Computing for Comparative Microbial Genomics

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出版者:Springer London Ltd
作者:Ussery, David W.
出品人:
页数:288
译者:
出版时间:2009-1
价格:$ 101.64
装帧:
isbn号码:9781848002548
丛书系列:
图书标签:
  • 微生物基因组学
  • 比较基因组学
  • 生物信息学
  • 计算生物学
  • 基因组分析
  • Python
  • R
  • 数据科学
  • 进化生物学
  • 系统生物学
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具体描述

The problem many microbiologists face is simply that of too much information. This book details many published methods for comparison of genomes, and provides examples of how custom comparisons can be made. The choice of methods obviously depends on the questions to be asked, and of course on the quantity of genomes to be compared. Two similar bacterial chromosomes can simply be aligned with each other, and regions of inversions and deletions can be readily visualised. However, this method won't work to compare hundreds of genomes, where 2-Dimensional clustering heat maps would be useful. This text is built around teaching COMPUTATIONAL / BIOINFORMATIC methods for comparison of microbial genomes, and includes detailed examples of how to compare them at the level of DNA, RNA, and protein, in terms of structural / functional analysis. Aimed at advanced undergraduate and graduate students in Bioinformatics and Microbiology, this book will prove an invaluable reference to computational and bioinformatics tools.

该书的内容聚焦于微生物基因组学的比较研究,通过系统地分析不同微生物种类之间的遗传信息差异,为理解生命演化和功能机制提供了科学依据。这本书详细介绍了现代分子生物学技术的发展及其在微生物研究中的应用,帮助读者掌握从DNA序列到功能基因表达的全过程。书中系统阐述了如何利用高通量测序数据进行比较分析,为研究人员提供了坚实的工具和方法论支持。 在内容结构上,这一书涵盖了多个核心领域,其中包括微生物分类与系统发育学、基因组比对技术以及多样性分析等重要主题。读者将学会通过计算机辅助工具对不同物种进行精准的基因序列匹配和差异比较,从而更直观地理解微生物群落的复杂性。这部分章节特别强调了数据处理流程、算法应用及结果验证的重要性,为读者提供了一个完整的技术框架。 书中还深入探讨了数据解读与分析的实际案例,通过真实研究数据展示如何从基因组信息中提取有价值的生物学结论。这不仅帮助学生理解理论知识,更为科研人员提供了一套系统的方法,使他们能够独立完成复杂实验。书中的图表、公式和图示丰富,确保各个概念都能清晰传达,便于读者在学习过程中跟进和应用。 此外,这本书注重教育性设计,通过逐步引入专业术语和复杂概念,让初学者能够顺利理解并掌握知识。每一个章节都有详细的解释,使得技术内容不失可读性,同时也兼顾了理论深度与实用价值。书中还包括一些最新的研究进展,为读者提供了持续学习和更新知识的途径。 在整体框架上,这本书不仅覆盖了微生物基因组学领域的主要内容,还结合实际应用案例,使整个学习过程更具吸引力与启发性。其目的是为学生和科研人员提供一套全面、系统的学习资源,帮助他们深入理解微生物遗传信息的多样性及其生物学意义。这本书将通过细致入微的内容安排,让读者在掌握理论知识的同时,也能提升自己的技术能力与研究水平。 从结构上看,本书的设计注重层次分明,第一部分着重介绍了微生物基因组学的基本原理和技术背景;第二部分则详细展开了比较分析方法和工具的使用;第三部分通过实际案例展示了知识的应用价值。每个部分都紧密衔接,为读者构建起一个完整的学习路径,确保内容的逻辑性与连贯性。 总体而言,这本书的设计充分考虑到了不同读者群体的需求,无论是刚开始探索微生物基因组学的人,还是资深研究人员,都能从中获得有价值的指导和支持。这种专业且系统的内容安排,使得读者不仅能够学习到扎实的知识体系,更能在实际工作中灵活应用这些理论,为进一步的科研奠定坚实基础。通过详尽而精细的内容设计,这本书无疑是一份极具价值的学文资源。

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