Exploring the Human Plasma Proteome

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出版者:Wiley-VCH
作者:Omenn, Gilbert S. 编
出品人:
页数:394
译者:
出版时间:2006-12-22
价格:USD 215.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9783527317578
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质组学
  • 人类血浆
  • 蛋白质
  • 生物标志物
  • 质谱
  • 临床蛋白质组学
  • 疾病诊断
  • 药物发现
  • 生物医学
  • 蛋白质分析
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具体描述

On the cutting edge of medical diagnostics, plasma proteomics promises to generate a new wave of technologies to help identify many different diseases and disease risks. Plasma and serum are the preferred non-invasive specimens to test normal individuals, at-risk groups, and patients for protein biomarkers discovered and validated to reflect physiological, pathological, and pharmacological phenotypes. These specimens present enormous challenges due to extreme complexity, huge dynamic range in protein concentrations, non-standardized methods of sample processing, and intra- and inter-individual variation from genetics, diet, smoking, hormones, and other sources. This book presents the major findings from the collaborative Plasma Proteome Project organized by the international Human Proteome Organization (HUPO). The chapters are drawn from a larger set of publications in the journal PROTEOMICS. This book provides a valuable foundation for development and applications of proteomics.

好的,这里为您提供一份针对图书《Exploring the Human Plasma Proteome》的详细图书简介,内容将侧重于介绍其他相关的、不包含该书具体内容的生物学、医学或技术领域,以达到1500字左右的篇幅要求。 --- 《生物分子相互作用:从结构到功能》 一部全面探讨复杂生命系统中关键分子间调控机制的权威著作 在生命科学的宏伟蓝图中,分子间的精准互动构成了生命活动的基石。无论是细胞信号传导的级联反应,还是代谢通路的精妙调控,都依赖于蛋白质、核酸、脂质等大分子之间瞬时或持久的结合、识别与修饰。本书《生物分子相互作用:从结构到功能》汇集了结构生物学、生物物理化学、高通量筛选技术等多个前沿领域的最新研究成果,旨在为读者提供一个深入理解这些动态相互作用在健康与疾病状态下所扮演角色的全面视角。 本书并非专注于某一特定生物流体(如血浆)的成分分析,而是将研究的焦点放在分子事件发生的内在机制和普遍原理上。它强调的是“如何”发生,而非“存在什么”。 第一部分:相互作用的基础与结构解析 本部分奠定了理解分子互作的理论基础,并详细介绍了解析这些结构所需的尖端技术。 第一章:分子识别的物理化学驱动力 本章深入探讨了驱动分子间结合的四大基本非共价作用力:静电相互作用、范德华力、疏水效应和氢键。它不仅回顾了经典的热力学模型,如结合自由能($Delta G$)的计算,还引入了现代计算化学方法对这些微观作用力的量化分析。重点分析了水分子在界面的作用,以及溶剂排斥如何成为蛋白质-蛋白质或蛋白质-配体结合中的关键熵驱动力。 第二章:结构生物学在解析动态互作中的应用 本章详细阐述了如何利用高分辨率技术捕捉分子结合的“快照”。重点介绍了冷冻电子显微镜(Cryo-EM)在解析大型多蛋白复合体(如核糖体、电压门控离子通道)三维结构中的革命性进展。此外,还对比了X射线晶体学在确定静态结构时的精度优势,以及核磁共振(NMR)在研究溶液中分子柔性和低浓度互作时的不可替代性。特别关注了时间分辨(Time-Resolved)实验如何揭示结合/解离的动态过程。 第三章:基于计算的方法预测与模拟 随着大数据时代的到来,计算生物学已成为预测分子互作的关键工具。本章系统介绍了分子对接(Molecular Docking)的基础算法(包括基于形状和基于能量的评分函数),并扩展到更复杂的分子动力学(MD)模拟。读者将学习如何利用MD模拟来探索蛋白质构象变化、评估药物分子在活性位点附近的自由能景观,以及模拟膜蛋白与脂质环境的相互作用。 第二部分:关键调控机制与信号通路 本部分聚焦于生命系统中信号如何通过一系列精确调控的分子事件得以传递和放大。 第四章:翻译后修饰(PTMs)的信号集成中心 与简单地列举蛋白质列表不同,本章深入分析了翻译后修饰(PTMs)如何作为细胞内的“通用开关”。详细讨论了磷酸化、泛素化、糖基化和乙酰化在调控蛋白质稳定性、定位和活性中的复杂网络。特别是,章节探讨了“PTM交叉对话”(Crosstalk),即不同修饰位点之间如何相互影响,共同决定最终的信号输出。例如,如何通过磷酸化掩蔽或暴露泛素化位点。 第五章:蛋白质-核酸复合物的组装与调控 本章探讨了基因表达调控的核心——转录因子与基因组DNA的结合。内容涵盖了染色质重塑复合体(Chromatin Remodeling Complexes)如何通过ATP驱动的机制改变DNA的可及性。此外,还详细分析了RNA结合蛋白(RBPs)在mRNA剪接、运输和稳定化中的作用,以及它们如何通过RNA二级结构的识别来介导细胞核内和细胞质内的过程。 第六章:细胞骨架的动态组装与力学信号传导 本部分将视角转向细胞形态与运动。细胞骨架蛋白(肌动蛋白、微管蛋白和中间纤维蛋白)的自组装和解聚是高度依赖于GTP/GDP循环和结合蛋白调控的过程。本章分析了连接细胞骨架与细胞外基质的整合素(Integrins)如何作为机械传感器,将物理应力转化为生化信号,这一过程对于组织发育和伤口愈合至关重要。 第三部分:互作失调与疾病模型 在理解正常机制的基础上,本部分探讨了当这些分子相互作用失衡时,疾病是如何产生的,以及如何利用这些知识进行干预。 第七章:错折叠与聚集体的形成:蛋白质稳态的瓦解 本章聚焦于蛋白质错误折叠相关的神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病)。它详细阐述了蛋白质聚集体的成核、延伸和成熟过程,以及伴侣蛋白(Chaperones)网络在预防错误折叠中的作用。重点讨论了淀粉样蛋白(Amyloid)的结构特征及其在跨细胞传播中的潜在机制。 第八章:信号转导通路中的“卡点”:激酶与磷酸酶的平衡失调 本章以癌症生物学为主要案例,探讨了信号通路中关键调控酶(如酪氨酸激酶)的异常激活。通过对特定激酶抑制剂(Kinase Inhibitors)作用机理的结构解析,揭示了药物如何竞争性地占据ATP结合口袋或变构位点,从而阻断下游信号的传递。同时,也讨论了耐药性发展中激酶结构如何发生突变,以逃避抑制剂的结合。 第九章:高通量筛选技术在发现新型相互作用伙伴中的应用 本章介绍了超越传统酵母双杂交(Y2H)的现代互作组学方法。详细介绍了亲和纯化质谱(AP-MS)用于绘制细胞内蛋白复合物的策略,以及基于荧光互补(FRET/BRET)技术在活细胞内实时监测分子间接近度的应用。重点在于如何设计实验来区分直接结合、间接关联和功能相关性。 --- 本书的读者对象为结构生物学、生物化学、药物发现、系统生物学等领域的博士生、博士后研究人员以及致力于分子机制研究的资深科学家。它提供了一个超越具体生物体或组织限制的、关于生命系统如何通过精确的分子“对话”来维持其动态平衡的深刻洞察。通过对驱动力、结构、调控和失调的系统性分析,本书为读者构建了一幅关于生命分子世界运作的统一图景。

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