Comparative Genomics

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出版者:Springer
作者:McLysaght, A.; McLysaght, Aoife; Huson, Daniel H.
出品人:
页数:167
译者:
出版时间:2005-12
价格:474.60元
装帧:Paperback
isbn号码:9783540289326
丛书系列:
图书标签:
  • 比较基因组学
  • 基因组学
  • 生物信息学
  • 进化生物学
  • 基因组分析
  • 基因组比较
  • 生物技术
  • 分子生物学
  • 遗传学
  • 计算生物学
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This book constitutes the refereed proceedings of the RECOMB 2005 Satellite Workshop, the 3rd RECOMB Comparative Genomics meeting RCG 2005, held in Dublin, Ireland in September 2005. The 14 revised full papers presented were carefully reviewed and selected from 21 initial submissions. The papers address a broad variety of aspects and components of the field of comparative genomics, ranging from new quantitative discoveries about genome structure and process to theorems on the complexity of computational problems inspired by genome comparison.

《比较基因组学》导读 尊敬的读者, 在生命科学的浩瀚星空中,基因组学无疑是最为璀璨的恒星之一。它如同一本记载着生命奥秘的宏大百科全书,等待着我们去解读、去理解。而在这门学科的深度探索中,《比较基因组学》则为我们提供了一把打开更高层次理解之门的钥匙。这本书并非直接讲述某个特定物种的基因组序列,也不是孤立地描绘基因的功能,而是着眼于生命演化过程中基因组的“对话”与“变迁”。它邀请我们站在宏观的视角,审视不同生命体之间基因组的相似与相异,从中挖掘出关于生命起源、进化机制、遗传多样性以及物种形成等一系列深刻的洞见。 想象一下,当我们凝视着橡树和银杏的叶片,或是观察着猫咪和狮子的步伐,我们能轻易地辨别出它们的不同。然而,当我们将目光投向它们更深层的遗传物质——基因组时,这种差异与相似性又会呈现出怎样的图景?《比较基因组学》正是致力于解答这一问题的学科。它借助于跨越物种界限的基因组数据,通过精密的算法和分析工具,揭示了生命蓝图在漫长演化旅程中的“修改记录”和“遗失篇章”。 本书将引领您深入理解,为什么即使是看似迥异的生物,也可能拥有相似的基因或基因组结构?这些共有的“语言”暗示着什么?而那些独有的“词汇”又如何塑造了它们各自的生存之道?通过系统性的比较,我们可以追溯基因的起源,理解基因家族的扩张与收缩,辨别基因组的重排与融合,从而构建出更为精细的生命演化谱系。这不仅是对过去的回顾,更是对未来演化趋势的预测提供了宝贵线索。 本书核心内容概览: 基因组的基石:序列比对与同源性识别。 一切比较的起点,在于识别不同基因组中的同源序列。本书将深入探讨各种序列比对算法的原理与应用,从简单的全局比对到复杂的局部比对,再到基于统计学模型的显著性评估。您将学习如何区分同源基因、同源区域,以及如何辨别偶然的相似性,为后续的深入分析奠定坚实基础。这涉及到对算法的理解,更关乎对生物学意义的解读。 基因组的骨架:结构变异与比较。 除了序列本身,基因组的结构同样承载着重要的演化信息。本书将系统性地介绍基因组结构变异(Structural Variations, SVs)的类型,包括插入、缺失、重复、倒位、易位等,并探讨它们在不同物种间发生的频率、模式和潜在的生物学功能。通过比较不同物种的基因组结构,我们可以理解基因组的组织方式如何演变,以及这些结构变异如何影响基因表达和表型差异。 基因的功能解析:保守性与新颖性。 基因的功能往往在演化过程中保持着一定程度的保守性。本书将详细阐述如何利用跨物种的基因组信息,识别保守的基因元件,推断基因的功能。同时,它也会关注基因组的“新意”——那些在特定谱系中新出现的基因或基因家族,以及它们可能扮演的角色,例如适应新环境、获得新能力等。这种对保守性与新颖性的双重关注,是理解生命适应性进化的关键。 基因组的动态演化:基因获得、丢失与复制。 基因组并非一成不变的静止实体,而是处于持续的动态演化之中。本书将深入探讨基因的获得(例如通过水平基因转移)和丢失(例如在寄生或特化生物中)如何改变基因组的组成。特别地,基因重复(gene duplication)作为驱动基因组复杂化和功能分化的重要机制,将得到详尽的介绍。您将了解基因复制如何产生新的基因副本,以及这些副本如何通过“功能分化”(neofunctionalization)、“亚功能化”(subfunctionalization)或“非功能化”(defunctionalization)等途径,为生物体带来新的能力。 系统发育的构建与基因组证据。 基因组数据为构建精确的系统发育树提供了前所未有的丰富证据。本书将介绍如何利用基因组信息,包括单拷贝基因、基因家族、基因组重排等,来推断物种间的亲缘关系,并探讨不同类型基因组数据在系统发育分析中的优势与局限。我们将学习如何通过整合多方面的基因组证据,来解决传统的系统发育学难题。 物种形成的基因组学视角。 物种的形成是一个复杂而漫长的过程,基因组的演化在其中扮演着核心角色。本书将从基因组学的角度,探讨生殖隔离的遗传基础,以及基因组不兼容性(genomic incompatibility)的形成机制。通过比较形成新物种的亲缘物种的基因组,我们可以揭示驱动物种隔离和分化的关键基因和基因组区域。 应用与展望:基因组学在现代科学中的角色。 《比较基因组学》不仅仅是一门基础理论学科,它更是推动现代生物学研究,乃至医学、农业、环境保护等领域发展的强大驱动力。本书将展望比较基因组学在理解人类疾病的遗传基础、开发新型农作物、评估生物多样性、以及应对气候变化等方面的应用潜力。您将看到,对生命基因组“比较”的深入理解,如何转化为解决现实世界问题的强大工具。 本书的阅读价值: 无论您是生命科学领域的学生、研究人员,还是对生命演化奥秘充满好奇的探索者,《比较基因组学》都将为您带来一场思维的盛宴。它将帮助您: 建立宏观的生命观: 跳出单一物种的局限,认识到所有生命体在基因组层面的深刻联系。 掌握前沿的研究工具: 熟悉用于基因组比较和分析的关键方法和技术。 深化对生命演化的理解: 从基因组的视角,揭示生命演化的驱动力、机制和模式。 启发新的研究思路: 识别目前基因组学研究中的空白和潜在的创新方向。 提升解决复杂生物学问题的能力: 将比较基因组学的方法应用于实际的研究课题。 本书的写作风格力求清晰、严谨,同时又兼具启发性。我们在内容编排上,力求逻辑连贯,循序渐进,确保读者能够从基础概念逐步深入到复杂的理论和应用。书中将穿插丰富的案例研究,展示比较基因组学在各个领域的实际应用,帮助读者将理论知识与实践紧密结合。 我们相信,《比较基因组学》将成为您探索生命奥秘旅程中不可或缺的伙伴。它不仅为您打开一扇理解生命演化深层机制的窗户,更将激发您对生命科学更广阔领域的探索热情。 期待与您一同踏上这场精彩的比较基因组学之旅。 致以最诚挚的问候, [作者署名,此处省略]

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