醫藥領域應用的書籍,無疑是知識寶庫。然而,我對數理統計本身就有些畏懼,總覺得那些復雜的公式和抽象的概念會讓我望而卻步。但翻開第一頁,我便被作者的文字風格吸引瞭。並非那種枯燥乏味的理論堆砌,而是通過大量生動的案例,將統計學的概念巧妙地融入醫藥研究的實際場景中。比如,在講解假設檢驗時,作者並沒有直接拋齣“零假設”和“備擇假設”的定義,而是以一個新藥能否有效降低某種疾病發病率的臨床試驗為例,層層遞進地闡釋瞭設立假設、選擇檢驗方法、計算P值、做齣決策的整個過程。這種“潤物細無聲”的教學方式,讓我逐漸消除瞭對數理統計的抵觸感,開始真正體會到統計學在科學探索中的強大力量。

评分☆☆☆☆☆

我對書中關於抽樣方法和樣本量設計的章節尤為推崇。在醫藥研究中,一個科學的抽樣方案和足夠代錶性的樣本量是保證研究結果可靠性的基礎。作者在這部分內容中,詳細介紹瞭簡單隨機抽樣、分層抽樣、整群抽樣等常用方法,並結閤具體的臨床試驗場景,解釋瞭如何根據研究目的、預期效應大小、統計效力等因素來計算所需的樣本量。特彆是關於如何處理缺失數據和異常值的部分,提供瞭多種實用的方法和注意事項,這在實際數據分析中是非常關鍵的。這本書讓我明白,統計學並非僅僅是事後分析,而是貫穿於研究設計的每一個環節,從最初的方案製定到最終的結果解釋,都離不開嚴謹的統計學思維。

评分☆☆☆☆☆

《醫藥數理統計》在非參數統計方法的介紹上也做得相當齣色。很多時候,由於樣本量不足或者數據不符閤正態分布等假設,參數統計方法就難以適用。作者在這方麵提供瞭非常實用的解決方案,例如,在比較兩組獨立樣本的秩和檢驗、配對樣本的符號秩和檢驗,以及多組樣本的Kruskal-Wallis檢驗等。更重要的是,作者並沒有僅僅列齣這些方法,而是深入分析瞭它們在哪些臨床場景下是最佳選擇,以及如何解讀這些非參數檢驗的結果。這種“知其然,更知其所以然”的講解方式,讓我對統計學有瞭更全麵和深刻的認識,也為我在麵對各種復雜的數據情況時,提供瞭更多的信心和工具。

评分☆☆☆☆☆

書中對於臨床試驗設計和數據分析的整閤性描述,給我留下瞭深刻的印象。作者在介紹統計方法的同時,始終關注其在臨床實踐中的應用。例如,在講解二分類變量的統計分析時,除瞭X²檢驗和Fisher精確檢驗,還詳細介紹瞭ROC麯綫的繪製和AUC值的計算,以及如何利用這些工具來評估診斷試驗的性能。這種將理論方法與實際應用緊密結閤的風格,讓我能夠更好地理解統計學在評估藥物療效、預測疾病風險、優化治療方案等方麵的關鍵作用。這本書讓我意識到,優秀的統計學應用,不僅需要掌握方法,更需要深刻理解研究的背景和目標。

评分☆☆☆☆☆

這本書最大的價值在於,它不僅僅是一本統計學教材,更像是一本醫學研究中的“統計學指南”。作者在講解每一個統計概念時,都會聯係到具體的醫藥研究場景,比如藥物研發、流行病學調查、臨床療效評價等。這使得我能夠將書中的知識融會化於我自己的工作和學習中。例如,在學習貝葉斯統計時,作者通過一個簡單但形象的例子,解釋瞭如何將先驗知識融入到數據分析中,以及在更新證據時如何修正模型的參數。這種“學以緻用”的教學方式,讓我對統計學的學習充滿瞭動力,也讓我對未來利用統計學解決醫藥領域的問題充滿瞭信心。

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這本書的結構安排也讓我印象深刻。它並沒有按照傳統的數學教材模式,從最基礎的概率論講起,而是直接切入醫藥研究中最常用的統計方法。例如,在介紹迴歸分析時,作者首先探討瞭藥物劑量與療效之間的關係,以及年齡、性彆等因素對藥物反應的影響,然後纔引齣綫性迴歸、多元迴歸等模型,並詳細解釋瞭如何解讀迴歸係數、判斷模型擬閤優度以及進行預測。這種“以問題為導嚮”的學習路徑,極大地激發瞭我的學習興趣,因為我能清晰地看到所學知識與我未來可能從事的工作之間的聯係。而且,書中對每一種統計方法的適用條件、優缺點都進行瞭詳細的比較和論述,這使得我在實際應用時,能夠更有針對性地選擇最閤適的工具,避免“眉毛鬍子一把抓”。

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