Pseudo-Peptides in Drug Discovery

Pseudo-Peptides in Drug Discovery pdf epub mobi txt 電子書 下載2026

出版者:
作者:Nielsen, Peter E. 編
出品人:
頁數:256
译者:
出版時間:2004-5
價格:£ 120.00
裝幀:
isbn號碼:9783527306336
叢書系列:
圖書標籤:
  • 藥物發現
  • 多肽
  • 僞肽
  • 生物活性
  • 藥物設計
  • 化學閤成
  • 構效關係
  • 蛋白質相互作用
  • 肽模擬物
  • 藥物化學
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具體描述

Peptides are among the most versatile bioactive molecules, yet the do not make good drugs, because they are quickly degraded or modified in the body. To overcome this problem, stable and at the same time biologically active pseudo-peptides have been developed. These novel compounds open up new perspectives in drug design by providing an entire range of highly specific and non-toxic pharmaceuticals. This is the first work devoted to the topic and draws together knowledge gained on different types of peptidomimetics and other pseudo-peptides with drug properties. As such, it includes peptoids, beta-peptides, polyamide DNA binders as well as peptide nucleic acids. The expert authors and editor discuss chemical properties and stability, biological activity and reactivity, as well as practical aspects of synthesis, making this a prime resource for drug developers and bioorganic chemists working with these compounds.

藥物化學前沿:新型小分子與生物大分子相互作用的深度探索 書籍簡介 本書聚焦於當代藥物化學領域最前沿的研究方嚮與關鍵技術,旨在為藥物研發人員、化學傢以及生物醫學研究者提供一本全麵、深入且具有實踐指導意義的參考手冊。我們摒棄對特定分子類彆的局限性闡述,轉而深入剖析藥物發現過程中核心的化學、生物學及計算方法學挑戰與機遇。 第一部分:基礎理論與藥物化學範式轉型 本部分首先奠定瞭現代藥物發現的理論基礎,並探討瞭行業正在經曆的範式轉變。我們詳細闡述瞭從傳統的“類藥性”概念到更精細的“生物物理學特性”調控的演進過程。 小分子藥物的“硬性”限製與突破: 深入分析瞭傳統口服小分子藥物的溶解度、滲透性、代謝穩定性(ADME/Tox)瓶頸。重點探討瞭如何通過精妙的分子設計(如共晶、鹽型選擇、前藥策略的精細化設計)來優化這些關鍵參數,而非僅僅停留在結構活性關係(SAR)的錶麵。 靶點多樣性與新型化學空間的探索: 討論瞭傳統“可成藥靶點”(Druggable Targets)的範圍正在被如何拓寬。這包括對非常規蛋白-蛋白相互作用(PPIs)的化學乾預,以及針對細胞內小分子轉運體和核受體的設計策略。書中將詳細介紹如何利用非傳統化學骨架(如片段庫的精細化篩選、新型雜環體係的構建)來占據傳統化學空間之外的區域。 生物物理學工具的整閤應用: 強調瞭定量生物物理方法在藥物發現中的核心地位。詳細介紹瞭高通量篩選後,如何運用等溫滴定量熱法(ITC)、錶麵等離子共振(SPR)、微尺度熱泳動(MST)以及核磁共振(NMR)等技術,對藥物分子與靶點之間的熱力學和動力學結閤模式進行精確刻畫,指導後續的先導化閤物優化。 第二部分:麵嚮復雜生物係統的化學乾預 藥物研發的復雜性日益增加,要求化學傢能夠更有效地作用於細胞內復雜的環境和生物大分子網絡。本部分專注於解決“如何讓化學分子在真實生物體係中發揮作用”這一核心難題。 靶嚮蛋白質降解(TPD)的化學基礎: 鑒於PROTACs和分子膠水等技術對現代藥物研發的顛覆性影響,本書用大量篇幅解析瞭這些領域背後的化學邏輯。詳細分析瞭配體選擇性、E3連接酶招募效率、三元復閤物形成動力學以及分子連接子(Linker)對整體性能的影響。這不是關於特定靶點的案例研究,而是關於“如何設計有效的E3連接酶招募單元”和“連接子化學空間”的深入探討。 抗體藥物偶聯物(ADCs)的化學工程: 重點討論瞭連接技術(Linker Technology)的演進,如何實現穩定、可控的藥物釋放。內容涵蓋瞭不同偶聯位點(如賴氨酸、半胱氨酸、非天然氨基酸位點)的化學選擇性、藥物有效載荷(Payloads)的生物活性優化,以及如何通過化學修飾來調控ADC的藥代動力學特性。 細胞滲透性與內涵體逃逸的化學調控: 探討瞭那些作用於細胞內特定區室的分子設計策略。對於需要穿越血腦屏障(BBB)的分子,書中分析瞭結構特徵如何影響跨膜轉運,並對比瞭主動轉運係統利用與被動擴散的優化路徑。對於作用於內涵體的分子,則詳細解析瞭pH敏感性連接子、質子海綿效應等化學機製的設計與驗證。 第三部分:計算化學與人工智能在分子發現中的賦能 本部分轉嚮如何利用先進的計算工具來加速和指導化學閤成與優化過程,強調計算模型與實驗驗證的緊密結閤。 高精度分子建模與動力學模擬: 詳細介紹如何使用從頭算(Ab Initio)方法和密度泛函理論(DFT)來精確預測關鍵反應中間體的能量、過渡態結構以及分子間作用力的性質。在分子動力學(MD)模擬方麵,本書側重於如何設置閤理的力場參數,以準確模擬膜環境、蛋白質柔性對結閤親和力的貢獻,以及溶劑效應的精確處理。 基於物理的虛擬篩選與配體設計: 深入剖析分子對接(Docking)的局限性與改進方嚮。重點討論瞭基於構象采樣(Ensemble Docking)和自由能計算(如MM/PBSA, FEP)在先導化閤物優先級排序中的應用,並闡述瞭如何將這些計算結果轉化為可執行的閤成化學路綫。 機器學習在化學空間探索中的角色: 探討瞭生成模型(如VAE, GAN)在設計具有特定物理化學屬性的新分子方麵的應用,區彆於簡單的“虛擬篩選”。強調瞭高質量、去偏倚的化學數據在訓練魯棒模型中的重要性,以及如何通過主動學習(Active Learning)循環來高效地探索化學空間。 結論與展望 本書總結瞭當前藥物發現領域麵臨的重大機遇,強調瞭跨學科閤作(化學傢、生物學傢、信息學傢)是推動下一代療法誕生的關鍵。它提供瞭一套係統性的思維框架,指導讀者如何從基礎的分子設計原理齣發,有效地解決復雜的生物學難題,推動新穎化學實體進入臨床開發階段。本書適閤有一定化學或生物學背景的研究人員,作為深入理解當代藥物研發前沿策略的專業參考。

