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出版者:Springer Verlag

作者:Garrity, George

出品人:

页数:975

译者:

出版时间:2010-11

价格:1910.00元

装帧:HRD

isbn号码:9780387950426

丛书系列:

图书标签:

• 细菌分类学
• 细菌鉴定
• 系统细菌学
• 微生物学
• 细菌学
• Bergey's Manual
• 细菌系统学
• 微生物分类学
• 细菌生理学
• 细菌生态学

《全球微生物图谱：生命多样性的深度探索》 图书简介 本书《全球微生物图谱：生命多样性的深度探索》旨在为微生物学研究者、生物学专业学生以及对微观生命世界充满好奇的读者提供一个全面、前沿且深入的视角，用以理解地球上最丰富、最古老的生命形式——微生物。我们聚焦于超越传统分类学框架的宏大叙事，探讨微生物在生态系统功能、生物地球化学循环、人类健康与疾病，以及新兴生物技术领域中的核心作用。 本书摒弃了单一、静态的物种鉴定模式，转而采用基于功能、代谢通路和系统发育网络的动态视角来描绘微生物世界的全景。内容组织结构旨在构建一个由生态功能驱动的知识体系，而非单纯的命名学目录。 第一部分：微生物世界的生态主宰 本部分深入探讨了微生物在维持地球生命系统稳定中所扮演的关键角色。我们将从宏观尺度审视微生物群落在不同生境中的分布与结构，包括深海热液喷口、极端盐湖、极地冰盖下，以及土壤和水体等传统研究领域。 生物地球化学循环的引擎： 详细解析了微生物如何驱动氮循环（固氮、硝化、反硝化）、碳循环（光合作用、甲烷代谢、有机物分解）和硫循环。我们不仅回顾了经典代谢途径，更引入了近年来在厌氧氧化和电化学合成领域中发现的新型微生物代谢机制，强调了它们在调节大气成分和全球气候变化中的关键影响。 极端环境微生物学（Extremophiles）： 专章分析了嗜热菌、嗜冷菌、嗜盐菌、嗜酸/嗜碱菌的分子适应机制。这部分内容着重于它们的蛋白质稳定性、DNA修复系统以及独特的膜结构，展示了生命在地球物理极端条件下维持活性的非凡能力。 微生物群落生态学与相互作用： 探索微生物群落的组织规律，包括竞争、共生、拮抗等复杂的种间关系。我们运用网络分析工具来解构微生物社群的互作网络，并讨论了“群落效应”——即群落功能如何大于其单个物种功能之和的现象。 第二部分：从基因组到功能：微生物组学的革命 本部分着眼于现代分子生物学技术如何彻底改变我们对微生物多样性的认知，特别是微生物组学（Microbiomics）的兴起。 宏基因组学与培养组学（Metagenomics and Culturomics）： 详细阐述了从样本中直接提取和分析所有遗传物质的方法（宏基因组学），以及旨在扩大可培养微生物范围的新型培养技术。重点讨论了如何利用这些技术发现“微生物暗物质”——那些在经典培养条件下无法生长的物种，并预测其潜在功能。 生物信息学工具与数据整合： 介绍了用于处理高通量测序数据的关键算法和软件，包括物种丰度估算、功能基因注释和比较基因组学分析。强调了将遗传信息转化为生态学和生理学洞察的重要性。 宿主-微生物互作： 深入剖析了人类、动物和植物体内共生微生物群落的复杂性。讨论了肠道微生物组与宿主代谢、免疫系统发育及神经功能（“肠-脑轴”）之间的双向调控机制。针对病原微生物，我们分析了抗生素耐药性的基因传播网络及其全球公共卫生影响。 第三部分：微生物在技术创新中的前沿应用 本部分聚焦于微生物作为生物“工厂”和环境修复剂的巨大潜力，展望了生物技术和合成生物学的未来方向。 生物燃料与生物材料： 探讨了利用工程化的微生物（如蓝细菌、酵母菌）高效生产生物柴油、生物乙醇、以及可降解塑料（如PHA）的最新进展。讨论了如何通过代谢工程优化产率和经济可行性。 生物修复（Bioremediation）与环境治理： 详细介绍了微生物降解污染物（如石油烃、重金属、持久性有机污染物）的生化途径。重点介绍了现场生物修复和生物强化技术在污染场地治理中的应用案例。 合成生物学与生物回路设计： 阐述了如何利用CRISPR/Cas系统等基因编辑工具，对微生物进行精确设计，使其能够执行特定任务，例如生产新型药物分子、构建复杂的逻辑门电路，或作为活体诊断工具。 第四部分：跨越生命之树的系统发育视角 本部分回归基础，侧重于理解微生物的进化历史和系统发育关系，但采取一种更动态的、基于功能谱系的划分方式。 细菌域与古菌域的起源与多样性： 比较分析了细菌和古菌在细胞结构、膜脂、基因表达机制上的核心差异。重点介绍了如“深根组”（Deep Branches）的发现如何重塑了我们对生命起源的理解。 病毒界的独特地位与生态学： 专题讨论了病毒（特别是噬菌体）在微生物群落动态中的调节作用，阐述了“病毒控制假说”以及病毒基因组对宿主进化的贡献。 总结与展望 本书的最终目标是激发读者对“看不见的生命王国”的敬畏与探索欲。我们相信，理解微生物的功能多样性，是解决全球环境、健康和能源挑战的关键所在。本书提供的是一把钥匙，用以解锁这个由亿万亿生命体构建的复杂而精妙的生态系统。

