分子生物学的理论物理途径

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出版者:
作者:罗辽复
出品人:
页数:602
译者:
出版时间:2004-9
价格:108.00元
装帧:简裝本
isbn号码:9787532374793
丛书系列:
图书标签:
  • 生物物理
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具体描述

已出版的中文版《生命进化的物理观》是理论生物学领域的一部重要的学术著作,作者结合自己潜心转向生命科学研究十几年的学术成果,用物理学的观点和方法,提出和讨论了生命进化的一系列重大问题,如生物分子手性的起源和进化,遗传密码的起源和进化,核酸、蛋白质序列的进化和有关的信息学研究等。

本书(英文版)将以此中文版为基础,新增“序列——结构——功能”一章,讲述从结构到功能的几个途径。同时,作者将结合国际上这一领域的最新发展对中文版内容作了适当更新。

图书简介:生物物理学的基石与前沿 书名: 生物物理学的基石与前沿 作者: [此处留空,可根据实际情况填写] 出版社: [此处留空,可根据实际情况填写] 出版年份: [此处留空,可根据实际情况填写] --- 引言:生命现象的物理学视角 生命世界充满了奇妙的现象,从DNA的双螺旋结构到细胞内复杂的信号网络,无不遵循着基本的物理定律。传统生物学着重于描述“是什么”和“如何发生”,而本书则致力于探讨“为什么会是这样”,即从物理学的基本原理出发,揭示生命系统的深层机制。 《生物物理学的基石与前沿》旨在为读者构建一个全面且深入的生物物理学知识框架。本书超越了单纯的现象描述,深入到分子、亚细胞器乃至整个细胞层面,运用经典力学、热力学、统计力学、电磁学以及现代量子力学等工具,解析生命过程中的能量转换、结构形成、动态平衡与信息传递。 本书的独特之处在于,它不仅仅是理论概念的堆砌,更注重将这些理论应用于实际的生物学问题,通过严谨的数学建模和定量的分析方法,展现物理学在理解生命复杂性上的强大解释力。 第一部分:生物系统的热力学与统计力学基础 生命活动是一个持续消耗能量并有序进行的过程,其本质是远离平衡态的开放系统。本部分将从热力学的基本定律出发,构建理解生物系统的理论基石。 第一章:生命系统的能量学:从化学到功 本章首先回顾了热力学第一、第二定律在生物系统中的应用,特别是对自由能($Delta G$)的精确计算与理解。我们将探讨ATP水解的能量驱动力,以及生物化学反应的平衡常数与反应速率之间的关系。重点讨论非平衡态热力学的概念,解释生命系统如何通过维持梯度和耗散能量来维持自身的稳态和有序性。内容包括麦克斯韦-玻尔兹曼分布在分子运动中的应用,以及吉布斯自由能如何在分子识别和组装中起决定性作用。 第二章:分子组装的统计力学:随机性与必然性 生命结构的高度特异性往往是在大量随机热力学涨落中被筛选和固化的。本章深入讲解统计力学如何描述宏观生物结构(如蛋白质折叠、膜的形成)的微观基础。内容涵盖配分函数(Partition Function)的建立,蒙特卡洛模拟方法在构象搜索中的应用,以及集合论在描述蛋白质多重稳定态时的必要性。我们还将探讨熵(Entropy)在分子间相互作用和去折叠过渡中的复杂角色。 第三章:扩散、漂移与细胞内的动态运输 细胞内环境并非静止的,分子间的布朗运动和定向运输构成了生命活动的基础。本章侧重于扩散方程(Fick's Laws)在描述物质在细胞质或核内传输中的应用。我们将详细分析爱因斯坦关系式(Einstein Relation)如何连接扩散系数与温度、粘度,并引入Nernst-Planck方程来描述带电分子在电化学梯度驱动下的跨膜运输过程,为理解离子通道和转运蛋白的工作机制打下基础。 第二部分:生物结构与机械:刚性、柔韧与形变 生命体的结构具有高度的材料特性,它们必须在保持稳定性的同时具备必要的柔韧性以适应环境变化和执行功能。本部分聚焦于生物大分子的结构力学和宏观生物体的生物力学。 第四章:蛋白质与核酸的弹性力学 本章将蛋白质和核酸视为复杂的软物质。首先分析弹性理论在描述分子伸缩和弯曲行为中的应用,包括胡克定律在肽链拉伸中的修正形式。重点探讨高分子物理学中的理想链模型与真实链模型(如Debye-Hückel理论在核酸中的应用)。我们使用有限元分析(FEA)的简化思路,来预测极端条件(如剪切力、拉伸)下生物聚合物的构象变化和稳定性。 