Environmental Monitoring of Bacteria (Methods in Biotechnology) (Methods in Biotechnology)

Environmental Monitoring of Bacteria (Methods in Biotechnology) (Methods in Biotechnology) pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Humana Press
作者:Edwards, Clive 编
出品人:
页数:348
译者:
出版时间:1999-02-15
价格:USD 115.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9780896035669
丛书系列:
图书标签:
  • Bacteria
  • Environmental Monitoring
  • Microbiology
  • Biotechnology
  • Methods
  • Environmental Science
  • Molecular Biology
  • Detection
  • Analysis
  • Public Health
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具体描述

Clive Edwards and his distinguished panel of researchers bring together a collection of detailed molecular methods for the environmental monitoring of bacterial populations. These state-of-the-art methods include techniques for the recovery of cells, for the analysis of whole cells, and for the molecular study of target species and heterogeneous populations. Many of the methods enable bacteria to be monitored in their natural environments without culturing and specifically address the difficult problem that only a small proportion of bacteria in any ecosystem can be cultured by traditional microbiological methods. Environmental Monitoring of Bacteria takes full advantage of the exciting research in recent years that has challenged some long-held principles of traditional microbiology and gives timely and practical access to techniques that allow the study of bacterial ecology as communities, single cells, or at the molecular level.

环境微生物学前沿:从理论到实践的深度探索 图书名称:《环境微生物学前沿:从理论到实践的深度探索》 内容简介: 本书旨在为环境科学、微生物学、水处理工程以及相关领域的研究人员、工程师和高级学生提供一个全面而深入的视角,聚焦于当前环境微生物学领域最前沿的研究方法、理论模型与实际应用挑战。不同于侧重特定技术手册的传统著作,《环境微生物学前沿》着重于整合跨学科知识,阐释复杂环境系统中微生物群落的动态变化规律及其对生态系统功能的影响机制。 第一部分:环境微生物组学的宏观视角与解析工具 本部分奠定了理解复杂环境微生物生态学的基础。我们首先探讨了地球微生物组的宏大概念,涵盖了从极端环境(如深海热泉、极地冰盖)到人类活动影响区域(如城市污水、农业土壤)的微生物生物地理学分布规律。重点内容包括: 高通量测序技术的新进展与局限性: 详细分析了 16S rRNA 基因测序、宏基因组学(Shotgun Metagenomics)和宏转录组学(Metatranscriptomics)在环境样本分析中的最新应用,并深入讨论了数据偏差、样本采集策略与生物信息学流程的优化。特别关注了单细胞基因组学(SAGs)在解析稀有或难以培养微生物方面的突破性进展。 功能性预测与网络构建: 阐述了如何利用生物信息学工具,如 PICRUSt2 和 Tax4Fun,从结构数据中预测微生物的潜在代谢途径。在此基础上,深入讲解了微生物群落结构(Species-Species Interactions)与环境因子(如pH值、氧化还原电位、污染负荷)之间的相互作用网络分析方法,例如基于斯皮尔曼等级相关系数或互信息(Mutual Information)的构建与验证。 同位素探针与活性分析: 介绍了稳定同位素探针标记(SIP)技术在追踪特定代谢途径中微生物群落(如碳、氮、硫循环)的关键作用,这是理解环境微生物功能活性的核心工具,远超单纯的物种丰度信息。 第二部分:关键环境过程中的微生物调控机制 本部分深入探讨了微生物在地球关键生物地球化学循环以及污染物降解中扮演的核心角色。 碳循环与温室气体排放: 重点剖析了甲烷的产生(产甲烷作用)与消耗(甲烷氧化作用)过程的分子机制,以及微生物在土壤有机质矿化和二氧化碳释放中的调控作用。讨论了气候变化背景下,微生物群落反馈对碳平衡的影响模型。 氮素转化与环境负荷: 细致考察了好氧/厌氧氨氧化(AOA/AANAM)、反硝化作用、氮素固定等关键步骤的微生物学基础。特别关注了新兴的厌氧甲烷氧化(AOM)与氮素循环耦合机制在海洋和湿地系统中的重要性。 新兴有机污染物(POPs)与抗生素耐药性基因(ARGs)的命运: 结合环境工程实践,详细分析了微生物如何通过酶促反应或生物膜作用降解持久性有机污染物(如多环芳烃、全氟烷基物质)。同时,探讨了污水处理厂作为抗生素耐药性基因的“热点”区域,微生物群落如何通过水平基因转移(HGT)驱动耐药性扩散的生态学和遗传学机制。 第三部分:环境微生物工程的应用与挑战 本部分侧重于如何将基础研究的发现转化为实际的环境修复和可持续技术。 生物修复策略的优化: 比较了生物刺激(Biostimulation)和生物强化(Bioaugmentation)在污染场地修复中的优缺点。重点介绍了针对重金属(如铬、砷)的微生物转化(价态改变)技术,以及如何利用基因工程手段改良微生物的降解效率。 水环境微生物生态工程: 详述了活性污泥系统、膜生物反应器(MBR)及人工湿地中微生物群落的调控技术,以提高对难降解有机物的去除率和营养物质(N, P)的回收效率。讨论了利用微生物群落结构分析来诊断和优化运行故障的方法。 微生物技术在生物能源中的潜力: 探讨了微生物在生产生物燃料(如生物氢、生物丁醇、微生物燃料电池)中的应用潜力,特别是如何通过代谢工程和群落工程来提高目标产物的产率和稳定性。 第四部分:环境微生物学的未来趋势与伦理考量 最后,本部分展望了该领域的未来发展方向,包括: 单细胞水平的解析: 强调了利用单细胞测序和成像技术,实现对“微生物组中的暗物质”(即尚未被培养的物种)的深度挖掘。 模型的精确化: 探讨了将复杂的微生物组学数据与宏观生态学模型(如反应器模型、流域模型)相结合,实现对环境过程更精准的预测。 生物安全与伦理: 讨论了在环境微生物群落改造和应用过程中,需要严格遵守的生物安全标准,以及在全球尺度上部署转基因微生物的伦理和社会接受度问题。 本书内容紧密结合了最新的学术文献和行业案例,语言严谨,结构清晰,旨在帮助读者建立起一个全面、动态且具有前瞻性的环境微生物学知识体系。

