Mass Spectrometry Analysis for Protein-protein Interactions and Dynamics pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

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出版者:

作者:Chance, Mark 编

出品人:

页数:276

译者:

出版时间:2008-5

价格:$ 225.99

装帧:

isbn号码:9780813817934

丛书系列:

图书标签:

• 质谱
• 蛋白质相互作用
• 蛋白质动力学
• 生物化学
• 分子生物学
• 蛋白质组学
• 分析化学
• 生物物理学
• 结构生物学
• 药物发现

好的，这是一份关于特定主题的图书简介草稿，旨在详尽介绍一个与蛋白质相互作用和动力学分析相关的图书内容，但避免提及您提供的书名。 --- 图书名称： 质谱在生物大分子相互作用研究中的前沿应用 作者： [作者姓名] 出版社： [出版社名称] 出版年份： [年份] 图书简介： 本书深入探讨了质谱技术在解析生命科学领域核心问题——蛋白质相互作用（PPIs）的鉴定、定量及动力学研究——中的前沿应用。随着生物技术的发展，理解蛋白质如何协同工作以执行细胞功能，已成为揭示生命过程与疾病机制的关键。本书旨在为研究人员、博士生及相关领域专业人士提供一个全面的技术指南和理论框架，侧重于如何利用质谱的卓越灵敏度和特异性，克服传统研究方法的局限性。 第一部分：基础原理与技术概览 本书首先回顾了质谱技术在生物分子分析中的基础原理。重点介绍了现代液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）系统的配置，以及如何优化离子源（如电喷雾电离 ESI 和基质辅助激光解吸电离 MALDI）以适应蛋白质复合物的分析需求。我们详尽阐述了高分辨率质谱仪（如Orbitrap和TOF技术）在确保肽段和完整蛋白质质量测定准确性方面的重要性。 此外，本书专门辟出一章来阐述蛋白质相互作用研究中常用的样品制备策略。这包括针对不同相互作用模式（如共价结合、非共价结合）的交联试剂选择、优化捕获效率的亲和纯化流程，以及如何最大程度地减少样品降解和非特异性吸附的注意事项。 第二部分：蛋白质相互作用的鉴定与表征 在蛋白质相互作用的鉴定方面，本书聚焦于几种关键的质谱驱动策略。 1. 共免疫沉淀质谱（Co-IP/MS）： 详细介绍了如何利用高质量的抗体进行免疫沉淀，随后通过高通量质谱筛选共沉淀的蛋白伙伴。内容涵盖了数据采集策略的选择，如数据依赖采集（DDA）和数据非依赖采集（DIA），并对比了它们在全面性和定量性上的优势与劣势。我们提供了实用的生物信息学分析流程，用于从海量数据中区分出真阳性相互作用体和背景噪音。 2. 交联质谱（Cross-linking Mass Spectrometry, XL-MS）： 这是本书的重点之一。我们深入解析了使用胺反应性或光活性交联剂的原理，以及如何设计实验以捕获不同距离限制下的蛋白质相互作用界面。技术细节包括交联肽段的识别算法、碎片化模式的解释，以及如何重建三维结构模型。书中还讨论了对新型交联剂（如靶向性交联剂）的探索，以期提高相互作用位点的特异性。 3. 靶向相互作用的验证： 针对已知的或初步鉴定的相互作用，本书介绍了如何利用稳定同位素标记技术（如SILAC、TMT）进行定量比较。这使得研究人员能够评估特定生理条件下相互作用的强度变化，例如药物处理或疾病状态下配体结合的变化。 第三部分：解析相互作用的动力学特性 理解蛋白质相互作用的速度和稳定性对于功能预测至关重要。本书将动力学分析视为质谱应用的前沿领域。 1. 表面等离子体共振结合分析（SPR）与质谱的整合： 虽然SPR是动力学分析的经典方法，但本书强调如何结合质谱来鉴定结合或解离过程中发生的结构变化（如磷酸化、构象改变）。 2. 溶液内脉冲标记技术（HDX-MS）： 本章详尽阐述了氢氘交换质谱（HDX-MS）如何揭示蛋白质结合后局部构象的动态变化。内容覆盖了实验设计的规范（如交换时间点、酶解策略）以及通过差异性交换率来映射结合区域的生物信息学工具和数据解读方法。这种方法为研究蛋白质复合物的组装和解离机制提供了无与伦比的分子分辨率。 3. 完整蛋白复合物分析（Native MS）： 针对大型多聚体和膜蛋白复合物，本书介绍了使用非变性电喷雾电离技术（Native ESI-MS）。这种技术允许在接近生理状态下测量完整复合物的质量、亚基组成以及配体结合计量比。我们展示了如何利用Native MS区分不同结合状态的复合物，并追踪它们在不同环境（如pH、离子强度）下的稳定性。 第四部分：数据处理与前沿趋势 本书的最后部分侧重于处理和解释高维质谱数据。涵盖了从原始数据处理、肽段和蛋白质鉴定到生物学意义阐释的完整工作流程。此外，还展望了质谱技术在研究蛋白质组级相互作用网络、以及结合人工智能和机器学习算法来预测新型相互作用伙伴的未来发展方向。 结论： 《质谱在生物大分子相互作用研究中的前沿应用》不仅仅是一本技术手册，更是一本策略指导书。它通过对当前最尖端质谱技术的系统性梳理和深入分析，为读者提供了可靠的工具箱，以应对复杂蛋白质相互作用网络研究中的挑战，从而推动蛋白质组学和系统生物学领域的研究进展。 ---

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