Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS

Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:SAS Institute
作者:Arnold Saxton
出品人:
页数:312
译者:
出版时间:2004-11-10
价格:USD 53.95
装帧:Paperback
isbn号码:9781590475072
丛书系列:
图书标签:
  • SAS
  • 遗传分析
  • 复杂性状
  • 数量遗传学
  • 统计遗传学
  • 基因组学
  • 生物统计学
  • 遗传数据分析
  • SAS编程
  • 遗传学
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具体描述

Arnold Saxton, Ph.D., the editor of this volume, is a professor of animal science at the University of Tennessee, Knoxville. During years of research and teaching in statistics and genetics, Dr. Saxton recognized the need for a how-to introduction to SAS computer analysis for complex-trait genetics. He assembled 16 coauthors from around the world to create this unique compilation. Example-rich and experiment-driven, Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS explicitly demonstrates how you can use SAS and SAS/Genetics to extract answers from your quantitative and molecular genetics data. The book guides you through the mix of genetic, statistical, and SAS skills that are needed, enabling you to apply what you've learned to your own experimental data. You'll find this an invaluable resource whether you are a researcher, scientist, graduate student, bioinformatician, or statistician--or any other SAS user interested in joining the highly active and exciting field of genetic analysis.

基因分析与复杂性状:利用SAS的深度探索 本书为对复杂性状的基因分析感兴趣的读者提供了一条全面而深入的学习路径,重点在于运用统计分析软件SAS进行实操。我们旨在揭示如何通过精确的统计方法,从庞大而多维度的数据中挖掘出隐藏的遗传信息,进而理解复杂性状的遗传基础。 核心内容聚焦: 本书将引导您掌握一系列先进的基因分析技术,特别强调SAS的强大功能在其中的应用。我们将从基础概念入手,逐步深入到复杂的统计模型和前沿的分析方法。 1. 复杂性状的理解与建模: 定义与挑战: 我们首先会清晰地界定什么是复杂性状(如糖尿病、高血压、某些癌症等),并阐述其遗传模式的特点——多基因、基因-基因相互作用(epistasis)、基因-环境相互作用(GxE)以及表观遗传学等因素的共同作用,这使得其遗传分析比孟德尔遗传性状更为复杂。 统计学基础回顾: 为确保读者能充分理解后续的分析,我们将快速回顾必要的统计学知识,包括假设检验、回归分析、方差分析、多重比较等,并强调这些基础在基因分析中的重要性。 数据结构与预处理: 基因组数据通常具有高度的结构性和庞大的规模。本书将详细介绍基因型数据(如SNP、拷贝数变异)和表型数据(如疾病状态、生理指标)的常见格式,以及在SAS中进行数据清洗、转换、编码、缺失值处理和异常值检测的实用技巧。这包括如何使用SAS的数据步(DATA step)高效地管理和转换大型数据集。 2. SAS在基因分析中的应用: SAS基础语法与程序设计: 本书并非SAS入门指南,但会简要回顾SAS的核心功能,包括PROC步(如PROC SQL, PROC FREQ, PROC MEANS)以及SAS宏(SAS Macros)的使用,这些工具在数据管理和初步探索性分析中至关重要。 