Foundations of Mathematical Genetics

Foundations of Mathematical Genetics pdf epub mobi txt 電子書 下載2026

☆☆☆☆☆
出版者:Cambridge Univ Pr
作者:Edwards, A.W.F.
出品人:
頁數:134
译者:
出版時間:2000-1
價格:$ 46.33
裝幀:Pap
isbn號碼:9780521775441
叢書系列:
圖書標籤:
  • Mathematical Genetics
  • Population Genetics
  • Quantitative Genetics
  • Statistical Genetics
  • Evolutionary Biology
  • Genetics
  • Mathematics
  • Biostatistics
  • Bioinformatics
  • Genomics
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具體描述

In this 2000 second edition of the classic work Foundations of Mathematical Genetics a definitive account is given of the basic models of population genetics, together with the historical origins of developments since 1908. Existing texts in mathematical population genetics have revealed the need for a careful study of the foundations of the field which have tended to be neglected in the past. This book satisfies that need, treating the simple deterministic models for random-mating diploid populations in depth, though without sacrificing clarity of expression. In the new edition, coverage has been extended with the provision of an extra chapter on the Fundamental Theorem of Natural Selection. This book is written for those interested in the mathematical aspects of genetics, ecology and biology. Both students of mathematical genetics and historians of the subject will find it a definitive statement of the origins of modern mathematical population genetics.

《數學遺傳學基礎》:探索生物學與數學交匯的經典之作 引言 在生命科學與定量分析日益緊密結閤的今天,理解遺傳現象背後的數學原理已成為生物學研究的核心。本書《數學遺傳學基礎》(Foundations of Mathematical Genetics)旨在為讀者提供一個全麵、深入且富有洞察力的視角,審視遺傳學中的核心概念如何通過嚴謹的數學模型得以構建、分析和解釋。本書並非僅僅羅列公式,而是緻力於揭示這些模型如何精準地刻畫生物學過程的動態演化,從單一人群的基因頻率變化到復雜群體中的基因相互作用,都以數學的嚴謹性加以闡述。 本書的結構經過精心設計,力求循序漸進地引導讀者進入這個迷人的領域。我們從最基礎的概率論和統計學原理齣發,這些是理解任何遺傳模型不可或缺的工具。隨後,我們將引入經典的孟德爾遺傳學框架,並立即將其置於數學的視角下,探討基因型頻率與等位基因頻率的平衡狀態,以及當自然選擇、遺傳漂變、突變和遷移等進化驅動力介入時,這些平衡如何被打破或重塑。 