Horizontal Gene Transfer in the Evolution of Pathogenesis (Advances in Molecular and Cellular Microb

Horizontal Gene Transfer in the Evolution of Pathogenesis (Advances in Molecular and Cellular Microb pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Cambridge University Press
作者:Hensel, Michael (EDT)/ Schmidt, Herbert (EDT)
出品人:
页数:342
译者:
出版时间:2008-06-30
价格:USD 140.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9780521862974
丛书系列:
图书标签:
  • 进化
  • 病原发生
  • 基因水平转移
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  • Genome Evolution
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具体描述

Horizontal gene transfer is a major driving force in the evolution of many bacterial pathogens. The development of high-throughput sequencing tools and more sophisticated genomic and proteomic techniques in recent years has resulted in a better understanding of this phenomenon. Written by leading experts in the field, this edited volume is aimed at graduate students and researchers and provides an overview of current knowledge relating to the evolution of microbial pathogenicity. This volume provides an overview of the mechanisms and biological consequences of the genome rearrangements resulting from horizontal gene transfer, in both prokaryotes and eukaryotes, as well as overviews of the key mobile genetic elements involved. Subsequent chapters focus on paradigms for the evolution of important bacterial pathogens, including Salmonella enterica, Streptococcus pneumoniae, and Staphylococcus aureus. The influence of socioeconomic parameters in the dissemination of transferable elements, such as antibiotic resistant genes in bacteria, is also discussed.