描述性统计与探索性数据分析(EDA): 在SAS中,我们将学习如何计算各种统计量(均值、方差、频率分布),绘制直方图、散点图、箱线图等,以初步了解基因型与表型之间的关系,并识别潜在的关联模式。 关联性分析: 单基因关联分析(Single Marker Association): 详细介绍如何在SAS中实现对单个基因标记(如SNP)与复杂性状之间的关联分析。我们将涵盖卡方检验、Logistic回归(对于二分类表型)和线性回归(对于连续表型)等基本方法,并重点讲解如何在SAS中进行卡方检验(PROC FREQ)、逻辑回归(PROC LOGISTIC)和线性回归(PROC REG)。 多基因协同作用分析(Epistasis): 深入探讨基因-基因相互作用的重要性,并展示如何在SAS中利用回归模型(例如,在模型中加入基因型变量的交互项)来检测和量化这些作用。我们将介绍如何构建包含交互项的SAS模型,以及如何解读交互项的统计显著性。 遗传模型构建与拟合: 广义加性模型(GAM): 讲解如何使用SAS中的广义线性模型(GLM)或广义线性混合模型(GLMM)来拟合包含多个基因位点效应的加性模型。 混合效应模型(Mixed Models): 针对具有遗传相关性的样本(如家系数据、双胞胎数据),本书将重点介绍SAS中的混合效应模型(PROC MIXED, PROC GLMMIX)在处理协方差结构、估计遗传力(heritability)以及识别与性状相关的基因位点时的应用。我们将详细解析模型中的固定效应和随机效应,以及如何解释模型输出以推断遗传成分。 GWAS(全基因组关联研究)数据的分析策略: GWAS数据的准备与质量控制: 讲解GWAS数据独有的特点(如庞大的SNP数量、群体结构、家系信息),以及在SAS中进行关键的质量控制步骤,包括SNP的剔除(如Hardy-Weinberg平衡检验、Minor Allele Frequency过滤)、样本的剔除(如纯合子缺失、高亲缘关系)等。 群体结构校正: 重点阐述群体结构对关联分析结果的影响,并详细介绍如何在SAS中应用主成分分析(PCA)或混合模型(如GEMMA, EIGENSTRAT等方法在SAS中的实现思路或利用SAS调用外部程序)来校正群体效应。 关联测试的实现: 在SAS中,我们将演示如何运用SAS/STAT模块中的各种回归过程(如PROC LOGISTIC, PROC REG, PROC GENMOD)结合适当的协变量(如主成分、性别、年龄)来执行GWAS的关联测试。 多重检验校正: 探讨GWAS中面临的严峻多重检验问题,并介绍Bonferroni校正、False Discovery Rate (FDR) 控制等方法在SAS中的实现,以及如何解读校正后的p值(如Q-Q图的绘制)。 多变量基因分析: 考虑多个表型: 介绍如何同时分析多个相关性状的遗传基础,例如使用多变量回归或多元统计方法在SAS中进行分析,以发现同时影响多个性状的基因位点。 基因-环境交互作用(GxE): 深入探讨环境因素如何调节基因效应,并在SAS模型中加入基因型与环境因素的交互项,以识别GxE效应。 3. 高级主题与前沿进展: 基因组预测(Genomic Prediction): 介绍如何利用SAS对大规模基因组数据进行个体基因组育种值(GEBV)的预测,这在育种和精准医疗领域具有重要应用。我们将探讨BLUP(Best Linear Unbiased Prediction)等方法在SAS中的实现。 表观遗传学数据分析简介: 简要介绍DNA甲基化、组蛋白修饰等表观遗传学数据与复杂性状的关系,以及在SAS中进行初步分析的思路(例如,将表观遗传标志物作为协变量或潜在的基因型替代物纳入模型)。 SAS可视化工具的应用: 强调SAS/GRAPH、SAS/STAT等模块在数据可视化中的作用,例如绘制 Manhattan plot、QQ plot、连锁不平衡图等,以直观展示分析结果。 学习方法与工具: 本书将贯穿大量SAS代码示例,涵盖数据输入、处理、建模、结果输出及可视化的完整流程。每章都配有实际案例,力求让读者在掌握理论知识的同时,能够熟练运用SAS解决实际的基因分析问题。我们将强调SAS的灵活性和可扩展性,鼓励读者根据具体研究需求调整和创新分析方法。 目标读者: 本书适合生命科学、生物信息学、遗传学、医学、农学等领域的研究人员、博士后、研究生以及任何希望深入学习利用SAS进行复杂性状基因分析的从业者。即便您对SAS并非精通,只要具备基本的统计学概念,本书也能为您打开基因分析的专业大门。 通过本书的学习,您将能够独立地设计、执行和解读复杂性状的基因组关联研究,从而为揭示疾病机理、改善作物育种、推动精准医疗等领域做出贡献。

