探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学

探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学 pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:科学分社
作者:(美)A.马尔科姆·坎贝尔等著;孙之荣
出品人:
页数:454
译者:孙之荣
出版时间:2004-1
价格:58.00元
装帧:
isbn号码:9787030129215
丛书系列:
图书标签:
  • 生物
  • 生物信息学
  • 生命科学
  • 科学
  • 科普
  • 教材
  • 遗传学、分子生物学
  • 专业
  • 基因组学
  • 蛋白质组学
  • 生物信息学
  • 分子生物学
  • 遗传学
  • 生物技术
  • 数据分析
  • 基因编辑
  • 高通量测序
  • 计算生物学
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具体描述

《探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学(翻译版)》涉及基因组学、蛋白质组学和生物信息学等生命科学研究领域中的热点问题。将网络训练与与问题解决方式相结合。《探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学(翻译版)》是第一本将网络训练与问题解决方式相结合的、训练学生基本的基因组学分析能力的教材。作者提出普遍的问题,并提供学生基因组分析的工具来检测其答案,并鼓励发展认真思考的技巧。生物芯片等相关图片不仅在书中有,也可随书免费赠送的光盘中得到。本书有与之相配的网站,学生可从中学习到前沿新知,看到复杂的实验过程。

《古建筑的秘密:结构、材料与传承》 内容简介 本书深入剖析了人类文明史上那些沉默的石头与木头的叙事者——古建筑。我们不关注宏大的历史年代划分,而是将目光聚焦于那些构成建筑生命本身的微观与宏观要素,探寻它们如何在时间的洪流中保持着令人敬畏的稳定与美学价值。全书分为四个主要部分,层层递进,旨在为读者构建一个全面而精细的古建筑知识图谱。 第一部分:结构的骨骼——力学智慧的千年沉淀 本部分着重探讨古建筑赖以生存的结构体系,揭示其内在的力学逻辑。我们将详细考察不同地域和文化背景下的主流结构形式,如中国的榫卯系统、欧洲的拱券与飞扶壁、中东地区的穹顶技术等。 榫卯的精妙艺术: 榫卯并非简单的木件对接,而是一套精密的“无钉连接”系统。我们将细致解析“卯眼”与“榫头”的几何学匹配,探讨木材在不同湿度下的膨胀与收缩如何被这套系统巧妙地吸收与平衡。特别地,书中将引入对传统木构架“抬梁式”与“穿斗式”的结构应力分析,使用现代有限元分析的思路反推古匠人的经验智慧——如何在没有现代计算工具的情况下,通过层层递进的梁架结构,将屋顶巨大的荷载均匀地分散到柱基之上。我们不仅描述“是什么”,更追溯“为什么这样设计”的内在原因,如抗震性能的优化。 拱、券与张力网络: 对于石制或砖砌结构,本书将重点解析拱券的形成原理。不同于梁的受压,拱券利用了材料的抗压优势。我们将剖析半圆拱、尖拱(哥特式建筑的关键)以及筒形拱在承重过程中的受力路径,解释“拱心石”如何成为整个体系的平衡点。对于大型石制穹顶,如拜占庭和文艺复兴时期的杰作,我们将讨论如何利用“帆拱”或“斗拱替代结构”将圆形基座转化为方形或多边形墙体上的稳定支撑,这是跨越空间几何的伟大创举。 基础的隐秘: 建筑的稳定始于足下。我们将考察古代工匠如何根据地质条件选择基础形式,例如中国传统建筑中常见的“散水”与“条石基础”,以及罗马万神殿基础中对混凝土混合物的精确配比,这些都是关于地基工程学的早期实践。 