第五章:生物膜的流体力学与界面张力 细胞膜是生命活动的边界,其流体镶嵌模型(Fluid Mosaic Model)的物理基础是膜的界面性质。本章深入研究界面张力和弯曲刚度对膜拓扑结构(如囊泡形成、出芽)的影响。内容包括Young-Laplace方程在描述膜的静力学平衡中的应用,以及拓扑学概念在理解细胞分裂和膜融合事件中的角色。此外,还将探讨膜蛋白嵌合体如何影响局部流变学性质。 第六章:生物机械:从细胞骨架到组织应力 本章将视角扩大到细胞和组织层面,探讨生物力学如何塑造形态。详细分析肌动蛋白、微管和中间纤维网络的力学特性,使用粘弹性模型(如Kelvin-Voigt或Maxwell模型)来描述细胞对外部形变的响应。我们将探讨牵张力(Tension)在细胞迁移、细胞粘附和组织发育中的信号转导作用,并介绍原子力显微镜(AFM)在原位测量分子尺度力学参数的方法学基础。 第三部分:信息、信号与量子效应 生命系统本质上是信息处理系统,其准确性依赖于精密的分子识别和能量转换过程,其中可能涉及量子效应。 第七章:分子识别的电磁与静电相互作用 分子间的特异性结合(如酶与底物、抗原与抗体)主要由电磁力驱动。本章详细分析库仑相互作用、范德华力以及氢键的定量描述。重点讲解泊松-玻尔兹曼方程(Poisson-Boltzmann Equation)在计算蛋白质表面电势分布和离子屏蔽效应中的应用,解释高盐环境对分子结合亲和力的影响机制。 第八章:信号传导的动力学:反应-扩散系统 细胞信号的快速传播和空间定位依赖于化学反应和空间扩散的协同作用。本章分析反应-扩散方程(Reaction-Diffusion Equations),特别是Turing模式,如何解释形态发生过程中自组织波纹和斑点结构的形成。我们将研究反馈回路(Positive and Negative Feedback)在信号放大和振荡中的作用,并将这些系统作为非线性动力学方程的实例进行探讨。 第九章:生物系统中的光学与量子基础 虽然生命过程宏观上遵循经典物理,但分子层面的能量捕获和传递(如光合作用、酶催化)可能涉及量子隧穿和激发态动力学。本章概述过渡态理论和密度泛函理论(DFT)在计算酶反应势垒中的基础应用。我们还将探讨生物发光和荧光探针的物理原理,聚焦于光物理学如何帮助我们实时监测细胞内的物理状态变化。 结论:整合性挑战与未来展望 本书最后一部分总结了当前生物物理学面临的重大挑战,例如如何将多尺度模型进行有效耦合,以及如何将信息论引入对生命复杂性的量化描述。本书强调,未来的生物物理学研究必须走向高度跨学科的整合,物理学的精确量化语言是破解生命终极奥秘的关键钥匙。 本书特色: 理论深度与应用广度兼具: 既有严谨的理论推导,又配有大量的生物学案例支撑。 强调定量分析: 所有概念均辅以必要的数学模型和定量工具,鼓励读者进行计算性思维。 面向前沿: 涵盖了软物质物理、复杂系统科学在生命科学中的最新交叉点。 本书适合高等院校的物理学、生物学、化学以及生物工程专业的学生、研究人员和希望从物理学角度深入理解生命的科研工作者阅读。

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读后感

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用户评价

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坦率地说,这本书的某些章节让我感到一种近乎于震撼的认知冲击,尤其是在探讨遗传信息传递的随机性和精确性之间的辩证关系时。作者似乎找到了一个完美的平衡点,既承认了热力学涨落的必然性,又论证了生物系统如何通过耗散和反馈机制,有效地“驯服”了这种随机性,从而实现了高度稳定的遗传信息复制。这种处理方式,与我以往接触的许多偏向于分子机制的生物学著作形成了鲜明的对比。在这里,每一个酶的催化循环,都被置于一个开放系统的热力学框架内进行分析,这使得对“效率”和“保守性”的讨论,从经验性的观察,升华为具有普遍意义的物理约束。书中对自催化循环的非线性动力学分析尤为精彩,它展示了从无序到有序的跃迁,如何由简单的能量梯度驱动。这本书的价值不在于提供即时的实验操作指南,而在于它提供了一套全新的、更底层的逻辑工具箱,用于解析那些看似“神奇”的生物现象。

