《水稻基因设计育种》系统地介绍了水稻转基因技术、花药培养、分子标记辅助育种和基因组辅助育种的基本原理和方法，阐述了水稻产量性状、抗病虫性、抗逆性状、营养品质和特异种质的遗传研究和分子育种的最新进展、水稻基因设计育种数据库建设及水稻基因设计育种的展望，反映了作者在水稻分子育种方面获得的成果。《水稻基因设计育种》共分十二章，各章节前后呼应，又独立成章，是一本涵盖了水稻转基因、花药培养和分子辅助选择及水稻重要性状的分子育种等多方面的理论和实践的最新参考书。
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