第二部分:生命的皮肤——材料的地域性与耐久性 古建筑的寿命与其所用材料的特性息息相关。本部分致力于解构建筑的“血肉”,探讨材料的采集、处理与耐久性之间的辩证关系。 木材的驯化: 选材是建筑的起点。本书将系统梳理不同地域的优势木材,如中国的楠木、杉木,欧洲的橡木。重点在于材料的“陈化”过程——木材在砍伐后如何通过特定方式(如风干、浸泡、炭化)去除内部水分与树脂,从而提高其抗腐蚀性与抗虫蛀能力。我们还会探讨传统木材防腐工艺,如使用桐油、生漆或石灰浆进行的表面保护。 石材的雕琢与选配: 石材的耐久性源于其矿物组成和晶体结构。本书将区分花岗岩、砂岩、石灰岩的物理特性,并解释为何在不同气候带,工匠会选择特定的石材。例如,在潮湿多雨的地区,致密且抗酸雨侵蚀的石材是首选。此外,书中将详细介绍石材的“顺纹切割”原理,即切割方向必须与石材的天然层理方向一致,以最大化其抗裂强度。 粘合与填充的艺术: 砖石建筑中的“灰浆”绝非简单的水泥替代品。我们将探究古老的“火山灰灰浆”(如罗马混凝土)的配方奥秘,以及中国传统建筑中使用的糯米灰浆(利用淀粉分子与熟石灰反应生成的强韧结合剂)。这些有机与无机的结合,赋予了建筑超越现代简单水泥砂浆的柔韧性与渗透性。 第三部分:文化的表皮——装饰语汇与符号逻辑 建筑的表面是其文化身份的载体。本部分将超越结构本身,解读覆盖在结构之上的装饰层所蕴含的社会学、宗教哲学和审美取向。 色彩的谱系与限制: 从埃及神庙的矿物颜料到中国宫殿的朱红与琉璃蓝,色彩的使用并非随意。我们将分析不同文明对特定色彩的哲学或宗教赋予,以及颜料的稀有性如何影响其在建筑中的应用等级。书中还会探讨矿物颜料(如群青、朱砂)的化学稳定性及其在特定光照条件下的表现。 浮雕与叙事: 无论是希腊神庙上的神话浮雕,还是印度寺庙中层层叠叠的雕刻,装饰元素都是非文字的叙事工具。本书将分析浮雕的“线脚组合”如何引导观者的视线,以及不同纹样(如几何纹、植物纹、动物纹)所代表的地域性保护神话或社会阶层标志。 空间序列的心理学: 建筑的入口、中庭、圣所或大殿,它们之间的过渡构成了体验的序列。我们将研究古典建筑中“轴线对称性”如何营造权威感与秩序感,以及在不同文化中,这种序列如何引导参与者进入一种特定的心理状态(如敬畏、冥想或庆典)。 第四部分:时间的磨砺——保护、修复与可持续性 古建筑的“存续”本身就是一项复杂的工程。本部分聚焦于如何科学地管理和维护这些易朽的文化遗产。 病理学的诊断: 在修复前,必须理解损伤的成因。我们将详细分类古建筑的常见病害,包括:木构件的内腐与白蚁侵蚀(着重于识别早期迹象);砖石结构的盐碱析出与冻融循环(分析水迁移路径);以及地基沉降导致的结构错位。书中将介绍非侵入性检测技术,如超声波探伤、红外热成像在古建筑健康监测中的应用。 “新陈代谢”的修复哲学: 修复的核心争议在于“新”与“旧”的平衡。本书推崇“最小干预原则”,强调在更换受损构件时,应尽量使用与原材料特性相匹配的材料,并确保新的组件能够融入现有结构的力学网络,而非成为新的薄弱环节。我们将对比“复原”(恢复到某一历史阶段)与“保守”(维持现状并阻止进一步衰败)两种主流修复理念的优劣。 气候适应性维护: 现代环境变化对古建筑提出了新挑战。如何管理古建筑周围的微气候,控制湿度与通风,以减缓材料老化速度,是可持续维护的关键。本书将提供基于气象数据的长期维护策略建议,确保这些跨越千年的结构能够平稳地走向未来。 《古建筑的秘密:结构、材料与传承》旨在提供一种跨学科的视角,它不仅是献给建筑史学家的读物,更是面向所有热爱精湛工艺与深厚历史底蕴的读者的实践指南。它揭示了在缺乏先进科技的时代,人类如何凭借细致的观察、严谨的实践和对自然的深刻理解,创造出超越时间限制的永恒之作。

