Bioinformatics in the Post-Genomic Era

Bioinformatics in the Post-Genomic Era pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Nova Science Publishers
作者:Torshin, Ivan Y. (EDT)
出品人:
页数:255
译者:
出版时间:2007-01
价格:USD 89.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9781600210488
丛书系列:
图书标签:
  • 生物信息学
  • 基因组学
  • 后基因组时代
  • 计算生物学
  • 生物统计学
  • 系统生物学
  • 蛋白质组学
  • 代谢组学
  • NGS
  • 数据分析
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具体描述

《基因组时代的计算生物学》 欢迎来到基因组时代,一个由海量数据塑造的全新科学前沿。随着DNA测序技术的飞速发展,我们以前所未有的速度积累着生命体的遗传信息。然而,这些数据的真正价值并非仅仅在于它们的规模,更在于我们如何从中提取知识、理解生命运作的奥秘。《基因组时代的计算生物学》将带您深入探索这一引人入胜的领域,揭示计算方法在现代生物学研究中的核心作用。 本书旨在为读者构建一个坚实的理论基础和实践指南,帮助理解和应用计算工具来分析和解释日益增长的基因组学、转录组学、蛋白质组学以及其他“组学”数据。我们将从生物信息学的基石——序列比对和数据库搜索开始,详细介绍诸如BLAST、FASTA等经典算法的原理及其在基因识别、功能预测和进化分析中的应用。您将学习如何驾驭这些强大的工具,从庞大的基因序列数据库中快速有效地找到目标信息。 随后,我们将聚焦于基因组学的核心挑战:基因组组装与注释。从短读长测序到长读长测序,不同的测序策略带来了不同的挑战和解决方案。本书将深入剖析各种基因组组装算法,包括de Bruijn图方法和Overlap-Layout-Consensus方法,并探讨它们在构建完整基因组序列方面的优劣。同时,我们将详细讲解基因预测、功能注释、非编码RNA识别等关键步骤,揭示如何将杂乱的DNA序列转化为具有明确生物学意义的基因和调控元件。 在转录组学领域,本书将引导您理解如何利用RNA测序(RNA-Seq)数据来量化基因表达水平,识别差异表达基因,并揭示转录调控网络。您将学习到从原始测序数据预处理、比对到表达量计算、差异分析的完整流程,并了解如何利用多种统计学方法和可视化技术来解读复杂的数据模式。我们还将探讨转录本重构、可变剪接分析以及非编码RNA的功能研究,展现计算生物学在解析基因表达调控中的关键作用。 蛋白质组学是生命科学的另一大支柱。本书将介绍质谱(Mass Spectrometry)数据的处理和分析,包括肽段识别、蛋白质鉴定、定量分析以及翻译后修饰的识别。您将学习如何利用 Mascot、MaxQuant 等软件来处理海量的质谱数据,从中挖掘关于蛋白质丰度、相互作用和功能的信息。此外,我们还将探讨蛋白质结构预测、功能域分析以及蛋白质相互作用网络的构建,为理解生命活动的基础提供计算视角。 除了对各个“组学”技术进行深入介绍,本书还将强调这些技术如何整合,以提供更全面的生物学见解。您将学习如何将基因组、转录组和蛋白质组数据相结合,构建多维度调控网络,从而更深入地理解疾病的发生机制、药物的作用靶点以及生物系统的复杂性。我们还会探讨系统生物学(Systems Biology)的方法,强调通过计算模型来模拟和预测生物系统的行为。 本书的内容还涵盖了进化生物学和比较基因组学。您将学习如何利用同源性分析、系统发育树构建以及基因组共线性分析等方法,来研究物种间的进化关系、基因家族的演化以及基因组结构的变化。这些计算工具对于理解生命的起源、物种多样性的形成以及基因功能在进化过程中的保留和改变至关重要。 此外,本书还将涉及一些前沿的研究方向,如单细胞组学(Single-cell Genomics)、宏基因组学(Metagenomics)以及机器学习在生物信息学中的应用。您将了解到如何利用这些新兴技术和方法来分析单个细胞的遗传和表达特征,探索复杂的微生物群落,以及如何利用机器学习算法从海量生物数据中发现隐藏的模式和预测生物学事件。 《基因组时代的计算生物学》不仅是一本技术手册,更是一本引导您思考和创新的指南。我们鼓励读者积极动手实践,掌握相关的编程语言(如Python、R)和常用生物信息学软件,并学会如何独立地设计和执行生物信息学分析项目。本书中的案例研究和练习将帮助您将理论知识转化为实际技能,自信地应对基因组时代带来的挑战。 无论您是生物学、计算机科学、统计学还是医学领域的学生、研究人员,甚至是任何对生命科学充满好奇的个体,《基因组时代的计算生物学》都将是您探索基因组时代无限可能的宝贵伙伴。让我们一起,用计算的力量,解锁生命的密码,推动科学的进步。