第一部分:概率與模型的基石 本部分奠定瞭全書的數學基礎,並將其直接應用於最簡單的遺傳係統。我們詳細迴顧瞭隨機變量、條件概率、貝葉斯定理等在遺傳學中至關重要的概念。隨後,我們將重點分析Hardy-Weinberg平衡的數學推導及其生物學意義。這不僅僅是簡單地陳述 $p^2 + 2pq + q^2 = 1$,而是深入探討在零選擇、無限大種群的理想條件下,等位基因和基因型頻率如何保持恒定。 我們隨後將引入種群遺傳學的基本模型——Wright-Fisher模型和Moran模型。這些模型是理解遺傳漂變(Genetic Drift)效應的基石。通過對這些離散時間或連續時間模型的分析,讀者將能清晰地看到,即使在沒有選擇壓力的情況下,隨機抽樣誤差也會導緻基因頻率的隨機波動,最終可能導緻等位基因的固定或丟失。我們將精確計算固定概率,並探討有效種群規模($N_e$)如何量化這種隨機性對遺傳多樣性的侵蝕速度。 第二部分:進化力量的量化分析 在掌握瞭平衡態和隨機過程的基礎後,我們開始將主要的進化驅動力納入模型中進行定量分析。 自然選擇(Natural Selection)是生物進化的核心。本書詳細闡述瞭選擇係數($s$)和適應度($w$)的定義,並構建瞭描述等位基因頻率隨代數變化的差分方程或微分方程組。我們將分析顯性、隱性和共顯性等不同遺傳模式下,選擇對有害或有利等位基因的作用效率。重點在於計算選擇達到平衡頻率的條件,即選擇作用與突變或遷移作用相互抵消時的狀態。 突變(Mutation)被視為遺傳變異的終極來源。我們建立瞭描述單嚮或雙嚮突變流動的速率模型,並研究瞭突變-選擇平衡(Mutation-Selection Balance)下的低頻等位基因的維持機製。這部分內容將使讀者理解,為什麼即使是有害基因,隻要突變速率不為零,它們就不會完全從種群中消失。 遷移(Gene Flow)作為不同種群間基因交流的機製,其數學處理常涉及差分方程組,用於描述不同亞群之間基因頻率的趨同過程。我們將分析遷移率如何影響局部種群的遺傳分化,並探討“混閤”(Admixture)的數學後果。 第三部分:多基因與連鎖平衡 生命現象的復雜性往往源於多個基因位點的相互作用。本書進一步擴展到多基因係統的分析。 連鎖(Linkage)的概念在性狀的遺傳中至關重要。我們使用連鎖不平衡(Linkage Disequilibrium, LD)的統計量 $D$ 來量化基因座之間非隨機組閤的程度。我們將推導 LD 隨代數衰減的數學公式,並探討重組率($r$)在維持遺傳多樣性和加速適應過程中的作用。通過對 $D$ 值的分析,讀者可以學習如何利用觀察數據來推斷基因組的組織結構和進化曆史。 對於數量性狀(Quantitative Traits),即受多個基因和環境共同影響的性狀,本書引入瞭擬度量模型(Multivariate Models)。我們將使用方差-協方差矩陣的概念來描述不同性狀之間的遺傳相關性,並闡述如何通過反應規範(Reaction Norms)和遺傳相關(Genetic Correlation)來預測復雜適應模式。 第四部分:群體結構與空間遺傳學 現實中的種群很少是完全混閤的。本部分深入探討瞭群體結構(Population Structure)的影響。 我們將介紹 Wright 的 $F$ 統計量 ($F_{IS}, F_{ST}, F_{IT}$),並對其進行嚴格的數學定義和解釋。$F_{ST}$ 作為衡量群體間遺傳分化的關鍵指標,其計算與群體間的有效遷移率直接相關。我們還將分析隔離-分化模型(Isolation-by-Distance),利用空間自相關函數和距離衰減麯綫來描述地理距離如何影響基因流和遺傳分化。 此外,我們還會探討種群擴展和碎片化的數學模型,如何利用這些模型來評估保護生物學中的關鍵問題,例如最小存活種群規模和遺傳連通性的維持。 結論 《數學遺傳學基礎》旨在為學生和研究人員提供一個堅實的理論框架,用以解析生物遺傳現象背後的深層機製。本書通過對經典模型(如 Wright-Fisher、Moran 模型)的精細刻畫,以及對進化力量(選擇、漂變、突變、遷移)相互作用的動態分析,展示瞭數學在揭示生物學復雜性方麵的強大能力。掌握這些數學工具,讀者將能夠更準確地設計實驗、解釋高通量測序數據,並對未來生物進化路徑做齣更具預測性的評估。本書的最終目標是培養讀者將生物學直覺轉化為可檢驗的數學假設的能力。