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读后感

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阅读这本书的过程,就像是在攀登一座巍峨的山峰,每翻开一页,都仿佛又向前迈进了一步,看到了更广阔的风景。书中关于基因组学部分,对不同物种基因组的结构和演化历程的探讨,让我惊叹于生命体之间千丝万缕的联系。它不是简单地列举基因序列,而是深入分析了基因的组织方式、非编码区域的功能,以及染色体重塑如何影响基因表达。例如,书中对启动子、增强子和沉默子等调控元件的介绍,虽然语言严谨,但通过图示和一些经典的案例研究,让我得以理解基因表达并非一成不变,而是受到复杂网络调控的。特别是关于表观遗传学的内容,如DNA甲基化和组蛋白修饰,它们如何不改变DNA序列本身却能影响基因功能,这一点让我感到尤为震撼。书中还提到了基因组学在疾病诊断和治疗方面的应用,比如利用基因芯片筛查遗传病,以及靶向药物的研发,这些都让我看到了科学研究的实际价值和对人类健康的深远影响。此外,书中对不同研究方法的介绍,从早期的限制性内切酶分析到如今的CRISPR-Cas9技术,都展现了基因组学领域的飞速发展。即便有些技术细节我无法完全理解,但其背后所蕴含的科学思想和研究逻辑,却深深地吸引着我,让我渴望进一步探索。

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这本书的封面设计就足够吸引人,那种深邃的蓝色背景,点缀着错综复杂的DNA链和蛋白质结构图,仿佛预示着一场即将到来的科学探索之旅。拿到手中,沉甸甸的质感也让人感到安心,这不仅仅是一本书,更像是一本沉淀了无数智慧的宝典。我迫不及待地翻开第一页,虽然我并非基因组学、蛋白质组学或生物信息学领域的专业人士,但书中的一些初步介绍,如对基因组测序技术发展历程的简要回顾,以及蛋白质多样性与功能的初步解读,都让我对这些庞大而复杂的概念产生了初步的认识。例如,书中对Sanger测序法和高通量测序技术的对比描述,虽然篇幅不长,却清晰地勾勒出了技术进步带来的革命性变化。它没有直接跳入晦涩的术语,而是循序渐进,通过一些生动的比喻,比如将基因组比作一本巨大的生命之书,蛋白质比作执行书中指令的各种“工人”,让我这个外行人也能窥见其核心思想。我还特别留意到书中对生物信息学在数据处理和分析方面作用的初步阐述,虽然具体的算法和模型并未深入讲解,但其强调的“数据驱动”的科学研究范式,以及如何利用计算工具来解锁生命奥秘,让我对这个新兴学科充满了好奇。总的来说,即使是初步的阅读体验,也让我感觉这本书的作者并非只是简单地堆砌知识点,而是真正地在引导读者,一步步地走进这个迷人的科学世界,为后续更深入的学习打下了良好的基础。

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生物信息学作为连接基因组学和蛋白质组学的重要桥梁,在书中占据了不可忽视的篇幅。它就像一个强大的工具箱,为理解海量生命数据提供了各种解决方案。书中对生物信息学在序列比对、基因预测、系统发育分析等方面的应用进行了详细阐述。我尤其被书中关于数据库的介绍所吸引,例如GenBank、UniProt等,这些庞大的信息资源是进行生命科学研究的基石。书中还提到了各种生物信息学算法,如BLAST算法在序列相似性搜索中的作用,以及HMMER在蛋白质家族识别中的应用。虽然我并非算法专家,但通过书中对这些算法工作原理的通俗讲解,我得以理解它们是如何高效地从海量数据中提取有价值信息的。此外,书中还探讨了生物信息学在基因组注释、蛋白质结构预测以及分子动力学模拟等方面的应用,这些都让我看到了计算机科学与生命科学交叉融合的巨大潜力。我特别关注书中关于大数据分析和机器学习在生物信息学中的应用,这预示着未来的生命科学研究将更加依赖于强大的计算能力和智能算法,从而加速科学发现的进程。