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我是一名资深的临床微生物实验室技术员，在与各种病原菌打交道的日子里，Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 扮演了至关重要的角色。尤其是在面对一些疑难菌株的鉴定，以及一些相对不那么常见的机会致病菌时，手册提供了最可靠的线索。我习惯性地在处理完一些常规鉴定后，如果遇到结果模棱两可的情况，就会翻阅手册，仔细比对形态学、培养特性、生化反应等关键信息。手册中对每一个菌种的描述都详实入微，从菌落的形状、颜色，到细胞的形态、染色特性，再到各种生化酶的活性，每一个细节都经过了反复的验证和确认。这不仅帮助我更准确地鉴定出病原菌，从而为临床医生提供更精准的诊断依据，也让我对各种细菌的生物学特性有了更深入的认识。在快速发展的分子生物学时代，虽然基因测序提供了强大的鉴定工具，但传统的手册仍然是理解菌种分类学基础和深入研究的基石。我曾经因为手册中对某一类球菌详细的分类方法，成功地将一个一直以来都被错误鉴定的菌株纠正过来，这在很大程度上避免了对患者的误诊。

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我是一名对微生物学历史和分类学发展有着浓厚兴趣的业余爱好者，Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 对我来说，是一部承载着微生物学发展史的珍贵文献。每次翻阅，我都能感受到科学家们在过去几十年甚至上百年里，为了理解和分类这些微小的生命所付出的巨大努力。手册中每一版的演变，都反映了当时分类学思想的进步和新技术的应用。从最初的基于形态学和生理学特征的划分，到后来引入分子生物学证据，这种演进的过程本身就充满了科学探索的魅力。我尤其喜欢阅读手册中关于一些经典菌种的起源和发现历史的记载，这让我仿佛穿越时空，亲身经历了那些伟大的科学发现。尽管我不是专业的微生物学家，但手册的结构清晰，描述详尽，即使是初学者，也能从中获得丰富的知识。我常常会根据手册中的描述，去寻找一些老照片或者更早的文献，以此来更全面地了解这些细菌。它不仅仅是一本工具书，更是一部关于微生物学研究史的生动教材。

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作为一名微生物学领域的研究生，我深知有一本权威的参考书是多么重要。Bergey's Manual of Systematic Bacteriology，这个名字本身就代表着菌类分类学的黄金标准。我第一次接触到它，是在我大学本科时，当时我对细菌的多样性和复杂性感到无比着迷，而这本手册就像是一扇门，让我得以窥探微生物世界的奥秘。它的内容之详尽，覆盖之广泛，让我每次翻阅都能有新的发现。即使是对于一些研究了多年的经典菌种，手册中的描述也总是那么精准、权威，让我对它们有了更深刻的理解。而且，手册的编纂过程本身就凝聚了无数专家的智慧和努力，这种严谨的精神贯穿了整本书，让我深感敬佩。对于任何想要在细菌学领域深入研究的学生、研究人员，甚至是对此领域充满好奇的爱好者，这本书都绝对是不可或缺的宝藏。它的存在，极大地推动了细菌学的发展，也为我们理解生命的多样性提供了坚实的基础。我至今仍然记得，在为一个棘手的分类问题苦苦思索时，是手册中某段关于某一类群的详细描述，如同一盏明灯，指引我找到了解决问题的方向。这种“及时雨”般的帮助，在科研道路上是多么宝贵。

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作为一名生物技术公司的研发人员，Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 是我们日常工作中不可或缺的参考资料。尤其是在开发新型酶制剂、益生菌产品，或者进行生物修复技术研究时，对目标微生物的准确分类和对其生物学特性的深入了解至关重要。手册提供了关于各类细菌在工业应用中的潜力、其代谢途径以及与其他微生物的相互作用等方面的信息，这极大地加速了我们的研发进程。例如，在寻找能够高效降解特定污染物的菌株时，手册中关于不同降解菌的分类和特性描述，为我们提供了宝贵的筛选方向。我曾经在一个寻找新型抗生素产生菌的项目中，通过手册的指引，成功地锁定了一个具有潜力的细菌类群，并通过后续的实验验证，最终取得了突破性的进展。尽管手册本身的内容更新需要时间，但它所提供的坚实的分类学基础，仍然是我们进行创新性微生物应用研究的有力支撑。它就像是我们的“工具箱”，里面装满了各种珍贵的“工具”和“信息”，帮助我们在生物技术领域不断前行。

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作为一名长期从事环境微生物研究的学者，Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 对我而言，更像是一部浩瀚的细菌“百科全书”。在探索未知环境的微生物群落时，我们经常会遇到很多从未被深入研究过的细菌。这时候，手册中的分类框架和已知的菌种信息，就成为了我们分析和解析这些新发现的关键参照。它不仅帮助我们理解已有的细菌多样性，更能为我们预测和推断未知细菌的潜在生物学功能提供思路。比如，在分析土壤微生物群落结构时，手册中关于固氮菌、解磷菌等具有重要环境功能的类群的分类信息，让我能更有针对性地去挖掘和研究。我曾为一个关于海洋深层沉积物微生物群落的项目而深入研究过手册，它为我识别了大量的古菌和细菌类群，并帮助我理解它们在极端环境中的生存策略。虽然手册本身的出版时间点会限制它包含最新的分类信息，但其奠定的基础和严谨的分类方法，依然是我们在进行前沿研究时不可或缺的工具。它就像是一张详尽的地图，帮助我们在广阔的微生物世界中定位和探索。

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