基因的边界:探寻生命演化中的非凡转移 在生命浩瀚的演化史诗中,我们通常将基因的传递想象成一种垂直而下的血脉传承,从父母到子女,一代又一代。然而,生命的故事远比这更加复杂和充满惊喜。在微生物的微观世界里,甚至在更广阔的生物领域,一种被称为“水平基因转移”(Horizontal Gene Transfer, HGT)的现象,犹如一股神秘而强大的暗流,悄然改写着生命的图谱,重塑着生物的形态与功能,并深刻影响着我们对生命演化和生物多样性的理解。 《基因的边界》一书,并非聚焦于某一种特定的生物机制或某个特定的演化事件,而是以一种宏大的视角,深入剖析了水平基因转移这一在生命演化进程中扮演着至关重要角色的通用性原理。它不仅仅是一次对基因转移机制的科学考察,更是一次对生命适应性、创造力以及相互关联性的深刻洞察。本书将带领读者穿越微生物王国,探索真核生物的复杂网络,甚至触及病毒与宿主之间微妙的互动,揭示水平基因转移如何成为生命演化史上的关键催化剂。 第一部分:机制的奥秘——基因如何“越界” 理解水平基因转移,首先需要解开其背后多样而精妙的机制。本书将深入探讨这些“基因间谍”是如何跨越物种界限,实现一次次令人惊叹的“越界”行动。 转化(Transformation): 想象一下,环境中的DNA片段,如同散落的宝藏,被其他细胞主动“拾取”并整合到自身的基因组中。这就是转化。本书将详细解析细菌和古菌中普遍存在的转化机制,从DNA的摄取过程,到重组酶介导的整合,以及DNA修复系统在维持基因组稳定性和适应性突变中的作用。我们将探讨哪些环境因素,例如DNA损伤、营养匮乏,会诱导细胞更频繁地进行DNA摄取,以及不同的生物如何演化出特异性的DNA结合蛋白和转运系统来提高转化效率。 转导(Transduction): 病毒,这些微小的生命“信使”,在水平基因转移中扮演着意想不到的角色。通过噬菌体(bacteriophages)的感染,病毒可以将宿主细胞的DNA片段携带到新的宿主细胞中。本书将详细阐述转导的两种主要类型:普遍性转导(generalized transduction)和特殊性转导(specialized transduction)。我们将深入解析病毒复制过程中DNA包装的随机性如何导致普遍性转导,以及病毒整合到宿主基因组后,在特定条件下引发的DNA切除和包装过程如何导致特殊性转导。通过具体的案例研究,例如致病性细菌毒力基因的传播,本书将揭示转导在加速细菌适应性演化中的巨大作用。 接合(Conjugation): 在细菌和古菌世界中,细胞之间直接的物理接触是基因转移的另一条重要途径。接合,通过细胞间的“性”连接(pilus),能够将质粒(plasmids)或其他可移动遗传元件(mobile genetic elements, MGEs)从供体细胞转移到受体细胞。本书将详细介绍接合的分子机制,包括质粒的复制、DNA的单链转移以及受体细胞中DNA链的合成。我们还会探讨不同类型的接合系统,如F质粒介导的接合,以及那些不依赖于经典接合系统的“侧翼接合”机制。更重要的是,本书将聚焦于接合在抗生素耐药性基因、毒力基因以及代谢相关基因传播中的关键作用,解释为何接合成为许多细菌适应环境快速变化的主要驱动力。 跨越物种的边界: 除了以上三种主要的微生物水平基因转移方式,本书还将探讨更广泛的场景。例如,是否存在从原核生物到真核生物,甚至跨越不同王国之间的基因转移?我们将考察一些引人注目的例子,如线粒体和叶绿体的基因组演化,它们被认为是早期真核细胞吞噬原核细胞后,基因组逐渐融合的结果。此外,对于病毒,它们本身就是活跃的基因转移载体,其基因组的插入、重排以及与宿主基因组的互动,也是水平基因转移的生动体现。 第二部分:演化的驱动者——基因转移如何塑造生命 一旦基因“越界”成功,它们就能在新的环境中施展“魔法”,极大地推动着生命的演化进程。本书将深入揭示水平基因转移在生命演化中扮演的关键角色,从适应性演化到新功能的产生。 适应性演化: 这是水平基因转移最直接、最显著的影响之一。当一个生物体获得能够应对新环境压力或挑战的基因时,它就能获得显著的生存优势。本书将通过大量案例说明这一点。例如,细菌通过获得抗生素耐药基因,在抗生素环境中迅速繁衍;海洋生物通过获得降解特定有机物的酶基因,能够利用新的食物来源;植物通过获得抵抗病原菌的基因,提高了自身的防御能力。本书将强调,在快速变化的环境中,例如人类活动引起的抗生素滥用、环境污染等,水平基因转移成为加速生物适应性的“捷径”。 新功能的创造: 水平基因转移不仅能帮助生物体适应现有环境,更能为它们带来全新的功能,从而开启新的演化可能。例如,一些细菌通过获得编码新代谢途径的基因簇,能够降解以前无法利用的有机物,甚至开发出全新的能源利用方式。更令人惊叹的是,某些基因可能在原有的生物体中没有明确的功能,但在新的宿主中,它们可能被激活并参与到全新的生物化学反应中,从而催生出意想不到的生理功能。本书将深入探讨那些“沉默基因”在水平基因转移后被激活的故事,以及它们如何为生物体带来新的“超能力”。 致病性的起源与演化: 对于我们人类而言,水平基因转移在病原体的演化中扮演着极其重要的角色。本书将重点探讨,一些原本无害的微生物是如何通过获得毒力基因(virulence factors),如毒素、侵袭因子、效应蛋白等,演变成强大的致病因子。我们将追溯那些导致大规模传染病爆发的病原体,例如霍乱弧菌、金黄色葡萄球菌等的演化历程,揭示水平基因转移如何在短时间内赋予它们更强的传播能力、感染能力和致病性。同时,本书也将关注抗生素耐药性在全球范围内的蔓延,将其深刻理解为一次大规模的、由水平基因转移驱动的“军备竞赛”。 共生关系的形成与演化: 水平基因转移也深刻地影响着生物体之间的共生关系。例如,某些共生细菌通过基因转移,能够帮助宿主消化食物、合成维生素,甚至增强免疫力。反之,宿主也可以通过基因转移,为共生细菌提供有利的生存环境和营养。本书将探讨,例如根瘤菌与豆科植物之间的固氮共生,以及肠道微生物与宿主之间的复杂互利关系,是如何受到水平基因转移的塑造和演化的。 基因组的“重塑”: 大量的水平基因转移事件,尤其是大型基因簇的转移,能够显著改变一个生物体的基因组结构和大小。本书将考察,在某些快速演化的细菌群落中,水平基因转移如何成为基因组“重塑”的主要力量,促使基因组不断变异和优化。我们还将探讨,那些被成功整合的“外来基因”是如何与宿主原有的基因进行互动,产生协同效应,甚至引发基因表达和调控网络的改变。 第三部分:挑战与未来——理解与应对基因转移的深远影响 水平基因转移的普遍性和影响力,对我们理解生命、医学以及生物技术都提出了新的挑战,也带来了新的机遇。 生物多样性的解析: 长期以来,我们依赖系统发育树来描绘生命演化史,但水平基因转移的存在,使得基因组间的演化关系变得更加复杂和“网状”。本书将探讨,如何利用基因组学、生物信息学以及古基因组学等前沿技术,来解析水平基因转移对生物多样性形成的影响,更准确地绘制生命演化图谱。 病原体监测与防控: 随着水平基因转移在病原体演化中的作用日益凸显,精确监测和预测其传播趋势变得尤为重要。本书将讨论,如何利用高通量测序技术和大数据分析,实时追踪抗生素耐药基因、毒力基因等的转移和扩散,为疾病防控策略提供科学依据。 生物技术的应用: 理解水平基因转移的机制,为生物技术的发展提供了巨大的潜力。本书将展望,如何利用自然界中的基因转移机制,设计更高效的基因工程工具,实现基因的定向转移和编辑,以用于药物研发、生物能源开发以及环境保护等领域。 应对生物安全挑战: 随着基因工程技术的发展,水平基因转移也带来了潜在的生物安全风险。本书将呼吁,在利用和改造基因的同时,需要审慎评估其潜在的生态和健康影响,并制定相应的管理和监管措施。 《基因的边界》是一次对生命秘密的一次大胆探索。它挑战了我们对基因传承的传统认知,揭示了生命演化中一个被低估却极其强大的力量。通过本书,读者将不仅能深入理解水平基因转移的精妙机制和深远影响,更能体会到生命体之间复杂而奇妙的联系,以及生命为何能够如此顽强地适应并不断演化。这不仅仅是一本科普读物,更是一次启发思考的旅程,让我们重新审视生命的起源、演化以及我们自身在其中的位置。

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