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用户评价

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当我看到这本书的封面时,一股学术研究的严谨感便油然而生。书名《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》非常直观地勾勒出了这本书的核心内容,它明确地指出了本书将SAS这一强大的统计分析软件应用于复杂性状的遗传分析。我一直对那些由多基因、基因-环境互作共同影响的性状充满了浓厚的兴趣,例如人类的常见病、农作物的优良性状等。然而,这些性状的遗传机制往往错综复杂,难以用简单的统计方法来解析。SAS,作为统计学界公认的强大工具,其在数据处理、模型构建和统计推断方面的能力毋庸置疑。我非常期待这本书能够为我提供一套系统的、基于SAS的复杂性状遗传分析方法。我设想,书中会详细讲解如何利用SAS来实施全基因组关联研究(GWAS),包括如何进行数据预处理、质量控制、统计模型构建、以及对显著性位点的解读。我尤其关注书中对SAS中混合线性模型(LMM)应用的阐述,因为LMM在处理具有群体结构的遗传数据时表现出色。此外,我也好奇书中是否会涵盖如何利用SAS来评估基因-环境互作(GxE)效应,以及如何进行多性状分析,因为许多复杂性状往往与多个表型密切相关。这本书,对我而言,不仅仅是一本技术手册,更是一份深入理解复杂遗传机制的路线图,它将帮助我有效地运用SAS,在未知领域探索更深层次的科学奥秘。

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这本书的封面设计,带有浓厚的学术气息,深邃的蓝色背景搭配简洁的字体,似乎在邀请我去探索基因世界的深邃与奥秘。我的研究领域涉及一些极其复杂的遗传疾病,这些疾病的发病机制往往不是由单个基因的突变引起,而是由多个基因的微小变异以及与环境因素的复杂互动所导致。长期以来,我一直在寻找一本能够系统地指导我如何运用现代统计学工具来解析这些复杂遗传模式的著作。而《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》这个书名,恰恰精准地击中了我的需求。SAS,作为我一直以来非常信赖的统计分析软件,其强大的数据处理和模型构建能力,一直是我解决复杂科学问题的强大后盾。我迫切地希望这本书能够将SAS的强大功能与复杂性状的遗传分析理论完美地结合起来,为我提供一套清晰、可操作的指南。我期待书中能够深入讲解如何利用SAS构建和评估各种复杂的遗传模型,例如如何利用SAS来实施全基因组关联研究(GWAS),如何进行基因-基因互作(GxE)分析,以及如何评估这些互作效应对性状的贡献。我尤其关注书中对SAS中各种统计检验方法和模型选择策略的论述,因为在处理复杂性状时,如何准确地识别真正的遗传信号并排除假阳性至关重要。我相信,这本书将成为我攻克复杂遗传性状研究难题的利器,它将帮助我更有效地利用SAS,深入揭示生命科学中的未知领域,并在我的研究道路上取得新的突破。

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这本书的封面设计简洁而大气,蓝色的底色仿佛浩瀚的基因宇宙,白色的字体则像指引方向的星光,预示着一次深度探索的旅程。我被这本书的名称——《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》深深吸引。在我多年的研究生涯中,我曾多次面对那些由多基因、基因-环境互作共同决定的复杂性状,它们的研究难度和深度远超单一基因效应。我曾尝试使用一些统计软件,但总感觉无法完全捕捉到这些性状背后的全部遗传信息。SAS,作为一名资深的统计分析软件,其强大的数据处理和建模能力,一直是我心中的“瑞士军刀”。我非常好奇,这本书将如何将SAS这个工具与复杂性状的遗传分析这两个看似独立的领域巧妙地结合起来。我期待书中能够提供详细的SAS代码示例,指导我如何构建复杂的遗传模型,例如如何使用SAS来实施全基因组关联研究(GWAS),如何进行连锁不平衡分析,以及如何评估基因位点之间的相互作用。我尤其关注书中关于如何处理群体结构、近亲繁殖等因素对GWAS结果的影响,因为这些因素往往是导致假阳性结果的罪魁祸首。此外,对于那些具有高度遗传力的疾病,如阿尔茨海默病、精神分裂症等,这本书是否会讲解如何利用SAS来整合多项研究的GWAS数据,以提高统计效能并发现新的遗传关联?我相信,这本书将是我探索复杂遗传性状奥秘的绝佳伙伴,它将为我提供一套行之有效的工具和方法,帮助我更深入地理解生命体的奥秘,并为相关领域的科学研究贡献我的力量。

