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出版者:Academic Pr

作者:Burlingame, A. L. 编

出品人:

页数:512

译者:

出版时间:2005-11

价格:$ 224.87

装帧:HRD

isbn号码:9780121828073

丛书系列:

图书标签:

质谱学
生物质谱
蛋白质组学
代谢组学
生物分析
分子生物学
生物化学
仪器分析
生命科学
分析化学

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具体描述

This volume describes and integrates the techniques and fundamentals of more than a decade of revolutionary advances in both chromatographic and mass spectrometric technologies that have enabled the direct investigation of biomacromolecules per se and have provided the analytical power base to usher in the new fields of proteomics and systems biology. It also covers new biophysical applications such as H/D exchange for study of conformations, protein-protein and protein-metal and ligand interactions. Finally it describes atto-to-zepto-mole quantitation of 14C and 3H by accelerator mass spectrometry. This is part 1 of 2 volumes about "Mass Spectrometry". It presents an authoritative and comprehensive treatment of protein mass spectrometry in human cell biology. It presents fundamentals, techniques, instrumentation and bioinformatics, and provides an overview of proteomics, protein-protein and protein-ligand binding, and biophysical studies.

好的，这里为您提供一份针对《Biological Mass Spectrometry》一书的、不包含其内容的详细图书简介，重点描述其他相关或互补领域的图书内容。 --- 现代药物化学与计算设计：从靶点发现到临床前优化图书简介本书旨在为化学家、生物学家、药理学家以及药物研发领域的新兴研究人员，提供一套全面且深入的视角，涵盖了现代药物发现与开发（Drug Discovery and Development, DDD）的各个关键阶段，尤其侧重于计算方法论、靶点验证、化合物合成优化以及早期毒理学评估。本书内容严谨，结构清晰，力求在理论深度与实际应用之间架起一座坚实的桥梁。第一部分：基础原理与新靶点探索本书伊始，首先对药物化学的核心概念和历史沿革进行了回顾，但重点迅速转向当代前沿领域。第一章：生物大分子靶点的复杂性与再评估本章深入探讨了传统“小分子可成药性”概念的局限性，并着重介绍了“难成药”靶点（如转录因子、蛋白-蛋白相互作用界面）的生物学特性及其在疾病通路中的关键作用。我们详细分析了功能获得性突变和非经典的信号转导通路如何为药物设计提供新的切入点。内容涵盖了表观遗传学靶点（如组蛋白修饰酶、染色质重塑复合物）的结构特征和成药潜力，以及如何利用结构生物学信息（如冷冻电镜、高分辨率X射线晶体学）来解析这些复杂系统的构象动态。第二章：高通量筛选（HTS）的优化与数据解读本章超越了基础的HTS流程描述，聚焦于如何提升筛选的质量和特异性。内容包括： 1. 基于目标蛋白的筛选（Target-based Screening）：如何设计更具生理相关性的体外/体内实验系统，减少假阳性。 2. Phenotypic Screening的复兴：讨论了使用复杂细胞模型（如类器官、类器官芯片）进行表型筛选的优势与挑战，以及如何将高维度成像数据转化为可操作的化学信息。 3. 数据降维与生物信息学集成：重点讲解了如何利用降噪算法和机器学习模型处理大规模HTS数据，识别具有潜力的“先导骨架”（Scaffolds），并避免“化学空间富集”带来的重复性问题。第二部分：计算化学与分子设计这是本书的核心部分，详细阐述了在没有高精度分子量信息辅助下，如何利用先进的计算工具指导分子优化。第三章：分子对接与构象采样的高级策略本章详细介绍了分子对接（Molecular Docking）算法的最新进展，尤其关注那些针对柔性靶点和多口袋系统的技术。内容包括：柔性配体与柔性受体对接（Ensemble Docking）：如何有效处理蛋白质在结合过程中的结构变化。基于物理场的打分函数（Force Field Scoring）的修正与改进：讨论了如何通过纳入溶剂化自由能和熵效应来提高打分精度，以更准确地预测结合亲和力。动力学模拟在先导优化中的应用：深入讲解了分子动力学（MD）模拟如何用于验证对接结果，并揭示配体-靶点结合界面的动态稳定性和水分子网络的作用。第四章：从头设计与虚拟筛选的迭代优化本章侧重于从零开始构建新分子的计算流程。 1. 片段组合设计（Fragment-Based Drug Design, FBDD）的计算支持：如何利用片段对接和片段生长算法来快速构建高亲和力分子。 2. 逆向设计（Inverse Design）：介绍了使用生成对抗网络（GANs）和变分自编码器（VAEs）等深度学习模型，根据预设的ADMET性质和靶点亲和力要求，生成全新的、具有新颖化学结构的分子库。 3. 基于化学反应网络的合成可及性评估：在生成新分子后，必须评估其合成难度。本章探讨了如何集成化学反应数据库和逆合成分析工具，确保计算得出的候选分子在实际实验室中可以高效合成。第三部分：药物代谢、药代动力学（ADME）与早期毒理学候选药物的成功不仅依赖于其效力，更依赖于其在生物体内的行为和安全性。本部分详尽讨论了如何利用计算和体外模型进行早期ADME/T预测。第五章：药代动力学性质的预测模型本章聚焦于预测药物的吸收、分布、代谢和排泄（ADME）特性，这是避免后期临床失败的关键。吸收与转运蛋白作用：详细分析了P-糖蛋白（P-gp）和BSEP等关键转运蛋白对药物生物利用度的影响，并提供了预测其相互作用的定量结构-活性关系（QSAR）模型。代谢稳定性与细胞色素P450（CYP）酶：阐述了预测主要代谢位点和代谢产物的计算方法，并讨论了如何通过分子修饰（如氟化、环的替换）来“挡住”代谢热点。血脑屏障（BBB）渗透性预测：针对中枢神经系统（CNS）药物，提供了多参数优化模型来平衡亲脂性、分子量和极性表面积，以实现最佳的BBB跨越。第六章：早期毒性筛查与器官毒性预测安全是药物开发的基石。本章深入探讨了预测脱靶毒性的前沿技术。 1. 心血管毒性（hERG通道阻断）：详细解析了hERG通道的结构和阻断机制，并提供了基于化学结构的高精度分类与回归模型用于早期剔除高风险化合物。 2. 遗传毒性与致突变性预测：介绍了（Q）SAR模型在Ames试验预测中的应用，重点关注对DNA反应性官能团的识别与规避。 3. 微生理系统（MPS）与器官芯片的应用：讨论了如何利用肝脏和肾脏类器官芯片来模拟体内代谢和排泄过程，作为传统动物模型毒性测试的有效补充，以评估药物对特定器官的潜在损伤。结论：集成化药物开发流程本书最后总结了如何将上述计算工具、高通量实验数据和结构洞察整合到“数据驱动”的药物开发流程中。强调了跨学科协作的重要性，并展望了人工智能和自动化合成技术对未来药物发现范式的颠覆性影响。本书适合于寻求在药物发现的复杂交叉领域内提升技能的专业人士和高年级学生。它提供的是一套基于化学、物理和生物学原理的、严谨的决策支持工具箱。