第一部分 日軍攻占南京
一 日軍刺探南京情況並轟炸南京
二 日軍攻占南京城
三 中國軍隊的南京保衛戰及其敗退
第二部分 日軍在南京的血腥暴行
一 南京安全區國際委員會對日軍暴行的抗議
二 全陵大學非常委員會對日軍暴行的抗議
三 南京安全區檔案中關於南京大屠殺的記載
四 德國駐華使館有關南京大屠殺的文件
五 四伯烈《外人目睹中之日軍暴行》（節錄）
六 中外新聞媒介關於南京大屠殺的報道
七 中國軍民南京大屠殺親曆記
八 慈善機關掩埋屍體和救濟難民情況
九 南京僞組織收屍概況
十 郭沫若等關於南京大屠殺的揭露與調查
十一 日文檔案中有關日軍在南京暴行和收屍情況的記載
第三部分 抗戰勝利前後對日軍南京大屠殺罪行的調查與揭露
一 1943－1944年國民政府敵人罪行調查委員會的調查
二 南京市臨時參議會的調查
三 南京地方法院的調查
四 南京市政府及其所屬機構的調查
五 國民政府各部門的調查
六 報刊的揭露控訴
第四部分 中國和國際軍事法庭對日軍南京大屠殺案戰犯的審判
一 國民政府國防部軍事法庭開庭審判
二 被害人、知情人的控告和證人證詞
三 國民政府國防部軍事法庭對南京大屠殺主犯榖壽夫等的審判
四 東京遠東國際軍事法庭對日軍南京大屠殺案的審判
第五部分 中華人民共和國成立後對日軍南京大屠殺罪行的調查和資料控集
一 戰犯太田壽男等的供詞
二 南京大學曆史係的調查
三 南京市政協文史資料研究委員會的調查
四 南京市“南京大屠殺”史料編輯委員會的調查
五 侵華日軍南京大屠殺紀念館的調查
六 八十年代以來報刊發錶的證言
七 日本官兵和隨軍記者關於南京大屠殺的日記、目睹記
八 喬治・費奇自傳《我在中國八十年》（摘譯）
九 貝德士文獻有關南京大屠殺資料
附 錄：
南京淪陷前後的人日資料
年代對照錶
· · · · · · (收起)