Laboratory Manual of Biomathematics

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出版者:Academic Pr
作者:Robeva, Raina Stefanova/ Kirkwood, James R.
出品人:
页数:192
译者:
出版时间:2007-9
价格:269.00元
装帧:Pap
isbn号码:9780123740229
丛书系列:
图书标签:
  • 生物数学
  • 数学建模
  • 生物统计
  • 实验指导
  • 生物工程
  • 应用数学
  • 科学计算
  • 数据分析
  • 生物信息学
  • 高等教育
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具体描述

Designed as supplemental material to the textbook An Invitation to Biomathematics , this laboratory manual expertly aids students who wish to gain a deeper understanding of solving biological issues with computer programs. This manual provides hands-on exploration of model development, model validation, and model refinement, enabling students to truly experience advancements made in biology by mathematical models. Each of the projects offered can be used as individual module in traditional biology or mathematics courses such as calculus, ordinary differential equations, elementary probability, statistics, and genetics.

This manual is a companion to the textbook, An Invitation of Biomathematics (sold separately ISBN: 0120887711; or as a set ISBN: 0123740290).

* Can be used as a computer lab component of a course in biomathematics or as homework projects for independent student work

* Biological topics include: Ecology, Toxicology, Microbiology, Epidemiology, Genetics, Biostatistics, Physiology, Cell Biology, and Molecular Biology

* Mathematical topics include: Discrete and continuous dynamical systems, difference equations, differential equations, probability distributions, statistics, data transformation, risk function, statistics, approximate entropy, periodic components, and pulse-detection algorithms

* Includes more than 120 exercises derived from ongoing research studies

好的,这是一份针对一本名为《Laboratory Manual of Biomathematics》的图书的详细简介,该简介描述了该书未包含的内容,并力求详尽和自然: --- 《生物数学实验室手册》:一份深度聚焦于应用与实践的指南 本手册旨在为生物科学领域的学生、研究人员及专业人士提供一个坚实的起点,帮助他们掌握生物数学模型构建与分析的核心技能。然而,需要明确指出的是,本书的范围和深度是经过精心设计的,因此,它不包含以下特定领域或方法的详细探讨: 第一部分:理论基础与高级微积分的深度拓展 《生物数学实验室手册》侧重于应用驱动的教学模式,因此,对于纯粹的数学理论基础的深入探讨被有意地置于次要地位。具体而言: 高阶偏微分方程(PDEs)的纯数学证明与理论推导: 虽然本书会介绍诸如扩散方程、反应-扩散系统等在生物学中常见的PDE模型,但我们不会深入到这些方程的严格数学解法证明过程,例如证明特定边界条件的唯一性、收敛性或稳定性分析的完整拓扑学论证。对于高等数学背景的读者,那些涉及勒贝格积分理论、泛函分析在PDE求解中的高级应用,以及非线性动力学中更深层次的奇点分类,均不在本书的教学范围内。 拓扑数据分析(TDA)的数学基础: 尽管我们可能提及拓扑学概念在复杂网络分析中的潜在用途,但本书不包含关于持续同调(Persistent Homology)、持久性图表(Persistence Diagrams)的理论构造、辛尼泽尔复形(Vietoris-Rips complexes)的详细构建步骤,或这些工具在数据降维中严格数学意义的探讨。这些内容属于更专业的代数拓扑学领域,超出了本手册的实用性目标。 随机过程的测度论基础: 概率论在生物统计和随机模型中至关重要,但本书主要关注基于布朗运动、泊松过程等经典随机过程的直接应用(如随机游走、扩散模型)。我们不会深入探讨概率测度(Probability Measures)的严格定义、$sigma$-代数、条件期望的勒贝格-尼科迪姆导数,或马尔可夫链的遍历性理论的详尽测度论证明。 第二部分:计算方法与软件工程的特定侧重 作为一本“实验室手册”,本书强调使用现有的计算工具进行模型验证和模拟。然而,我们不涉及以下层面的底层实现细节或高级编程范式: 通用数值分析算法的底层实现细节: 本手册假定读者已熟悉或将通过其他资源学习标准的数值方法(如有限差分法、有限元法)。因此,我们不会提供诸如拉格朗日插值、高斯消元法、或Runge-Kutta方法的C++或Python底层代码实现,特别是涉及到内存管理、并行计算优化(如GPU加速)的细节。 特定商业软件的全面教程或故障排除: 我们的重点是概念和模型,而不是软件操作。本书不提供关于MATLAB、R、或Python特定库(如SciPy、NumPy、Biopython)的深度API参考、安装指南、或针对复杂环境配置的故障排除章节。读者需要自行掌握所选软件平台的操作环境。 大规模计算(High-Performance Computing, HPC)的调度与优化: 对于需要模拟超大型数据集或极其复杂的非线性系统(例如,全基因组尺度的分子动力学模拟),HPC环境(如集群计算、MPI并行编程)是必需的。本手册不会涵盖作业调度系统(如SLURM)、负载均衡、或分布式内存计算的编程模型。 第三部分:跨学科交叉领域的深度挖掘 生物数学是一个广阔的领域,本手册的聚焦使得我们必须对某些前沿或高度专业化的子领域进行取舍。因此,以下内容被排除在外: 经济学、金融工程中的复杂模型引入: 尽管布莱克-斯科尔斯模型等源自金融数学,但本书不会探讨如何将金融衍生品定价模型应用于生物资源分配问题,或将博弈论(Game Theory)的复杂策略演化模型(如演化稳定策略)进行严格的经济学分析。 图像处理与计算机视觉的数学基础: 对于生物图像分析(如细胞分割、三维重建),需要用到大量的傅里叶变换、小波分析和形态学滤波。本手册不会详细介绍卷积神经网络(CNNs)的数学结构、反向传播算法的推导,或图像配准(Image Registration)的迭代优化算法。 生物信息学中的序列比对与系统发育树的统计推断: 尽管基因组学依赖数学,但本书不涉及马尔可夫隐马尔可夫模型(HMMs)在蛋白质结构预测中的应用细节,或者统计显著性检验在贝叶斯进化分析(BEAST)中的严格应用。 总结 《生物数学实验室手册》旨在作为一座桥梁,连接抽象的数学概念与具体的生物学问题。它专注于“如何”建立和分析模型,而非“为什么”数学理论在最底层的抽象层面能够成立。因此,任何需要深厚纯数学背景、底层软件工程知识,或高度专业化跨学科知识的内容,均被有意识地排除,以确保本书内容的实用性、可操作性和对目标读者的适用性。本书的价值在于其在生物学应用场景中的即时指导性,而非其作为一本数学专著的理论完整性。 ---

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