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蛋白质的折叠和功能实现,是生命活动中最具魔幻色彩的篇章之一,而这本书恰恰将这部分内容展现得淋漓尽致。书中对蛋白质三维结构的形成过程,以及各种影响因素的探讨,让我对蛋白质这种“生命的分子机器”有了更深刻的理解。它不仅仅是简单地介绍α-螺旋和β-折叠等二级结构,更是深入到三级和四级结构的形成机制,以及蛋白质如何通过精确的折叠来实现其特定的生物学功能。书中还提到了蛋白质在细胞内的定位和转运,以及它们如何与其他分子形成复杂的调控网络,参与到各种生命过程中,比如酶催化、信号转导和细胞运动等。我尤其对书中关于蛋白质错误折叠与疾病的关系的讨论非常感兴趣,比如阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病,都与蛋白质的异常聚集有关,这让我看到了研究蛋白质结构和功能的重要性。此外,书中还介绍了如何利用生物物理学和生物化学的方法来研究蛋白质的结构和功能,比如X射线晶体学、核磁共振波谱学以及冷冻电子显微镜等技术,这些先进的实验手段为我们揭示蛋白质的奥秘提供了可能。

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蛋白质组学的部分,无疑是这本书中最具挑战性也最令人着迷的部分之一。它不再局限于单个基因的层面,而是将视角放大到整个蛋白质网络。书中对蛋白质结构、功能以及它们之间相互作用的深入探讨,让我对生命活动的精细调控有了更深的认识。我尤其对书中关于蛋白质翻译后修饰的章节印象深刻,如磷酸化、糖基化和泛素化等,这些修饰如何极大地丰富了蛋白质的功能,使得单一基因可以产生多种功能的蛋白质,这种复杂性令人叹为观止。书中还详细介绍了各种蛋白质组学研究的技术,例如质谱技术在鉴定和定量蛋白质中的应用,以及蛋白质芯片在研究蛋白质功能和相互作用方面的优势。通过书中提供的图表和案例,我得以了解研究人员是如何解析蛋白质复合物的构成,以及如何绘制蛋白质相互作用网络图的。这些内容虽然专业性很强,但作者巧妙地将复杂的概念分解,并且强调了蛋白质组学在药物研发、疾病标志物发现以及理解细胞信号通路中的重要作用。我对书中关于如何利用蛋白质组学数据来理解疾病发生机制的部分特别感兴趣,这让我看到了科学研究如何能够为攻克疑难杂症提供新的思路和方法。

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生物信息学在处理海量数据和挖掘生物学意义方面所扮演的角色,在这本书的篇章中得到了充分的体现。书中关于系统生物学方法的介绍,让我认识到如何将基因组学、蛋白质组学等不同维度的数据整合起来,构建出模拟细胞或生物体整体行为的模型。它不仅仅是简单的分析单个基因或蛋白质,而是试图理解它们之间如何相互作用,形成复杂的网络,从而对生命系统的功能进行更全面的预测和理解。书中对网络分析和可视化技术的介绍,让我得以看到研究人员是如何将复杂的生物学关系转化为直观的网络图,从而发现隐藏在数据中的规律和模式。我特别关注书中关于机器学习和人工智能在生物信息学中的应用,比如如何利用这些技术来预测基因功能、识别药物靶点,甚至设计新的蛋白质。这让我看到了未来生物信息学将更加智能化和自动化,能够极大地加速生命科学的研究进程。同时,书中也强调了数据共享和标准化在生物信息学领域的重要性,只有开放的数据和统一的标准,才能促进跨学科的合作和知识的传播。