作者簡介

目錄資訊

讀後感

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我對藥物開發的商業化進程一直保持著高度的關注。理論的精妙必須經得起臨床和市場的考驗。因此,我希望這本書不僅僅關注實驗室的閤成和體外篩選,更能深入探討“假肽”類藥物在整個藥物開發管綫中可能遇到的獨特監管和知識産權挑戰。例如,由於假肽的結構往往是高度定製化的,它們的專利保護策略是否與傳統小分子或大分子藥物有所不同?在生物類似藥競爭日益激烈的背景下,如何構建具有強大知識産權壁壘的假肽結構,書中是否有相關的戰略性指導?從更宏觀的角度看,這本書是否對不同類型的假肽(如環肽、肽偶聯物、或者PEG化修飾的肽類似物)的市場潛力進行瞭客觀的比較分析?我希望它能提供一個産業視角的評估:哪些假肽類型更可能在未來五年內進入臨床後期階段,並最終實現商業化?這種兼顧化學深度、生物學意義與商業可行性的綜閤性分析,纔是真正有價值的專業讀物。

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作為一個對藥物化學工程抱有極大熱情的博士生,我閱讀這類專業書籍的目的性非常明確:尋找突破性的化學工具和理論框架。目前,我們麵臨的主要挑戰是如何在保持肽類分子高特異性的同時,剋服其固有的免疫原性和滲透性問題。我非常期待這本書能夠提供關於新型“假肽骨架”的詳盡分類和比較分析。例如,相較於傳統的$eta$-轉肽或二肽模擬物,那些基於新型骨架,如摺疊肽或受限構象肽的成功應用案例是否被充分討論?更關鍵的是,書中對這些新骨架的閤成難度和放大生産的可能性是否給齣瞭現實的評估?我深知,一個絕妙的分子設計如果無法以閤理的成本和規模製造齣來,那它就隻能停留在學術研究的象牙塔裏。我期望看到一些關於連續流化學(Flow Chemistry)在假肽閤成中應用的章節,因為這代錶瞭未來高效、可控閤成的方嚮。此外,書中對特定疾病領域(如自身免疫病或腫瘤靶嚮治療)中,假肽策略的適用性和成功率的統計分析,也會是我重點研讀的部分,這有助於我校準自己的研究方嚮。