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这本书的书名,就像一声召唤,吸引着我这位在复杂性状研究领域不断探索的学者。我始终坚信,生命的奥秘,尤其是在遗传层面,往往隐藏在那些看似简单却又错综复杂的性状之中。这些复杂性状,如人类的多基因遗传疾病、农作物的产量潜力、甚至是个体行为的某些倾向,其背后涉及的遗传因素远比我们最初想象的要复杂得多。在我多年的研究经历中,我曾多次在面对海量基因组数据和复杂表型时感到力不从心,传统的统计方法显得捉襟见肘。而《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》这个书名,则让我看到了希望。SAS,这个在统计分析界举足轻重的软件,其强大的数据处理能力、灵活的模型构建以及详实的统计推断功能,一直是我所仰慕的。我非常期待这本书能够将SAS的强大功能,与复杂性状遗传分析这一前沿领域巧妙地融合。我设想,书中会提供详实的SAS代码示例,指导我如何利用SAS来构建和评估各种复杂的遗传模型,例如如何进行全基因组关联研究(GWAS),如何识别和分析基因-基因互作(GxE),以及如何评估环境因素在性状形成中的作用。我尤其关注书中对于SAS在处理大规模基因组数据时的效率和准确性的阐述,以及如何利用SAS来进行复杂性状的预测和应用。这本书,在我看来,不仅是一本技术指南,更是一扇通往更深层次理解生命遗传规律的窗口,它将赋能我,让我能够更有效地驾驭复杂性状的研究,并为揭示生命科学的未知领域贡献我的力量。

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这本书的封面,带着一种古朴而又充满智慧的气息,仿佛一位老者在向我娓娓道来基因世界的奥秘。我之所以会被这本书吸引,是因为我长久以来对于“复杂性状”这个概念充满好奇。我知道,人类健康、农作物产量、甚至动物的某些行为特征,都受到非简单的遗传模式影响,这些性状的遗传基础往往交织着多对基因以及与环境的复杂互动。在我的学术生涯中,我曾尝试过使用一些基础的统计软件来分析这类数据,但总是感觉力不从心,数据分析的结果难以令人信服。而这本书明确地提出了“使用SAS进行遗传分析”,这让我眼前一亮。SAS,这个在统计学界享有盛誉的软件,其强大的数据处理和建模能力,早已名声在外。我设想,这本书将不再是泛泛而谈,而是会深入到SAS的具体操作层面,提供清晰的SAS代码示例,指导读者如何构建和运行复杂的遗传模型。我非常期待书中能够讲解如何利用SAS的Proc GLM、Proc Mixed等过程来实现对数量性状位点(QTL)的精细定位,以及如何运用SAS来评估不同基因型在不同环境条件下的表型表现。另外,对于那些由大量基因共同贡献的性状,比如身高、智力、或者某些精神疾病,这本书是否会介绍如何使用SAS来构建多基因风险评分(PRS)模型?这是一个我非常关注的方向。我相信,通过这本书的学习,我将能够摆脱以往的瓶颈,更加自信地驾驭复杂性状的遗传分析,为揭示生命的奥秘贡献我的力量。

