Advances in Systems Biology

Advances in Systems Biology pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Kluwer Academic Pub
作者:Opresko, Lee (EDT)/ Gephart, Julie M. (EDT)/ Mann, Michaela B. (EDT)
出品人:
页数:117
译者:
出版时间:2004-5
价格:$ 168.37
装帧:HRD
isbn号码:9780306483141
丛书系列:
图书标签:
  • Systems Biology
  • Computational Biology
  • Bioinformatics
  • Network Biology
  • Mathematical Biology
  • Systems Modeling
  • Biological Networks
  • Genomics
  • Proteomics
  • Synthetic Biology
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具体描述

This book is based on the proceedings of the inaugural symposium "Northwest Symposium for Systems Biology". Particular focus is on identifying current breakthrough technologies and their application to important model systems. By integrating computational sciences, high-throughput technologies and quantitative biology, this book will advance the understanding of not just the function of individual genes, proteins and smaller molecules like hormones, but also how all of these molecules interact within a cell. This volume will be a collection of presentations on four topics that comprise the scope of the Genomes to Life project recently announced by the Department of Energy. They are four aspects of a system biology approach to understanding microbial communities. These topics include complex microbial systems, gene regulatory networks, molecular machines/ multiprotein complexes and computational techniques. The range of material covered will include the following: -Molecular biological methods for the analysis of complex microbial communities and the use of specific bacterial species for bioremediation, -The study of gene regulation through the use of genomics as well as specific regulation in bacteria (by methylation) and in yeast (via signal transduction pathways), -Structure and function of multiprotein complexes involved in protein degradation, muscle function and protein kinase attachments in cells, -Computational approaches to the analysis of large data sets to yield useful information.

现代生物医学研究的新里程碑:从分子调控到系统整合的深度探索 图书名称: 现代生物医学:从分子调控到系统整合的深度探索 图书简介: 本书旨在全面梳理和深入剖析当代生物医学研究的前沿进展,尤其侧重于如何将微观层面的分子机制理解,提升至宏观的、动态的、相互关联的系统层面。我们正处于一个生物学知识爆炸的时代,海量数据从高通度实验技术中涌现,单纯依赖还原论的视角已不足以解释生命的复杂性。本书的构建哲学正是基于这种认知转变,力求搭建起分子生物学、细胞生物学、生物化学与系统生物学、生物信息学之间的坚实桥梁。 第一部分:基础重塑——分子机制的精细雕琢 本部分将对当前生物化学和分子生物学领域最具革命性的发现进行系统回顾和深入阐释。 第一章:蛋白质组学与结构生物学的融合: 我们将探讨冷冻电镜(Cryo-EM)技术如何以前所未有的分辨率揭示复杂蛋白质机器的三维结构,以及结构信息如何直接指导功能预测和药物设计。重点分析了蛋白质构象变化在信号转导中的关键作用,特别是那些涉及膜蛋白和大型多蛋白复合物的动态机制。书中不乏对近年来获得诺贝尔奖的蛋白质折叠研究的最新进展的详细讨论,超越经典的两级结构描述,深入至四级结构的瞬态稳定态研究。 第二章:基因调控的复杂网络: 传统的基因表达调控模型已无法完全解释细胞状态的稳态与转换。本章聚焦于表观遗传修饰(如DNA甲基化、组蛋白修饰)如何形成一个可塑的调控层,指导染色质重塑。深入分析了非编码RNA(ncRNA)——包括miRNA、lncRNA和circRNA——在转录后和转录水平上对基因表达的精细调控网络,并阐述了这些调控元件如何协同作用,共同维持或打破细胞身份。 第三章:细胞内通讯的物理化学基础: 本部分将探讨细胞如何利用物理信号(如机械力、离子梯度)作为信息载体。详细讨论了跨膜信号转导的受体动力学,以及细胞骨架如何不仅是结构支架,更是信号放大和传递的“有形线路”。特别关注了代谢物如何作为信号分子,在营养感知与细胞增殖之间建立反馈回路的最新研究。 第二部分:整合思维——从组学到通路 面对海量组学数据,如何将其有效地整合,以构建有意义的生物学模型,是现代研究的核心挑战。 第四章:多组学数据的整合策略: 本章侧重于整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据的计算方法学。介绍了贝叶斯网络、多维标度分析(MDS)等统计工具,用于识别跨越不同层次的生物标志物和潜在的驱动因子。书中强调了数据标准化、批次效应校正以及如何解释多组学数据集成后的生物学意义,避免“数据拟合”陷阱。 第五章:代谢通路的动态建模: 代谢不再被视为孤立的反应集合。本章深入探讨了代谢流分析(MFA)和通量平衡分析(FBA)的最新发展,这些方法允许我们量化和预测细胞在不同环境压力下的代谢重编程。详细分析了线粒体功能障碍如何影响整个细胞的能量平衡,并将其与炎症反应的初始阶段联系起来。 第六章:细胞状态的决策树: 细胞分化、干细胞自我更新或凋亡,本质上是复杂的决策过程。本章利用动态系统理论的视角,分析了关键转录因子网络的拓扑结构(如“开关”和“振荡器”),解释了细胞如何通过多稳态的吸引子来锁定特定的功能状态。重点案例分析了免疫细胞激活过程中的阈值效应和不可逆转化的机制。 第三部分:应用前沿——疾病理解与精准干预 基于对复杂生物系统的深入理解,本部分将目光投向最具临床转化潜力的领域。 第七章:免疫微环境的复杂互动: 现代肿瘤学和自身免疫病研究的核心在于理解肿瘤或炎症部位的“微环境”。本书详细描述了肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)、肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)以及细胞外基质(ECM)之间的复杂串扰。分析了免疫检查点分子如何被细胞外基质的物理特性所调节,以及如何通过靶向基质而非单纯靶向T细胞,来实现更持久的抗肿瘤反应。 第八章:药物反应的个体差异性预测: 阐述了如何利用患者特异性的基因突变数据和细胞表型数据,构建具有预测能力的药物敏感性模型。探讨了类器官模型(Organoids)和“芯片上的器官”(Organs-on-a-Chip)技术如何提供更接近体内环境的体外药效学评估,超越传统二维细胞培养的局限性。着重讨论了如何利用单细胞测序数据识别罕见的、对抗治疗产生抵抗力的细胞亚群,从而指导下一代联合治疗方案的设计。 第九章:从大数据到可操作的生物标志物: 本章总结了如何将复杂的系统生物学发现转化为临床实践。讨论了时间序列分析在疾病进程监测中的应用,例如利用循环游离DNA(cfDNA)或循环肿瘤细胞(CTCs)的动态变化来评估治疗效果。最后,对未来生物医学研究的趋势进行了展望,强调了跨学科合作和计算工具普及的必然性,以期最终实现真正意义上的精准医疗。 本书的撰写风格严谨而具有启发性,面向研究生、博士后研究人员以及希望拓宽研究视野的资深科研工作者。它不仅是知识的汇编,更是一种思维模式的转变指南,引导读者从碎片化的观察走向整体的认知。

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