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这是一部极度烧脑的著作,它不适合在咖啡馆里随便翻阅,而是需要在一个安静、甚至有些清冷的实验室角落里,配上大量的空白纸张和计算工具才能进行深度阅读。我花了好几个下午才勉强消化了其中关于生物大分子在复杂流体环境中的有效场论描述。作者的行文风格极其简练,几乎没有多余的铺垫,直接切入核心的数学构建。例如,对核酸动力学的处理,采用了高维相空间分析的方法,将碱基对的相互作用视为一种复杂的量子或半经典相互作用的集体激发。尽管这种处理方式在计算上可能是天文数字般的复杂,但其理论上的完备性令人信服。我个人认为,这本书最大的贡献在于它成功地将“随机行走”的概念,提升到了描述生命宏观功能的关键机制层面。它迫使我们正视,在最微小的尺度上,生命不过是一系列被精心调控的统计学事件。

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这本书在我心中的地位,更像是一份“蓝图”而不是一本“教程”。它描绘了一种理想化的、完全基于物理学的生命图景,其野心可见一斑。我最欣赏的是作者在处理“涌现”问题时的谨慎和深入。他没有简单地宣称“生命就是物理”,而是详尽地展示了,当分子数量达到某个临界点,并且系统被置于远离热力学平衡的特定条件下时,如何从基础的牛顿力学或量子力学方程中“涌现”出我们所观察到的生物学特性。特别是对于膜蛋白组装的讨论,作者避开了传统的结构生物学描述,转而运用界面张力和液晶相变的模型来解释通道蛋白的动态开放与关闭。这种超越传统生物学范畴的分析视角,使得这本书不仅仅是对现有知识的总结,更像是一份对未来研究方向的深度预言。它为那些希望在基础物理和复杂系统理论上寻找突破口的生物学家,指明了一条充满挑战但极具潜力的道路。

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这本书的叙述风格异常的雄辩且充满哲学思辨的味道,读起来就像在听一位大师级别的物理学家娓娓道来他对生命的理解。它不是一本典型的教科书,缺乏那种循规蹈矩的章节划分和公式罗列,反而更像是一部理论宣言。作者在开篇就提出了一系列颇具争议性的观点,比如将生命系统的耗散结构视为一种特殊拓扑相变的体现。这种宏大叙事的能力令人叹服,它将分子尺度的随机运动,提升到了宇宙热力学演化的宏观背景下进行考量。我特别关注了其中对“活性”和“功能”的物理定义尝试。在传统的生物学中,这些概念往往是经验性的,但在书中,它们被赋予了明确的哈密顿量或拉格朗日量形式,这无疑是极具挑战性的工作。虽然有些论证略显晦涩,需要读者具备扎实的理论物理背景才能完全领会其精髓,但正是这种学术上的“高冷”和严谨,赋予了这本书不朽的价值。它不是给初学者准备的,而是给那些渴望在理论高峰上俯瞰生命全景的思考者准备的。

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这本《分子生物学的理论物理途径》的标题本身就充满了诱惑力,让人不禁想一探究竟。我作为一名长期在生物物理领域摸索的研究者,对这种跨学科的尝试总是抱有极大的期待。首先,这本书在方法论上的创新性令人印象深刻。它似乎不仅仅停留在对生物现象的定性描述或现象学总结,而是试图深入到分子层面,运用严格的数学模型和物理原理来构建一个更具预测性的框架。例如,在蛋白质折叠动力学的探讨中,作者没有满足于传统的能量景观理论,而是引入了非平衡态统计力学和场论的概念。这种深度的理论介入,无疑为理解生命活动的本质提供了全新的视角。我尤其欣赏其中对于信息熵如何在分子机器中进行有效编码和解码的讨论,这部分内容显示了作者深厚的物理学功底,并将抽象的物理概念巧妙地与生物学的具体问题对接起来,使得原本看似难以量化的生物过程,有了一套坚实的数学语言作为支撑。这本书的阅读过程,与其说是在学习生物学,不如说是在经历一场智力上的探险,它挑战了我们对传统学科边界的认知,迫使我们用更底层的物理规律去重新审视生命现象。

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