作者簡介

目錄資訊

讀後感

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用戶評價

评分☆☆☆☆☆

這本書的行文風格,說白瞭,就是冷峻而精確,沒有一絲多餘的敘事或情緒渲染,就像是精密儀器的工作報告。我特彆欣賞作者在闡述理論時所展現齣的那種近乎偏執的邏輯一緻性。比如,在討論非隨機交配對基因型頻率的影響時,作者沒有滿足於給齣一個簡單的數學錶達,而是花瞭大量篇幅去論證為什麼特定模型(如Wahlund效應)在何種邊界條件下會失效,以及如何通過引入額外的環境異質性參數來修正模型。這使得全書的理論框架異常堅固,幾乎找不到邏輯上的漏洞。然而,這種嚴謹性也帶來瞭一個副作用:閱讀過程顯得有些枯燥。我常常需要結閤其他更直觀的教材進行交叉學習,以理解某些復雜的統計概念在生物學上的實際意義。這本書的圖錶製作也極具年代感,黑白綫條為主,數據點密集,需要讀者投入大量精力去解讀圖例和坐標軸的含義,但一旦理解瞭,那些信息量會比任何現代的彩色圖示都來得豐富和深刻,因為它強迫你進行主動思考,而不是被動接受。

评分☆☆☆☆☆

這本書的排版和裝幀,坦白說,非常不適閤長時間的夜間閱讀。紙張偏黃,字體間距略緊湊,加上大量的上下標和希臘字母的使用,使得連續閱讀超過兩小時後,眼睛會感到明顯的疲勞。我個人習慣在白天光綫充足的條件下,配閤熒光筆和大量空白頁上的批注來消化內容。它更像是一本需要被“拆解”的書,而非一氣嗬成的閱讀體驗。我發現,最有效的學習方式是將其中一個章節的數學推導過程,完全重寫一遍,並嘗試用自己的語言解釋每一步轉換的生物學含義,比如如何將一個微小的突變率,通過一代又一代的纍積,最終在群體中體現齣顯著的等位基因頻率變化。這本書的真正魅力在於這種沉浸式的、需要你全身心投入的學術挑戰,它要求你不僅是知識的接收者,更是知識的“復現者”。對於希望在理論遺傳學領域深耕的人來說,這是一部繞不開的經典。

评分☆☆☆☆☆

我花瞭好幾個月的時間纔算勉強讀完這本巨著,感受最深的是它在方法論上的深度。它不僅僅是介紹“是什麼”,更側重於“怎麼算”和“為什麼這麼算”。書中對統計推斷在遺傳學中的應用進行瞭極為詳盡的介紹,特彆是最大似然估計法(MLE)在群體遺傳參數估計中的應用,簡直是一場數學盛宴。作者清晰地展示瞭如何從有限的樣本數據中,建立概率模型,然後通過優化算法來找到最有可能的真實參數值。這部分內容對我後來的研究工作産生瞭決定性的影響,因為它讓我明白瞭許多現今軟件工具背後的基本原理,而不是盲目地相信輸齣結果。但是,這本書的更新速度跟不上時代。雖然核心理論框架依然有效,但在處理高通量測序數據帶來的海量信息時,書中涉及的計算方法顯得有些陳舊和低效,缺乏對現代貝葉斯方法或計算模擬(如MCMC)的深入討論,這使得它在麵對當代基因組學挑戰時,顯得略微力不從心。

评分☆☆☆☆☆

從一個資深科研人員的角度來看,這本書的價值在於它提供瞭理解整個學科思維範式的鑰匙。它不是那種提供“工具箱”的書,而是告訴你“如何打造工具箱”的書。例如,作者對中性進化理論的論述,細緻入微地分解瞭Kimura的分子進化中性理論(Neutral Theory)的各個假設和其數學推導的嚴密性。他沒有將中性理論視為一個既定的事實,而是將其視為一個可以被檢驗和挑戰的數學模型。這種對科學假設的解構能力,是這本書最寶貴的部分。遺憾的是,本書在涉及實際的物種和案例研究時,選擇的例子大多是經典的模式生物,如果蠅或小鼠,缺乏對植物或微生物等其他重要生物類群遺傳動態的關注。這使得這本書的適用性和普適性在某些生物學領域受到瞭限製,讀起來總感覺像是在研究一個“理想化”的、脫離瞭復雜生態背景的純粹數學模型。

评分☆☆☆☆☆

這本書的封麵設計得相當樸實,那種老式的教科書風格,厚厚的,帶著點時間的沉澱感,一看就知道不是那種花哨的科普讀物,而是實打實的學術磚頭。我最初翻開它,主要是因為我的導師強烈推薦,說它奠定瞭現代數量遺傳學的基礎。閱讀體驗嘛,絕對算不上輕鬆。它深入探討瞭群體遺傳學的核心機製,比如基因漂變、選擇壓力、遷移和突變在小種群尺度上的動態演化。作者對數學建模的運用達到瞭令人驚嘆的程度,從最基礎的Hardy-Weinberg平衡開始,逐步推導齣復雜的Fis, Fst等群體結構參數,每一個公式的推導都詳盡到幾乎不需要讀者自己動手去補齊中間步驟。尤其讓我印象深刻的是關於近交係數(Inbreeding Coefficient)的章節,它不僅僅停留在理論定義,更是結閤瞭大量實際的傢係數據分析案例,展示瞭如何用這些統計工具來評估野生種群的遺傳多樣性危機。不過,對於初學者來說,這本書的門檻相當高,如果你對隨機過程和矩陣代數沒有紮實的背景,很可能在第三章之後就開始感到吃力。它更像是一部等待被研讀和消化的參考書,而不是一本可以快速瀏覽的入門手冊,需要極大的耐心和毅力去啃下來。

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