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說實話,我對目前市麵上大多數關於新興藥物靶點或分子類型的新書都有點“審美疲勞”瞭,它們往往充斥著大量我們已經耳熟能詳的基礎知識,而真正具有前瞻性和深度分析的內容卻少得可憐。我更傾嚮於那些敢於觸及領域前沿爭議點,並且能提供細緻入微的分子層麵對話的著作。對於“假肽”這個話題,它的核心吸引力在於如何巧妙地平衡生物活性與藥代特性。我希望這本書能夠深入剖析,那些看似微小的結構修飾——比如引入硫醚鍵、酯鍵、或者特定的雜環——是如何在分子層麵上影響其與受體口袋的相互作用模式的。書中是否能提供一些量化的數據,比如構象柔性度(conformational flexibility)與靶點結閤親和力之間的精確關係圖譜?此外,我對如何使用先進的生物物理學方法,如核磁共振(NMR)或冷凍電鏡(Cryo-EM),來解析這些復雜假肽與靶蛋白形成的復閤物結構,給予瞭很高的期望。如果書中能展示幾個成功的案例,詳細記錄從初始的構效關係(SAR)探索到最終高分辨率結構的解析過程,那無疑能極大地拓寬我們對這類新型療法分子設計的理解邊界。我關注的不是“是什麼”,而是“為什麼”和“如何做到最好”。

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這本關於藥物發現中“類肽”的書籍,我實在是期待已久。我是一名在生物製藥領域摸爬滾打多年的研究員,深知當前小分子藥物研發的瓶頸,而多肽及其類似物,尤其是那些在結構上模仿天然肽但生物利用度更高的“假肽”,無疑是未來的一大方嚮。我希望這本書能提供一個全麵而深入的視角,不僅僅停留在理論層麵,更重要的是,它能為我們這些一綫工作者提供實用的、可操作的指導。例如,在選擇閤適的化學骨架來替代天然肽鍵方麵,有哪些最新的進展和挑戰?那些用於提高口服吸收性和靶點選擇性的策略,比如環化技術、非天然氨基酸的引入、或者通過空間構象鎖定來實現的分子設計,書中是否做瞭詳盡的闡述和案例分析?我尤其關注閤成化學方麵的挑戰,因為許多新穎的假肽結構對現有的固相閤成技術提齣瞭極高的要求,如果書中能詳述這些復雜分子的閤成路綫優化和純化難關,那將是極大的福音。同時,作為一個需要將實驗室成果轉化為臨床前候選物的實踐者,我更看重藥物代謝動力學(DMPK)方麵的討論,如何預測和改善假肽的半衰期和組織分布,是決定一個項目能否成功的關鍵。我期望看到成熟的計算模擬工具如何與實驗數據相結閤,共同指導假肽庫的構建與篩選。這本書如果能做到這些,那它絕不僅僅是一本教科書,更會成為我們實驗室的案頭必備工具書。

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讀完一些初步的介紹材料,我感覺這本書的切入點非常“現代”。我關注的重點是跨學科的整閤,尤其是計算化學與高通量篩選的融閤。在假肽的設計中,我們越來越依賴於人工智能和機器學習模型來預測最佳的取代基、構象以及與靶點的相互作用能量。我非常期待這本書能提供一個關於“基於AI設計的假肽”的專門章節。這個章節應該詳細介紹目前有哪些成熟的(或正在快速發展的)算法,可以有效地在巨大的化學空間中搜索齣具有潛在成藥性的假肽結構?它是否能展示一些實例,說明計算模型如何幫助我們規避瞭傳統上耗時的、基於隨機突變的篩選過程?此外,在生物學驗證環節,如何設計齣能夠準確反映體內環境的體外模型來評估假肽的穩定性、滲透性和效力,也是一個核心問題。如果這本書能提供一些關於類器官(Organoids)或“芯片上的器官”(Organ-on-a-chip)技術在評估新型假肽口服吸收和組織靶嚮性方麵的應用案例,那將是極大的亮點,因為它直接迴應瞭當前藥物研發中高昂的臨床前失敗率這一痛點。

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