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收到这本书的瞬间,我的心跳明显加速了,那是一种在知识的海洋中发现一座宝藏的兴奋感。书名《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》精准地捕捉到了我一直以来在研究中遇到的核心挑战。我曾多次在面对多基因影响的性状时感到力不从心,传统的单基因分析方法显得苍白无力,而SAS作为统计分析领域的巨头,我一直知道它拥有强大的能力,却苦于没有一本能够系统地指导我如何将其应用于复杂的遗传问题。这本书的出现,就像是为我点亮了前行的灯塔。我设想,书中会详细阐述各种适用于复杂性状的统计模型,例如混合线性模型、主成分回归、以及全基因组关联分析(GWAS)中的一些高级应用。我尤其期待看到书中如何讲解在SAS环境下进行GWAS的各个步骤,包括数据预处理、QC、基因型和表型数据的匹配、以及最终的显著性检验和结果解读。我知道,GWAS是当前研究复杂性状遗传基础的主流方法,而SAS提供的灵活性和强大的计算能力,无疑是处理海量基因组数据的不二之选。我还会密切关注书中对于多重检验校正的讨论,这是GWAS中最容易出错也最关键的环节之一。另外,我也希望书中能涵盖一些关于如何整合不同类型遗传数据(如SNP、拷贝数变异、结构变异)的分析策略,因为真实世界中的复杂性状往往受到多种遗传因素的共同影响。对于我这个在生物统计学领域摸爬滚打多年的研究者来说,这本书简直是量身定做,它预示着我将能够更有效地理解和探索复杂性状背后的遗传机制,从而在我的研究领域取得更大的突破。

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当我翻开这本书,便被其严谨的学术风格所吸引。书名《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》直接了当地表明了其核心主题,同时也精准地触及了我长期以来在科研中遇到的挑战。复杂性状,例如人类的多基因遗传疾病、农作物的产量和抗逆性等,其遗传基础往往错综复杂,涉及多对基因的累积效应、基因间的相互作用以及与环境因素的动态调控。这些复杂的遗传模式,对传统的单基因分析方法提出了巨大的挑战。SAS,作为一款功能强大、应用广泛的统计分析软件,其在处理复杂数据和构建精细模型方面的能力,一直备受推崇。我非常期待这本书能够将SAS的强大统计能力,与复杂性状的遗传分析这两个关键领域有机地结合起来。我设想,书中将提供一系列详实的SAS程序代码,指导读者如何利用SAS来构建和评估各种复杂的遗传模型,例如如何进行全基因组关联研究(GWAS),如何进行基因-基因互作(GxE)分析,以及如何利用SAS来量化和解释基因-环境互作(GxE)效应。我尤其关注书中对SAS中统计模型选择、假设检验以及结果解读的深入探讨,因为在复杂性状的遗传分析中,准确的模型选择和科学的结果解释至关重要。此外,我也好奇书中是否会涵盖一些关于如何利用SAS进行复杂性状的预测,例如利用全基因组测序数据构建多基因风险评分(PRS)等前沿应用。这本书,对我来说,不仅是一本技术工具书,更是一份深入理解生命科学复杂性的宝贵指南,它将为我提供一套系统而有效的分析框架,帮助我在复杂性状的研究领域取得更大的突破。

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拿到这本书,我第一反应就是:“终于来了!”。我的研究方向涉及一些非常复杂的遗传疾病,这些疾病的遗传学背景极其复杂,常常涉及多个基因的相互作用,以及基因与环境之间的复杂调控。长期以来,我一直在寻找一本能够系统地指导我如何运用统计学工具来解析这些复杂遗传模式的著作。而《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》这个书名,立刻就击中了我的痛点。SAS,作为我一直以来信赖但尚未充分挖掘其在遗传分析领域潜力的工具,与“复杂性状遗传分析”的结合,简直是完美的配对。我满怀期待地认为,这本书会深入讲解如何利用SAS来构建和验证各种复杂的遗传模型。我尤其好奇,书中会如何阐述基因-基因互作(GxE)和基因-环境互作(GxE)在SAS中的建模方法。这些互作效应往往是理解复杂性状的关键,但其统计建模和分析却充满了挑战。我希望书中能够提供具体的SAS程序代码,演示如何识别和量化这些互作效应,并如何解释其生物学意义。此外,对于那些具有高度遗传力但又难以定位具体基因的性状,这本书是否会介绍一些前沿的分析方法,例如利用全基因组关联研究(GWAS)的变异数据来推断潜在的候选基因或通路?我深信,这本书将成为我在复杂遗传性状研究领域的一位不可或缺的良师益友,它将帮助我突破技术的瓶颈,更深入地理解生命科学中的未知领域,并最终推动我的研究向前发展。

