具体描述
本书是现代意义上系统生物学的开山之作，堪称该领域的经典图书！ 对于系统生物学的初学者而言，本书是一本很好的引路书。书中首先对系统生物学的意义给出了明确的回答，并且阐述了系统生物学研究需要开展的工作及其所采用的技术；之后围绕系统生物学的五个中心主题展开：先进的测量系统、基于实验数据的基因和代谢网络的反向工程、建模和仿真软件、细胞仿真和系统水平的分析。 阅读了这本书，会对系统生物学的起源和发展有一个非常清楚的了解，对于一个新兴的学科而言，这一点是非常重要的。作为世界上第一本有关系统生物学的图书，本书汇集了有关系统生物学研究的代表性文章和研究实例，对于新的研究人员，其设想、概念和基本思想都是非常有价值的启发。
作者简介
目录信息
1.1 引言
1.2 测量技术与实验方法
1.3 系统结构鉴定
1.4 系统行为分析
1.5 生物学系统的鲁棒性
1.6 系统组计划
1.7 系统生物学的影响
1.8 结论
参考文献
第Ⅰ部分 先进测量系统
第2章 四维显微方法自动化获取细胞系及线虫早期胚胎形成分析
第Ⅱ部分 基因表达数据的反向工程和数据挖掘
第3章 基于DBRF方法从大规模稳态基因表达数据推测基因网络
第4章 与癌症相关的基因表达矩阵分析
第5章 利用遗传规则实现从观测数据到代谢通路的自动反向工程
第Ⅲ部分 建模和仿真软件
第6章 ERATO系统生物学工作平台：多尺度与多理论的系统生物学仿真集成环境
第7章 信号转导自动模型的生物及在MAP-激酶途径中的应用
第8章 功能基因组学数据的大型生物系统建模：参数估计
第Ⅳ部分 细胞仿真
第9章 迈向虚拟生物实验室
第10章 计算细胞生物学——随机方法
第11章 细胞的计算机仿真：人体红细胞模型及其应用
第Ⅴ部分 系统水平分析
第12章 构建生物信号转导途径的数学模型：鲁棒性分析
第13章 动态平衡和信号转导中普遍存在的调节机制：双相响应调节与正反馈的结合
第14章 Rho激酶途径和肌球蛋白轻链激酶途径在肌球蛋白轻链磷酸化中的不同作用：动力学仿真研究
· · · · · · (收起)
读后感
上douban三年了，终于读够100本书，写一篇书评以纪念 系统生物学是最近5年生物学领域最热的名次，虽然这一概念由来已久，但真正如此充满活力还是在大规模高通量技术风起云涌的21世纪。 这本书是02年出版的，当时人类基因组还在测序，拟南芥基因组刚刚公布，一切都刚开始。不过...
评分上douban三年了，终于读够100本书，写一篇书评以纪念 系统生物学是最近5年生物学领域最热的名次，虽然这一概念由来已久，但真正如此充满活力还是在大规模高通量技术风起云涌的21世纪。 这本书是02年出版的，当时人类基因组还在测序，拟南芥基因组刚刚公布，一切都刚开始。不过...
