具体描述
表观遗传调控是后基因组时代分子生物学前沿的热点领域之一，而真核基因组DNA所在的染色质结构是各表观遗传调控途径的共同的汇聚点。本书介绍了相关领域研究的最新进展，首先介绍了从核小体基本结构到高度凝聚的异染色质结构的形成、特异标志及其在表观遗传调控网络中的作用；随后分别介绍了核心组蛋白的乙酰化、甲基化等多种修饰及其相互关系对基因转录前核小体的开关作用及其机制，以及依赖ATP的染色质重塑复合物参与的染色质结构的去阻遏或开放等染色质重塑过程；并介绍了真核基因组DNA的甲基化修饰以及小RNA介导的染色质凝聚等所导致的基因阻遏调控机制。此外还对各体系间的相互作用，以及与疾病的关系等进行了简要的介绍。
作者简介
目录信息
第一节 染色质的基本结构
一、染色质的基本单位——核小体
二、核小体的装配与相位
三、染色质高级结构
第二节 染色质结构域及其相关元件
一、染色质的结构域效应
二、染色质元件及其结合蛋白
第三节 染色质的修饰与结构重塑
一、染色质的修饰及其意义
二、染色质高级结构的分类和修饰特征
第四节 染色质与表观遗传调控网络
结束语
参考文献
第二章 核心组蛋白的修饰
第一节 组蛋白密码
一、组蛋白修饰与基因转录调控
二、组蛋白修饰的生理与病理意义
第二节 组蛋白乙酰化修饰
一、组蛋白乙酰基转移酶
二、天然核小体乙酰化复合物
三、组蛋白乙酰基转移酶和FAT
四、组蛋白去乙酰基酶
第三节 组蛋白甲基化修饰
一、组蛋白赖氨酸甲基化
二、组蛋白精氨酸甲基化
三、组蛋白去甲基化
第四节 组蛋白磷酸化
一、组蛋白H3磷酸化
二、组蛋白H2B磷酸化
三、组蛋白H2A和组蛋白H4的磷酸化
第五节 组蛋白其他类型修饰
一、组蛋白泛素化修饰
二、组蛋白SUMO化修饰
三、组蛋白生物素化修饰
第六节 组蛋白修饰的网络
一、组蛋白修饰的顺式相互作用
二、组蛋白修饰的反式相互作用
三、组蛋白甲基化与DNA甲基化之间的相互作用
结束语
参考文献
第三章 依赖于ATP的染色质重塑复合物
第一节 概述
一、染色质重塑复合物的组成
二、染色质重塑复合物的作用机制
三、染色质重塑复合物对基因转录的激活作用
四、染色质重塑复合物参与抑制基因的转录
第二节 SWI／SNF复合物家族
一、SWI／SNF复合物家族的组成
二、SWI／SNF复合物的结构域及功能
三、不同的SWI／SNF复合物提供特定的功能
第三节 ISWI复合物家族
一、ISWI复合物的功能
二、种类繁多的ISWI复合物
第四节 Mi-2复合物家族
一、Mi-2的功能特异性
二、MBD2、MBD3与DNA甲基化
三、MTA蛋白家族与Mi-2／NuRD的功能特异性
第五节 Ino80和SWRl染色质重塑复合物
一、lno80和SWRl重塑复合物的亚基组成
二、参与组蛋白的交换
三、参与DNA损伤断裂修复
第六节 ATP依赖的染色质重塑复合物与其他染色质重塑机制的联系
一、重塑机制协同激活转录
二、重塑机制协同抑制转录
结束语
参考文献
第四章 真核基因组DNA的甲基化修饰
第一节 甲基化的基本概念
一、原核生物甲基化现象
二、真核生物胞嘧啶甲基化
第二节 DNA甲基化对真核基因表达调控的作用
一、DNMT家族介导转录抑制活性
二、MBD家族介导的转录阻遏机制
三、DNA甲基化排斥转录因子
四、DNA甲基化和组蛋白修饰协同参与转录调控
第三节 DNA甲基化在重大生命活动中的调控作用
一、DNA甲基化在重要生理活动中的调控作用
二、DNA甲基化在疾病中的调控作用
第四节 甲基转移酶抑制剂在肿瘤治疗中的作用
结束语
参考文献
第五章 RNA与染色质
第一节 RNA干扰及其机制
一、RNA干扰的转录后沉默
二、siRNAs与miRNAs的联系和区别
第二节 RNAi介导的转录水平沉默
一、RNA指导的DNA甲基化
二、依赖RNAi的异染色质形成
第三节 RNA干扰的应用
一、RNA干扰在基因功能研究上的应用
二、RNA干扰在医药科学上的研究及应用前景
结束语
参考文献
附录辅助阅读材料
一、染色质免疫沉淀分析
二、全基因组定位技术
三、核小体相位分析
四、染色质DNA酶I高敏感位点的检测
五、体内DNA足迹法
六、体外染色质装配
七、分离组蛋白变异体及修饰异构体
八、电泳迁移率变更检测法
九、DNA甲基化检测方法
十、RNA干扰技术
十一、染色质构象捕获技术
索引
· · · · · · (收起)
读后感
评分