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这本书的封面设计就透着一股严谨与沉静,深蓝色的背景搭配银白色的字体,给人一种沉甸甸的学术感,恰如其分地预示了其内容的分量。我拿到这本书时,脑海中立刻浮现出那些在实验室里埋头苦干的夜晚,以及面对复杂数据时,那种既渴望又有些畏惧的心情。这本书显然不是一本轻松的读物,它指向的是一个充满挑战但也充满回报的领域——复杂性状的遗传分析。我一直对人类疾病的发病机制以及植物育种中的关键性状改良深感兴趣,而复杂性状的遗传分析正是连接基础研究与实际应用的桥梁。这本书的书名本身就勾勒出了一个宏大的图景,它承诺将SAS这个强大的统计分析工具与遗传分析这一尖端学科相结合,这让我对接下来的阅读充满了期待,相信它会为我提供一套系统的方法论,帮助我理解那些由多个基因和环境因素共同作用形成的性状。我尤其好奇书中会如何讲解如何利用SAS来处理那些非孟德尔遗传的疾病,例如糖尿病、心脏病,甚至是某些类型的癌症,这些疾病的遗传基础往往扑朔迷离,需要精密的统计模型才能抽丝剥茧。同时,在农业领域,培育具有抗逆性、高产量的作物品种,也离不开对复杂性状的深入挖掘。这本书的出现,无疑为我打开了一扇通往更深层次理解的大门,让我看到SAS不仅仅是一个数据处理软件,更是一个解决科学难题的强大引擎。它或许会揭示如何运用SAS构建复杂的模型,识别出潜在的基因位点,并评估它们对性状的贡献程度。我非常期待书中能够提供详实的案例分析,让我能够将理论知识与实际操作相结合,真正掌握运用SAS进行复杂性状遗传分析的技能。这本书,在我看来,不仅仅是一本书,更是一份指南,一份通往基因组学前沿的地图。

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捧着这本书,我感到一股沉甸甸的知识力量扑面而来。书名《Genetic Analysis of Complex Traits Using SAS》直接点明了它的核心内容,也精准地触动了我多年来在复杂性状研究领域遇到的难题。我一直深知,生命体的许多关键性状,无论是人类的疾病易感性,还是农作物的产量和抗逆性,都不是由单一基因简单决定,而是由多对基因的累积效应、基因间的互作以及环境因素共同塑造。在以往的研究中,我常常感到缺乏一套系统而强大的工具来解析这些错综复杂的遗传机制。SAS,作为一种广为人知的统计分析软件,其强大的数据处理和建模能力,一直是我眼中解决复杂问题的潜在利器。我非常期待这本书能够将SAS的功能与遗传分析的理论完美结合,为我提供一套切实可行的操作指南。我设想,书中将详尽地介绍如何利用SAS来构建和评估各种遗传模型,例如多基因模型、混合效应模型,以及如何进行全基因组关联研究(GWAS)及其后续的精细定位。我尤其关注书中对SAS中统计检验和模型选择方法的论述,因为在分析复杂性状时,如何科学地选择合适的模型并准确地解释统计结果至关重要。此外,我也好奇书中是否会包含一些关于如何处理缺失数据、异常值,以及如何进行生物信息学数据与SAS分析结果整合的章节。这本书,对我来说,不仅仅是学习SAS在遗传学应用的一种方式,更是我探索生命科学未知奥秘的一把钥匙,一把能够开启复杂遗传机制大门的金钥匙。

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