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用户评价
从教学工具的角度来看，这本书的章节组织逻辑简直是为课程设计量身打造的。每一个单元的开始，都会清晰地列出本章要达成的核心学习目标（Learning Objectives），这为教师备课和学生自测提供了明确的框架。更值得称赞的是，理论讲解与实际应用之间的桥梁搭建得非常自然。在介绍完生物网络拓扑学原理后，紧接着就会出现一整块内容详述这些原理是如何被用于疾病诊断标记物的筛选，或者在新药靶点发现中的具体案例分析。这些案例的选取非常具有前瞻性，大多是近五年内发表在顶级期刊上的突破性成果，这保证了教材内容的“鲜活度”。这使得这本书不仅适合基础课程，对于研究生阶段的专业选修课，作为案例分析的支撑材料，也绝对是上上之选，它有效避免了知识的滞后性，让学习者始终站在学科前沿思考问题。
评分深入阅读后，我发现这本书最大的价值在于其对“动态性”的强调，它拒绝将生命视为一组静止的零件清单，而是将其描绘成一个不断适应、自我调控的宏大系统。书中对于反馈回路、稳态维持机制的阐述，简直是教科书级别的精彩。作者没有停留在介绍模型本身，而是深入挖掘了这些模型背后的数学逻辑和物理限制，这点非常难能可贵。例如，在讨论信号转导通路时，它不仅展示了磷酸化和去磷酸化的钟摆效应，还巧妙地引入了随机性和噪声在细胞决策中的角色，这让整个生物过程的图景变得立体且真实。我特别欣赏它在章节末尾设置的“思想实验”环节，这些问题往往不是简单的知识点复述，而是要求读者运用所学知识，对一个假设情境进行推演和预测，这极大地锻炼了读者的系统性思维能力，而非仅仅是信息的储存能力。
评分这本书的参考文献和拓展阅读部分，是我认为其“学术骨架”的精髓所在。它提供的引文列表极其扎实，覆盖了从奠基性的开创性论文到近年来最具影响力的综述文章，跨度近半个世纪，显示了编著者对该领域历史脉络的精准把握。更棒的是，许多关键概念旁边都附带着简短的注释，指明了该理论或方法的原始出处及其核心贡献者，这对于希望进行深入钻研的研究人员来说，简直是节省了大量时间去“考古”源头文献的宝贵资源。我曾尝试顺着其中一个注释去查阅原始文献，发现作者的导读极其到位，能迅速抓住该论文的精髓。这本书真正做到了知识的传承与批判性思维的引导，它不只是告诉我们“是什么”，更引导我们去思考“为什么是这样”，以及“未来可能如何演变”，这种严谨的治学态度贯穿始终。
评分这本书的语言风格简直是一场“学术的冒险”，它完全没有传统教材那种干巴巴、公式堆砌的叙事腔调。作者似乎非常擅长讲故事，他不是在陈述事实，而是在引导读者亲身体验科学家是如何一步步揭开生命奥秘的过程。尤其是在介绍早期的一些经典实验时，那种对实验设计精妙之处的剖析，读起来酣畅淋漓，仿佛自己也身处那个实验室，与先驱者们一同进行着逻辑推理和数据解读。叙述的节奏掌握得非常好，复杂概念的引入总是循序渐进，先用类比打破思维定势，再逐步引入专业术语进行精确定义，确保读者不会在半路迷失方向。对我这样一个非科班出身但对交叉学科抱有浓厚兴趣的人来说，这种“带着走”的讲解方式极其友好，它平衡了严谨性与可读性，使得原本高不可攀的知识领域变得触手可及，让人由衷佩服作者深厚的学识和卓越的教学功力。
评分这本书的装帧设计实在令人眼前一亮，封面那种深邃的蓝与金色字体搭配，透着一股沉稳而又不失现代感的学究气质。拿到手里，厚实的纸张手感极佳，油墨的清晰度也无可挑剔，看得出出版社在制作上是下了真功夫的。翻开内页，你会发现它不仅仅是一本教科书，更像是一件精心制作的工艺品。页边距的留白恰到好处，不会让人觉得拥挤，即使是长时间阅读，眼睛也不会感到明显的疲劳。排版上，图表的插入位置极为考究，那些复杂的生物网络图和流程示意图，都用高分辨率的彩色印刷呈现出来，每一个节点和连线都清晰锐利，极大地降低了理解那些复杂模型的认知负荷。我想，对于那些对阅读体验有较高要求的读者来说，这本书的物理形态本身就是一种享受，它让人愿意去捧起它，而不是仅仅把它束之高阁。特别是初次接触这个领域的读者，这种高品质的视觉呈现，能迅速建立起对学科的敬畏感和亲近感，而不是被枯燥的文字劝退。
评分不求甚解，观其大略。
评分这也能叫一本书啊？！！！
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