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用户评价
我发现这本书在跨学科的整合运用上做得尤为出色。它不仅仅局限于生物化学的范畴，而是巧妙地引入了物理学中关于拓扑学和统计力学的概念，来解释DNA在核内的缠绕和空间组织。那种将生物大分子系统视为一种自组织复杂系统的视角，为理解遗传信息的“存储”和“提取”提供了全新的解读维度。书中对计算生物学工具在解析大规模测序数据中的应用也有精彩的论述，展示了大数据如何反哺和指导实验设计。比如，在处理涉及组蛋白修饰模式的全基因组关联研究时，作者们清晰地展示了如何从海量数据中筛选出具有生物学意义的信号，并进一步设计实验去验证这些预测。这种理论与工具的结合，让这本书不仅仅是停留在对现有知识的总结，更像是对未来研究方向的导航图。对于有志于从事生物信息学或系统生物学研究的年轻学者来说，这本书无疑是一份极具启发性的参考资料。
评分这本书的写作风格颇具古典学术风范，语言严谨而富有逻辑的递进性，读起来更像是在跟随一位经验丰富的大师进行深度研讨会。它没有过多的花哨比喻或煽情的叙述，所有的论点都建立在坚实的实验数据和无可辩驳的生物学原理之上。我尤其欣赏它在方法论上的坦诚——对于尚存争议或实验局限性的地方，作者们也毫不避讳地指出来，这使得整本书的论述显得异常可靠和公允。对于那些渴望掌握学科前沿动态，并试图构建完整知识体系的读者而言，这本书提供了极佳的框架。它引导读者不仅要知道“是什么”，更要深究“为什么”和“如何证明”。在讨论涉及基因组稳定性的章节时，那种层层剥茧，将看似随机的分子事件纳入精确数学模型的尝试，展现了极高的学术水准。阅读这本书需要投入大量的时间和精力去消化那些复杂的生化路径图，但回报是建立在扎实的理论基础上的深刻理解。
评分这本著作的结构安排非常精妙，它采用了从宏观到微观，再回归到病理生理学的螺旋上升结构。开篇宏大叙事地勾勒出细胞核的物理环境，随后逐步聚焦到染色质纤维的组装，接着深入到单个核小体的精确结构与功能，最后落脚于这些基础机制在细胞分化、衰老乃至疾病发生发展中的具体体现。这种布局的好处是，即使读者在中间某个技术细节上卡住了，也不会完全迷失方向，因为更高层级的概念始终作为锚点存在。特别是关于表观遗传标记的“记忆”如何在细胞周期中传递的那一章，作者用非常清晰的逻辑链条，串联起了化学修饰、空间重塑和基因沉默的复杂互动，让人豁然开朗。它成功地将那些分散在不同领域的知识点编织成了一张有机的网络，展现了生命现象的整体性与统一性。
评分最近读完了一本关于分子生物学前沿的专著，那厚厚的篇幅和密集的图表，着实让我体验了一把“硬核”的滋味。这本书聚焦于生命体内部信息传递的微妙机制，尤其是那些在基因组层面起着“总开关”作用的分子机器。它并非停留在教科书式的基础概念梳理，而是深入剖析了DNA复制、修复以及转录调控中那些尚未完全解开的谜团。比如，书中详尽阐述了如何利用先进的成像技术，实时捕捉核内染色质结构的三维动态变化，这对于理解基因表达的瞬时性和环境响应性至关重要。作者们似乎对每一个蛋白复合物的每一个亚基都了如指掌，用极其精密的实验设计，一步步揭示了宏观遗传现象背后的微观物理化学基础。阅读过程就像在攀登一座知识的高峰，每攻克一节难点，视野就开阔一分，让人由衷敬佩科学家们严谨细致的探索精神。那种将复杂过程拆解到原子级别的叙事方式，极大地满足了我对生命科学底层逻辑的好奇心。
评分从一个纯粹的阅读体验角度来看，这本书的排版和插图质量非常高，这是高质量学术专著的标志。那些展示复杂分子机器三维结构的图谱，细节之丰富、清晰度之高，令人赞叹，它们极大地降低了理解那些极其复杂的空间关系时的认知负荷。我发现自己很多次不得不停下来，仔细端详那些蛋白质-DNA相互作用的细节图，才能真正理解作者描述的分子对接过程。此外，书中对特定实验技术（如染色质免疫沉淀测序ChIP-seq的优化步骤）的描述，细致到令人觉得可以直接拿去搭建自己的实验室流程。虽然内容深度要求读者具备扎实的分子生物学背景，但作者们对每一个关键术语和概念的界定都力求精确无误，使得专业术语的“学习曲线”虽然陡峭，但方向明确。总而言之，这是一部集学术深度、技术前沿和精美呈现于一体的典范之作。
评分表观入门神书。
评分表观入门神书。
评分表观入门神书。
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