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目录信息

读后感

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用户评价

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《Bioinformatics in the Post-Genomic Era》这个书名,在浩瀚的学术海洋中,如同一个闪烁的灯塔,指引着我想要探索的方向。我能想象,这本书绝非仅仅是对现有生物信息学工具的简单罗列,而是对这个快速演进领域未来走向的一次深刻洞察。在基因组信息已经不再是稀缺资源的今天,生物信息学所承担的使命显然更加艰巨和复杂。我期待它能够引领我深入了解如何从庞杂的“组学”数据中提炼出真正有价值的生物学信息,例如,在进行大规模人群基因组关联研究时,如何有效地过滤掉噪音,找出与特定性状或疾病真正相关的基因变异?我又很好奇,这本书是否会探讨那些能够帮助我们理解复杂生物通路和网络动力学的计算模型?例如,如何利用生物信息学来预测蛋白质-蛋白质相互作用,或者模拟细胞信号传导过程,从而帮助我们更深入地理解生命活动的精妙之处。它的标题“Post-Genomic Era”给我一种强烈的信号,即这本书将不再局限于基因序列本身,而是会拓展到更广泛的生物学层面,例如,如何利用生物信息学来解析表观遗传学的调控机制,或者理解微生物组与宿主健康的复杂关系。我感觉这本书将是一场思维的盛宴,它将激发我以更具前瞻性、更系统性的方式来思考生物学研究的未来,尤其是在利用计算能力来解决那些曾经看似无解的生物学难题方面。

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当我第一次看到《Bioinformatics in the Post-Genomic Era》这本书名时,脑海中立刻浮现出那些前沿的研究场景。这不只是一本技术手册,更像是一次思维的远征,带领读者穿越基因组学辉煌过后的广阔领域。我猜想,这本书的核心不在于陈述已有的事实,而在于揭示如何提出新的问题,以及如何构建解决这些新问题的框架。在基因组测序成本急剧下降的今天,数据量呈现指数级增长,如何有效地处理、分析和解读这些数据,已成为生物学研究的瓶颈。我期待这本书能够深入探讨那些能够应对这一挑战的先进计算方法和算法。例如,在处理单细胞测序数据时,如何准确地识别细胞类型、追踪细胞命运,以及理解细胞间的通讯机制?或者在进行群体基因组学研究时,如何区分适应性进化与遗传漂移,如何追踪物种的演化历史?我尤其对那些能够从噪音中提炼信号,从复杂关联中发现因果关系的方法论感兴趣。这本书的标题“Post-Genomic Era”暗示着一种范式的转变,从关注“是什么”转向关注“为什么”和“如何”。这让我相信,它将不仅仅是关于生物信息学工具的使用,更是关于如何运用这些工具来推动生物学研究的边界,可能还会涉及一些关于数据可视化和信息传递的创新方法,以便让复杂的生物学发现更容易被理解和应用。

