Oligonucleotide Synthesis

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出版者:Humana Pr Inc
作者:Herdewijn, Piet (EDT)
出品人:
页数:435
译者:
出版时间:
价格:149
装帧:HRD
isbn号码:9781588292339
丛书系列:
图书标签:
  • Oligonucleotide Synthesis
  • DNA Synthesis
  • RNA Synthesis
  • Molecular Biology
  • Biochemistry
  • Genetic Engineering
  • Nucleic Acid Chemistry
  • Peptide Nucleic Acid
  • Solid-Phase Synthesis
  • Automated Synthesis
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具体描述

细胞与分子生物学前沿:基因编辑与蛋白质工程的革命 本书聚焦于现代生物技术最引人注目的两个前沿领域:精确的基因编辑技术(以CRISPR/Cas系统为核心)以及功能驱动的蛋白质工程。 旨在为生命科学研究人员、生物技术工程师以及高年级本科生和研究生提供一个全面、深入且实用的技术指南与理论框架。 第一部分:基因组编辑的精确定位与调控 随着人类对生命活动分子机制理解的加深,精确修改生命蓝图的能力已成为推动生物医学和基础研究发展的核心驱动力。本书将详细解析当前主流的基因组编辑工具箱,并深入探讨其实施的策略与面临的挑战。 第一章:CRISPR/Cas系统的理论基石与演进 本章追溯了CRISPR(规律间隔成簇短回文重复序列)现象的发现历程,从细菌的适应性免疫系统到被快速“驯化”为强大的基因编辑工具。我们将详尽阐述CRISPR-Cas9系统的核心组分——Cas9核酸内切酶和引导RNA(gRNA)的工作原理,包括PAM序列识别、双链断裂(DSB)的形成机制。 1.1 细菌免疫机制的生物学基础: 深入探讨I型、II型、III型CRISPR系统的结构差异及其在自然界中的功能。 1.2 Cas9的分子识别与切割动力学: 分析gRNA与靶标DNA的杂交过程、R型环的形成以及切割效率的影响因素。 1.3 第二代与第三代编辑工具的突破: 重点介绍碱基编辑器(Base Editors, BEs)如何实现无DSB的单碱基转换(如胞嘧啶到胸腺嘧啶,或腺嘌呤到鸟嘌呤),以及先导编辑器(Prime Editing, PE)如何通过逆转录酶实现“搜索并替换”的精准编辑,极大地拓宽了可编辑的范围。 第二章:递送策略与脱靶效应的控制 基因编辑工具的有效性,很大程度上取决于它们能否安全、高效地递送到目标细胞和细胞核内。 2.1 递送系统的优化: 详细比较基于病毒载体(如腺相关病毒AAV、慢病毒Lentivirus)和非病毒载体(如脂质纳米粒LNP、电穿孔)在体内外递送时的优势、局限性及适用场景。特别关注LNP在mRNA疫苗和基因疗法中的应用进展。 2.2 脱靶效应的评估与抑制: 脱靶是临床转化中的核心障碍。本章阐述利用计算工具(如BLAST、Cas-OFFinder)预测潜在脱靶位点的方法,并介绍通过优化gRNA设计、使用高保真度Cas变体(如eCas9、HiFi Cas9)以及时空控制(如添加诱导开关)来最小化脱靶风险的实验策略。 第二章:体细胞与生殖细胞编辑的伦理与法规 基因编辑技术的强大能力,必然伴随着深刻的伦理和社会考量。本章将审视当前国际社会在体细胞治疗(Somatic Cell Therapy)与生殖细胞编辑(Germline Editing)方面的监管框架和伦理争议点,引导读者以负责任的态度进行研究。 --- 第二部分:蛋白质工程:从序列到功能的理性设计 蛋白质是生命活动的执行者,对其结构和功能的精确调控是实现精准医疗和开发新型工业酶的关键。本书深入探讨如何超越自然选择的限制,通过理性设计和高通量筛选来创造具有特定功能的蛋白质分子。 第三章:结构生物学在理性设计中的应用 理解蛋白质的三维结构是进行理性蛋白质设计的先决条件。本章侧重于从原子层面解析结构信息,并将其转化为可操作的设计参数。 3.1 结构解析技术的集成: 比较冷冻电镜(Cryo-EM)、X射线晶体学和核磁共振(NMR)在确定蛋白质构象和确定活性位点几何结构方面的能力和局限性。 3.2 蛋白质稳定性与折叠热力学: 探讨如何利用ΔG计算和分子动力学模拟(MD)来预测和优化蛋白质的溶解性和稳定性,例如通过增加二硫键或改变疏水核心来增强耐受性。 3.3 活性位点的改造与重塑: 详细分析如何通过点突变(Site-Directed Mutagenesis)来改变酶的底物特异性、提高催化效率(kcat/Km),或引入新的功能基团。 第四章:定向进化与高通量筛选平台 当理性设计面临复杂蛋白质网络或未知结构时,定向进化(Directed Evolution)提供了一种强大的、模仿自然选择的实验方法。 4.1 进化文库的构建技术: 详细介绍产生多样性突变库的方法,包括随机错配PCR(Error-Prone PCR)、DNA Shuffle和卡式定向进化(Kuhn-Manteau Evolution)。 4.2 筛选与选择平台的革新: 筛选系统的灵敏度和通量决定了定向进化的成功率。本章重点介绍以下关键技术: 酵母展示系统(Yeast Display): 适用于抗体亲和力成熟和受体工程。 噬菌体展示系统(Phage Display): 经典工具,用于肽段和单链抗体片段(scFv)的筛选。 微流控技术(Microfluidics)在单细胞分析中的应用: 结合微滴生成技术,实现对数百万个蛋白质变体的独立培养和表型分析,显著提高了筛选效率。 第五章:功能化蛋白质的构建:融合蛋白与多价系统 现代蛋白质工程不仅关注单个分子的性能,更关注它们如何协同工作以实现复杂功能。 5.1 融合蛋白的设计原则: 讨论如何通过引入柔性接头(Linkers)来连接不同功能域(如结合域、催化域、信号肽),以构建具有双重或多重功能的分子机器。重点分析不同接头长度和化学性质对整体生物活性的影响。 5.2 抗体药物偶联物(ADCs)的工程学: ADC是精准靶向治疗的典范。本章深入探讨了抗体部分的优化(如人源化、Fc效应的调控)、连接体的选择(如可裂解或不可裂解)以及药物载荷(Payload)的偶联化学,以平衡稳定性和靶点释放效率。 5.3 异聚体与多聚体的装配: 探索利用DNA折纸术(DNA Origami)或自组装肽段来指导蛋白质复合物的精确装配,用于构建纳米尺度的药物递送载体或仿生催化系统。 结语 本书的最终目标是建立一个从基因编辑到蛋白质制造的完整技术闭环。通过掌握这些尖端技术,读者将有能力设计出更安全、更高效的基因疗法,并创造出具有前所未有功能的新型生物分子催化剂和诊断试剂,从而加速生命科学从基础发现到实际应用的转化进程。

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