《上海社会发展报告(2009)》认为，社会管理制度改革是社会体制改革中的一项基本内容。2008年上海在社会管理方面面临一系列新的情况与问题，它们一方面促使整个管理体制发展完善，同时也提出了深化改革要求。从整个社会管理体制的改革思路来看，“党委领导、政府负责、社会协同、公众参与”的社会管理体制新格局，是一个具有中国特色的党、政府、社会、民众通力齐管的“管治”思路。它具有当代社会管理中不单纯依靠政府行政管理的管治理论的思想，使单纯一味的强权“统治”变为多元化的“善治”。上海在社会稳定管理、人口户籍管理、社会组织管理、社会工作者职业化管理等方面不断地进行了创新探索，取得了一定的进展，也暴露出一些新的问题。

对于2008年上海在深化公共产品和公共服务制度改革方面，《上海社会发展报告(2009)》重点对公共住房和教育服务体制进行了专题研究。住房与教育是对民生和发展有着极其重要影响的领域。经过30年的改革开放，这两个领域的公共性问题重新成为人们关注的热点。上海近期的发展，在公共住房和公共教育方面所出现的问题和改革与发展中的瓶颈已经越来越凸显，有必要深入开展研究。同时，上海作为一个日益多元化和国际化的大都市，公众在宗教生活方面的需求也越来越成为一种“公共需求”的事实，对于政府如何提供制度性服务，如何发挥宗教团体、机构与信众在现代生活中的积极作用，《上海社会发展报告(2009)》也作了探讨。

深化社会保障体制的改革已经成为上海近年来十分重要的政府民生工程。2006年以来，上海市政府连续出台或修订了多项社会保障政策。《上海社会发展报告(2009)》对上海特殊困难群体、基本养老、医疗三个方面的制度改革现状，以及专门针对小城镇居民和外来务工人员的创新社会保障制度进行了研究。上海社会保障系统的体制改革，一方面是对原有的系统进行改造，另一方面又要满足不断产生的新的需求。上海顺应了经济体制改革和城市经济快速增长的需要，基本建立起了一个广覆盖、保基本、多元化、多层次的社会保障制度体系。

《上海社会发展报告(2009)》对上海在进一步深化社会体制改革方面提出了以下一些建议：(1)顺应生存型社会向发展型社会的进步，以医疗、教育、住房、养老保障等为突破口，继续建立健全完善的民生社会保障制度和资源公平分配的制度体系，让更多的人分享城市经济发展的成果，促进社会相对公平、和谐稳定；(2)积极推动民生型社会事业项目的公益化回归(教育、医疗、住房、公交等)，完善与市场经济体制配套的公共服务体系和国民福利体系；(3)稳步推进社会事业单位适应市场化的改革，全面激发社会发展潜力与活力，充实市场经济体制和公共服务体系交融所带动的社会部门的经济创造力；(4)培育并重塑民间社会组织的社会主体地位，建立一套有中国特色和符合国际大都市特点的城市社会建设与社会管理机制，形成党领导下，政府、市场、社会、公民间合作伙伴式的社会治理体系；(5)以基层社区民主治理为试点，加快政治体制改革进程，建立一个具有透明性、责任性、法治化的公共服务型政府，和科学化、民主化、社会化、规范化的政府决策机制。