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读后感

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用户评价

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这本书的排版和图示设计是我所见过的专业技术书籍中最具启发性的之一。作为一名在工业微生物控制领域摸爬滚打了多年的工程师,我深知理论知识如何转化为有效的现场控制措施。这本书在“故障排除”和“结果验证”方面的论述非常务实。例如,它没有避开环境样本中常见的干扰因素,如高盐度、重金属离子对PCR扩增效率的影响,并详细列出了针对性的预处理方案。我特别欣赏其中关于“假阳性”和“假阴性”的案例分析部分,这些是在标准教科书中往往被一带而过,但在实际工作中却是决定项目成败的关键。书中对于不同监测工具的优劣势对比分析极其中肯,例如,何时选择荧光原位杂交(FISH)而非基于DNA的定量方法,其核心考量因素都分析得丝丝入扣。这种基于成本效益和实际应用场景的权衡,体现了作者丰富的实战经验。我甚至在书中找到了关于如何利用微生物群落结构指标(如Shannon多样性指数或物种丰富度)来评估环境治理项目成功与否的量化标准,这为我们与非技术背景的管理者沟通提供了强有力的技术支撑。它让监测工作不再是孤立的实验室行为,而是真正融入到环境管理决策链条中的重要一环。

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这本书的叙事风格非常具有感染力,它成功地将枯燥的分子生物学技术与宏大的环境生态学目标联系起来。它不仅仅罗列了技术步骤,更深入探讨了这些技术背后的生物学意义。例如,在讨论抗生素抗性基因(ARGs)的环境监测时,作者没有仅仅停留在“检测到ARGs”的层面,而是引导读者去思考这些基因在环境微生物群体间的水平基因转移(HGT)的可能性及其对生态健康的长期风险。这种前瞻性的视角,让我对未来环境监测的重心有了新的认识——我们不应只关注现存的病原体,更要警惕潜在的风险因子库。书中对现场快速检测(Point-of-Care Testing, POCT)技术的讨论也十分到位,考虑到许多环境监测需要在偏远或资源有限的地区进行,作者详细对比了便携式设备在灵敏度和特异性上与大型实验室仪器的差距,并提出了实用的现场校准策略。这种对现实约束条件的深刻理解和解决方案的提供,使得这本书的实用价值极高,它不是一本高悬于实验室之上的理论巨著,而是真正能指导一线工作者解决实际问题的工具书。我从中学到的不仅是“如何做”,更是“为什么要以这种方式去做”。

