傢蠶基因組計劃

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頁數:651
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出版時間:2008-10
價格:298.00元
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isbn號碼:9787562141334
叢書系列:
圖書標籤:
  • 傢蠶
  • 基因組
  • 基因組學
  • 蠶業
  • 生物技術
  • 分子生物學
  • 遺傳學
  • 蛋白質組學
  • 農業科學
  • 昆蟲學
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具體描述

《傢蠶基因組計劃(2000-2007)》的主要內容是:這本研究論文集總結8年來中國傢蠶基因組計劃的主要研究結果,為已經啓動並有著美好前景的傢蠶功能基因組計劃提供藉鑒和參考。全書分為四個部分,收錄瞭這個期間正式發錶的論文共計68篇,分彆反映中國傢蠶基因組計劃之背景、意義和策略(4篇);測序、生物信息學和基因組分析(15篇);關鍵平颱技術(17篇)和功能基因組及其應用(31篇)等。

絲綢之源的宏偉藍圖:傢蠶基因組計劃 一部聚焦生命科學前沿的史詩級著作,深入探索昆蟲基因組的奧秘與潛力 《傢蠶基因組計劃》並非僅僅是一部關於蠶寶寶的書籍,它是一部描繪生命科學宏偉藍圖的學術巨著,是人類解碼復雜昆蟲生命密碼的裏程碑式記錄。本書以傢蠶(Bombyx mori)這一在人類文明史上扮演瞭數韆年重要角色的物種為核心,通過對其完整基因組序列的深度解析,展現瞭現代生物技術如何以前所未有的精度揭示生命運作的本質規律。 本書的敘事結構嚴謹,內容涵蓋瞭從基因組測序的策略選擇與技術路綫圖的製定,到海量基因組數據的生物信息學處理與注釋,再到功能基因的鑒定與驗證等多個維度,構成瞭一個完整而深入的科研報告集閤。它忠實記錄瞭一項跨越數年、匯集全球頂尖科學傢智慧的復雜工程——“傢蠶基因組計劃”的完整曆程與最終成果。 第一部分:測序的藝術與宏基因組的構建 本書的開篇部分,著重探討瞭在特定曆史時期,選擇何種測序技術路綫來攻剋傢蠶這一相對復雜的二倍體昆蟲基因組的挑戰。章節詳述瞭全基因組鳥槍法(Whole-Genome Shotgun Sequencing)和BAC/PAC文庫測序相結閤的混閤策略,如何剋服傢蠶基因組中重復序列和雜閤性帶來的難題。 讀者將看到詳細的實驗數據和方法論描述: 文庫構建的精細化控製: 如何通過精確控製插入片段的長度分布,優化高通量測序的效率。 前期組裝算法的演進: 麵對數以億計的短讀長序列,書中詳細闡述瞭當時最先進的De Bruijn圖算法與Overlap-Layout-Consensus (OLC) 算法的迭代應用,以及如何通過物理圖譜(如BAC限製性圖譜)來錨定和矯正宏觀的序列組裝錯誤。 異質性(Heterozygosity)的處理: 傢蠶的兩個等位基因在某些區域存在顯著差異,本書提供瞭處理這種“僞重復序列”的獨到方法,旨在區分物種內在的遺傳變異與測序錯誤。 第二部分:基因組的骨架與功能注釋的深度挖掘 一旦初步的基因組骨架搭建完成,本書的核心便轉嚮瞭對“基因密度”和“功能元件”的詳盡描繪。這部分是理解傢蠶生物學特性的關鍵所在。 基因預測與分類: 書中精確統計瞭傢蠶基因組中預測的蛋白質編碼基因數量,並將其劃分為不同的功能傢族。尤其引人注目的是對昆蟲特有基因傢族的深入分析,例如: 1. 消化酶基因簇: 針對傢蠶以桑葉為食的特殊性,分析瞭其縴維素酶、蛋白酶等消化相關基因的進化和調控機製。 2. 感覺與解毒基因: 詳細解讀瞭嗅覺受體(ORs)、味覺受體(GRs)以及細胞色素P450傢族基因的數量、多樣性及其在識彆有毒物質和信息素中的作用。 3. 絲腺特異性基因的定位: 對絲蛋白基因(如絲心蛋白Fibroin和絲蛋白Sericin)的基因組排布、啓動子區域的調控元件進行瞭前所未有的精確映射,揭示瞭它們如何在生命周期的特定階段被高效率地“開啓”。 非編碼區域的解碼: 《傢蠶基因組計劃》超越瞭簡單的蛋白質編碼區域分析,投入大量篇幅討論瞭調控元件: 轉座子(Transposable Elements, TEs)的景觀: 詳細描繪瞭基因組中各類TE的分布熱點和對周邊基因錶達的影響,揭示瞭其在推動物種適應性進化中的作用。 非編碼RNA(ncRNA)的發現: 報告瞭針對微小RNA(miRNA)和長鏈非編碼RNA(lncRNA)的生物信息學篩選結果,並初步探討瞭它們在調控蠶卵孵化、幼蟲變態等關鍵生命事件中的潛在角色。 第三部分:比較基因組學:傢蠶在昆蟲進化樹中的位置 本書的後半部分將視角從傢蠶內部擴展到更廣闊的鱗翅目(Lepidoptera)進化網絡中。通過與已完成基因組測序的其他昆蟲(如擬宮蟲、果蠅等)進行係統性的比較分析,本書旨在迴答一個核心問題:傢蠶是如何在被人類馴化過程中丟失或改變瞭其關鍵基因的? 核心代謝通路對比: 分析瞭傢蠶與野生近緣種在農藥抗性、防禦反應相關基因上的差異,佐證瞭馴化選擇壓力對基因組的重塑作用。 基因組結構變異: 鑒定瞭染色體級彆的重排、缺失和重復事件,這些結構變化被證明與傢蠶的形態學和生理學特性存在直接關聯。 進化速率的測定: 利用基因組數據,精確計算瞭傢蠶不同基因傢族的分子進化速率,為理解其適應性(如對特定寄生蟲的抵抗力下降)提供瞭分子基礎。 結論與展望:基因組指導的未來育種 最終,本書落腳於應用科學層麵。它係統地總結瞭基因組計劃為分子育種帶來的革命性工具: 1. 抗病性基因的挖掘: 提供瞭針對白僵病、顆粒體病等主要蠶病抗性基因的精確定位圖譜,為開發基於基因編輯的抗病新品種奠定瞭基礎。 2. 性狀改良的靶點確定: 明確瞭影響繭層重量、絲綫長度和韌性等經濟性狀的關鍵調控區(QTLs)的基因組坐標,使得傳統的錶型選擇能夠被更高效的分子標記輔助選擇所替代。 《傢蠶基因組計劃》以其詳盡的數據、嚴謹的論證和跨越多個學科的整閤能力,成為研究昆蟲基因組學、農業生物技術以及生命科學史的不可或缺的參考資料。它不僅僅記錄瞭一項科學成就的達成,更展示瞭人類如何通過解碼生命的基本語言,為未來的農業和生物材料創新鋪設堅實的技術路徑。這本書的內容完全聚焦於傢蠶的DNA序列、基因功能注釋、測序技術、生物信息學分析以及比較基因組學研究,是對這一特定科學工程成果的全麵、技術性的記錄和總結。

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