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这本书在探讨基因组学与疾病的关系时,深入浅出地展现了基因与环境的互动作用。它不仅仅停留在基因突变是疾病原因的简单论断,而是将研究的视角拓展到基因-环境交互作用的复杂层面。书中通过一些多因素遗传性疾病的案例,比如心脏病、糖尿病和某些癌症,来阐述遗传易感性如何与生活方式、饮食习惯、环境暴露等因素相互作用,最终导致疾病的发生。我尤其被书中关于基因多态性与药物反应的研究所吸引,这为理解为什么不同个体对同一种药物的反应差异如此之大提供了科学解释,也为精准用药和个体化治疗奠定了基础。书中还提到了基因组流行病学,它如何利用大规模的基因组数据来研究疾病在人群中的分布规律和影响因素,从而为公共卫生政策的制定提供科学依据。此外,书中对基因编辑技术(如CRISPR-Cas9)在疾病治疗和预防方面的潜力进行了探讨,虽然这项技术仍面临伦理和技术上的挑战,但其为攻克遗传性疾病带来的希望是巨大的。

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生物信息学作为分析和解读生命数据不可或缺的工具,在这本书的论述中扮演着至关重要的角色。书中对生物信息学在基因组注释、功能预测和蛋白质结构预测等方面的应用进行了详细的介绍,它就像一个“解译器”,能够将原始的DNA和蛋白质序列转化为具有生物学意义的信息。我尤其被书中关于数据库的介绍所吸引,例如NCBI、Ensembl等,这些庞大的公共数据库为研究人员提供了海量的基因组、蛋白质和文献信息,是进行科学研究的宝贵资源。书中还详细讲解了常用的生物信息学算法和工具,比如用于序列比对的BLAST,用于基因组组装的SOAPdenovo,以及用于蛋白质结构预测的AlphaFold等。虽然这些工具的实际操作需要一定的专业知识,但书中对其工作原理的清晰阐述,让我能够理解它们是如何高效地处理和分析海量生物数据的。此外,书中还探讨了生物信息学在系统生物学、比较基因组学和进化基因组学等领域中的应用,这让我看到了生物信息学如何能够连接不同的生命科学分支,从而推动整个学科的发展。

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这本书不仅仅是在介绍学科知识,更是在展现一种科学探索的精神。在阅读关于基因组学变异和疾病关系的部分时,我被书中对于个体基因差异如何影响易感性和疾病表现的分析所深深吸引。它不仅仅是简单地指出某个基因的突变会导致某种疾病,而是更深入地探讨了多基因相互作用、环境因素以及表观遗传修饰等复杂因素的综合影响。书中通过一些经典的遗传性疾病案例,比如囊性纤维化、亨廷顿舞蹈症等,来阐述基因变异的致病机制,并结合基因组测序技术的发展,展示了如何通过基因检测来早期诊断和预测疾病风险。我特别留意到书中关于群体基因组学和人类迁徙历史的研究,它如何利用基因信息来追溯人类的起源和演化,以及不同人群之间的遗传差异,这些都让我对人类这个物种有了更宏观和深刻的认识。同时,书中也对基因组学在精准医疗方面的应用进行了展望,比如基于个体基因组信息的药物选择和治疗方案制定,这让我看到了未来的医疗模式将发生颠覆性的变革,更加个性化和高效。

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蛋白质组学在揭示生命活动调控机制方面所展现出的强大能力,在这本书的描述中得到了充分的展现。书中关于蛋白质翻译后修饰(PTMs)的深入探讨,让我认识到PTMs如何像开关一样,极大地扩展了蛋白质的功能多样性,并参与到几乎所有的细胞生理过程中。例如,磷酸化修饰在信号转导中的核心作用,以及泛素化修饰在蛋白质降解和细胞周期调控中的关键地位。书中通过一些具体的生物学通路案例,如MAPK信号通路和PI3K-Akt信号通路,来阐述PTMs如何精确地调控细胞的响应和功能。我特别对书中关于蛋白质组学在癌症研究中的应用印象深刻,比如如何通过分析肿瘤细胞的PTM谱来识别新的治疗靶点,以及如何利用PTMs作为疾病的生物标志物。此外,书中还介绍了如何利用定性和定量蛋白质组学技术来研究蛋白质的动态变化,以及它们如何响应外界刺激或内部信号。这些研究都为我们理解复杂的生命过程提供了前所未有的视角。

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还是泛泛了点,书籍的更新实在比不上杂志啊~

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好书!

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没读懂

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很发散.没看完.但前面几章基本说清楚了生物信息学的研究思路

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