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毫不夸张地说,《Bioinformatics in the Post-Genomic Era》这个书名在我脑海中激起了层层涟漪,仿佛在预告一场关于生命科学未来发展的精彩篇章。我迫不及待地想知道,在这个基因组信息爆炸后的新时代,生物信息学将如何重塑我们的研究方式和认知边界。这本书可能不像一本教科书那样循规蹈矩,而更像是一次充满启发性的对话,与那些站在生物信息学前沿的思考者对话。我猜想,它会深入探讨如何将海量的基因组数据转化为可操作的生物学见解,特别是那些与人类健康息息相关的应用。例如,在肿瘤研究领域,我们如何利用个体基因组信息来设计个性化的治疗方案?或者在传染病防控方面,如何通过快速基因组测序和分析来追踪病毒的变异和传播,并预测未来的流行趋势?我尤其期待书中能提及那些能够实现跨物种、跨领域数据整合和分析的新方法,因为生物系统的复杂性往往需要我们跳出单一学科的视角。这个“Post-Genomic Era”的定位,让我感觉这本书将更加强调对大数据背后生物学意义的解读,以及如何利用计算的力量来发现那些隐藏在数据深处的生命规律,或许还会涉及一些关于伦理、社会影响以及数据共享的最佳实践的讨论,使得它不仅是一本技术指南,更是一份对未来生物学研究的深刻思考。

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这本《Bioinformatics in the Post-Genomic Era》仿佛是一扇通往全新生物信息学世界的大门,即便我尚未深入其中细读,单凭其标题就足以激发起我强烈的探索欲。在基因组学时代已经成为过去式,我们站在了一个信息爆炸的新起点上,生物信息学早已不再是简单的序列比对和数据库查询。它已经演变成一门跨学科的艺术,融合了计算机科学、统计学、数学以及生物学的深刻理解。我设想这本书将引领我探索如何驾驭海量基因组数据,如何从中挖掘出隐藏的生命奥秘。比如,在后基因组时代,我们不再仅仅满足于知道基因的序列,而是更加关注基因的功能、调控机制,以及它们在复杂生物过程中的相互作用。这本书会不会深入探讨如何利用机器学习和人工智能来预测基因功能,或者如何解析复杂的基因网络?我特别期待它能阐释如何在庞大的“组学”数据(如转录组学、蛋白质组学、代谢组学)之间建立有效的联系,从而构建更加全面的生物学模型。想象一下,能够模拟细胞内部的动态变化,预测疾病的发生机制,甚至设计出靶向性更强的药物,这该是多么令人兴奋的未来!这本书的标题暗示着它将目光投向未来,这正是吸引我的关键所在,它承诺的不仅仅是知识的传递,更是对未来生物学研究方向的启迪。

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《Bioinformatics in the Post-Genomic Era》这个名字本身就散发着一种面向未来的气息,让我对其中蕴含的知识充满好奇。我设想这本书的作者们一定对当前生物学研究的脉搏有着深刻的洞察,他们看到了基因组时代留下的宝贵遗产,同时也预见了前方未知的挑战与机遇。我推测,这本书将不会仅仅停留在对现有生物信息学技术的罗列,而是会引导读者去思考,在海量的“组学”数据浪潮中,我们究竟需要什么样的分析工具和策略才能真正地驾驭它们。例如,在理解复杂疾病的发病机制时,我们如何整合基因组、转录组、蛋白质组乃至肠道菌群等多种数据源,构建一个多层次的疾病模型?我特别感兴趣的是,这本书是否会探讨如何利用生物信息学来加速新药研发,如何通过精准预测药物的疗效和副作用来提高临床试验的成功率。它可能还会深入到计算生物学的一些前沿领域,比如分子动力学模拟,用来理解蛋白质的折叠和功能,或者利用生物信息学来设计新的蛋白质和酶。这本书的标题中“Post-Genomic Era”的提法,让我感觉它是在为我们勾勒一个更加宏大、更加智能化的生物学研究蓝图,鼓励我们跳出固有的思维模式,用全新的视角去审视生命科学的未来。

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