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这是一本关于环境微生物学应用领域难得的佳作,虽然我对其中的具体技术细节尚在摸索阶段,但其宏观的框架和对前沿技术的梳理能力,确实让我受益匪浅。书中对不同环境样本,比如水体、土壤乃至空气中细菌群落的监测方法进行了系统性的阐述,这对我正在进行的一个关于城市污水处理厂微生物多样性变化的研究项目提供了极大的启发。我尤其欣赏作者没有仅仅停留在传统的培养基方法上,而是深入探讨了诸如宏基因组测序(Metagenomics)和实时定量PCR(qPCR)在环境细菌快速识别和丰度估算中的应用。例如,书中关于如何设计有效的引物来区分密切相关的细菌物种,以及如何处理复杂环境样本中DNA提取的低效性问题,都给出了非常实用的操作指南和注意事项。书中对数据分析部分的介绍也十分详尽,特别是如何利用生物信息学工具解读高通量测序数据,识别出影响环境健康的指示菌群,这些内容对我这种偏向实验操作,但在数据解读上略感吃力的研究人员来说,简直是雪中送炭。虽然篇幅较长,阅读起来需要一定的专业背景知识,但一旦掌握,无疑是打开了环境微生物监测领域的一扇大门,让人能够站在更高的视角去规划实验设计,避免走弯路。这本书绝不仅仅是一本操作手册,更像是一本融合了理论深度与实践广度的参考指南,强烈推荐给所有从事水质安全、土壤修复以及公共卫生微生物监测的同行。

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坦白说,当我翻开这本书时,最初的期望是能找到一套可以直接套用的“万能”实验SOP(标准操作流程),但事实证明,这本书的深度远超我的想象,它更侧重于“方法论的哲学”而非“操作步骤的堆砌”。书中对“环境”这个概念的界定就非常精妙,它不仅仅指自然界,更是扩展到了人造环境如生物反应器和生物膜系统。我特别关注了其中关于微生物生物膜形成和监测的章节,那部分内容对我理解管道腐蚀和生物污染的机制至关重要。作者巧妙地引入了时间序列分析的概念来追踪细菌群落的动态演变,而不是仅仅进行静态的快照式采样。这种动态监测的思维模式,让我反思了过去实验中只关注“有没有”而忽略了“如何变”的问题。书中对各种传感技术,比如基于电化学信号和光学特性的在线监测设备也有所涉猎,这为未来实现环境微生物的实时、自动化预警提供了理论基础。虽然部分涉及到高级统计模型的论述略显晦涩,需要反复阅读才能领会其深层含义,但这恰恰体现了其作为一本“方法论”著作的价值所在——它要求读者不仅要知道“做什么”,更要明白“为什么这么做”。对于希望将监测技术推向工业化和智能化应用的研究生和技术人员来说,这本书的指导意义无可替代。

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阅读这本书的过程,就像是经历了一次从基础微生物学到尖端环境生物技术的全面“再教育”。我注意到作者在介绍新兴的基于纳米技术的细菌捕获和检测方法时,措辞非常谨慎而专业,既展示了技术的潜力,也清晰指出了其在复杂基质中的局限性。这与某些过度宣传技术能力的书籍形成了鲜明对比。书中关于环境样本的标准化采集和保存规程的探讨,占了相当大的比重,这在实际工作中经常被忽视,但却是决定后续所有分析结果可靠性的基石。我发现作者对国际标准(如ISO或ASTM相关标准)的引用非常到位,这极大地提升了书中方法的“可迁移性”和“可验证性”。对于初入此领域的新手来说,这部分内容是建立严谨科学态度的绝佳教材。另外,书中对于数据质量控制的严格要求,比如对空白样本、阳性对照和阴性对照设置的详细指导,教会了我如何构建一个真正“干净”且可信的实验体系。总的来说,这本书的价值在于它构建了一个完整的质量保证和质量控制(QA/QC)的框架,使得环境细菌监测工作能够从“凭经验”走向“靠标准”,这对于推动整个行业的规范化至关重要。

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